FuNGI

A0A5N5PNV4

Protein Details

Accession

A0A5N5PNV4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
132-156	STDGEARKGRKGKKGRNHDKEGDAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
120-149	EKRRRSPSRTPRSTDGEARKGRKGKKGRNH

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSQTPFSYAQAAKGQTTPQTTPQPTTSPAPPSVSSQGKDDATTTSTAATVLSTTSAEIDLNDSAKQSKTDDEPVSRKPQTETPLPEPTTASRRVSNTTSNVATNGVSAPAEPAKSAATEEKRRRSPSRTPRSTDGEARKGRKGKKGRNHDKEGDADKAQDDKEDKEPAKAPVILSEAPIPSVNIWHKRKEAHAAKAKAPASGSQNAAPAHAAQVDDSKKRTSAEEDDTQTGTQNGTNGEKAQQRKSVDSSRLAEQLPRRSAPRGSRAPEKDEKSGAESLPPVADAALWPDVKSAVAADEGKKPQEKAERVEKDTQDGTAPSKRNKKEWVAIPYVPTVNFQTQLPQRSSKPRGGARGGREAGTTRAANTNSSNASGAPVTTPTADKTQSTTNTGPAKDGRPREGSGSARANSLPPSASKRASIDANLVRDARKPSAPASTDRPRDPALDSQSQSGAAKAENGRVGRRDSNPPSSEQQSQFASRNLPDRRGEAGFKGYEGFKDAGISAPKEQNLAARERSEGQGRGRGGYRGRGGHNASVSGAHQQNGFVPNGQYAVHPIPGRQNGPYSPPAQQNTFGNAYPGGSSRGGGRGSGRGGSGSANYSRVNSNGAGPGRMAPVNTGNVPYDFSMPQYGAYPPMPPVPVYDNGAISLLTAQIEYYFSMENLIKDTWLRRNMDSQGFVPFDLIAGFTRVSEMAPDAEHVRIACEVSDKLDYVYGEDGVERLRVRDQWNSWVYPLEQRLEKAQNDGPRSIIFRSRHSSQQYPPAAPMMPVGYPATSPTMFPGNFPPEEQMYPQPYMNGAHYDAGMNGGDMVNGHRYAPETQLSAAVPEFAPSGVQVGGVQQPPFTLEGATTFSDERVEDLMVVVTDDKKEASASSGPPEAAVVNGTNGADSTPAEVKSPKNIVWAENQTLSLGPNQVEVRYVDLRKKAFEKRAAKAGEASRDMQNLYNFWAHFLVHDFNATMYDEFRSCALEDARAKENPAAVSDYGLKYLLQFYNEMLHGDMPKPWGKDRPVPEIINLHHQGALEAKHSYRANSETRM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.37
4	0.36
5	0.37
6	0.44
7	0.46
8	0.48
9	0.49
10	0.48
11	0.46
12	0.48
13	0.46
14	0.42
15	0.42
16	0.43
17	0.4
18	0.41
19	0.45
20	0.46
21	0.42
22	0.4
23	0.42
24	0.38
25	0.38
26	0.33
27	0.28
28	0.24
29	0.24
30	0.2
31	0.15
32	0.14
33	0.13
34	0.12
35	0.1
36	0.08
37	0.07
38	0.08
39	0.07
40	0.07
41	0.08
42	0.09
43	0.09
44	0.08
45	0.11
46	0.12
47	0.13
48	0.13
49	0.13
50	0.15
51	0.17
52	0.18
53	0.17
54	0.2
55	0.24
56	0.32
57	0.37
58	0.43
59	0.47
60	0.52
61	0.6
62	0.58
63	0.55
64	0.51
65	0.51
66	0.49
67	0.52
68	0.53
69	0.51
70	0.58
71	0.57
72	0.55
73	0.5
74	0.49
75	0.47
76	0.44
77	0.41
78	0.37
79	0.38
80	0.42
81	0.43
82	0.45
83	0.43
84	0.44
85	0.43
86	0.38
87	0.36
88	0.32
89	0.28
90	0.22
91	0.18
92	0.13
93	0.11
94	0.1
95	0.12
96	0.13
97	0.14
98	0.12
99	0.13
100	0.13
101	0.13
102	0.16
103	0.21
104	0.27
105	0.37
106	0.46
107	0.55
108	0.62
109	0.69
110	0.74
111	0.73
112	0.75
113	0.76
114	0.79
115	0.78
116	0.77
117	0.77
118	0.78
119	0.76
120	0.75
121	0.73
122	0.71
123	0.7
124	0.68
125	0.69
126	0.69
127	0.7
128	0.71
129	0.73
130	0.73
131	0.76
132	0.82
133	0.85
134	0.87
135	0.9
136	0.86
137	0.81
138	0.78
139	0.72
140	0.65
141	0.55
142	0.46
143	0.39
144	0.36
145	0.3
146	0.27
147	0.25
148	0.23
149	0.27
150	0.35
151	0.34
152	0.35
153	0.39
154	0.37
155	0.4
156	0.39
157	0.34
158	0.29
159	0.33
160	0.28
161	0.25
162	0.26
163	0.21
164	0.2
165	0.2
166	0.16
167	0.12
168	0.18
169	0.23
170	0.3
171	0.33
172	0.38
173	0.41
174	0.44
175	0.48
176	0.53
177	0.54
178	0.55
179	0.61
180	0.6
181	0.6
182	0.65
183	0.62
184	0.53
185	0.46
186	0.39
187	0.35
188	0.35
189	0.33
190	0.27
191	0.3
192	0.28
193	0.28
194	0.24
195	0.19
196	0.16
197	0.15
198	0.13
199	0.09
200	0.16
201	0.2
202	0.23
203	0.25
204	0.25
205	0.25
206	0.26
207	0.28
208	0.27
209	0.3
210	0.33
211	0.38
212	0.4
213	0.41
214	0.41
215	0.39
216	0.34
217	0.28
218	0.21
219	0.15
220	0.13
221	0.12
222	0.13
223	0.15
224	0.15
225	0.2
226	0.25
227	0.29
228	0.33
229	0.36
230	0.37
231	0.4
232	0.45
233	0.48
234	0.47
235	0.48
236	0.46
237	0.44
238	0.45
239	0.41
240	0.4
241	0.38
242	0.42
243	0.4
244	0.39
245	0.38
246	0.38
247	0.43
248	0.46
249	0.49
250	0.49
251	0.49
252	0.57
253	0.58
254	0.62
255	0.64
256	0.62
257	0.56
258	0.51
259	0.47
260	0.42
261	0.41
262	0.33
263	0.27
264	0.23
265	0.2
266	0.17
267	0.16
268	0.12
269	0.08
270	0.08
271	0.06
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.09
281	0.05
282	0.08
283	0.1
284	0.11
285	0.18
286	0.2
287	0.23
288	0.25
289	0.24
290	0.28
291	0.35
292	0.37
293	0.37
294	0.46
295	0.5
296	0.53
297	0.6
298	0.55
299	0.5
300	0.46
301	0.41
302	0.32
303	0.26
304	0.25
305	0.24
306	0.28
307	0.31
308	0.4
309	0.42
310	0.46
311	0.51
312	0.54
313	0.55
314	0.59
315	0.59
316	0.56
317	0.54
318	0.51
319	0.47
320	0.42
321	0.34
322	0.27
323	0.23
324	0.18
325	0.18
326	0.15
327	0.2
328	0.23
329	0.27
330	0.29
331	0.3
332	0.33
333	0.41
334	0.46
335	0.44
336	0.47
337	0.47
338	0.51
339	0.54
340	0.56
341	0.51
342	0.55
343	0.51
344	0.44
345	0.4
346	0.35
347	0.3
348	0.27
349	0.23
350	0.15
351	0.18
352	0.18
353	0.19
354	0.19
355	0.2
356	0.17
357	0.18
358	0.17
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.12
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.19
374	0.2
375	0.25
376	0.25
377	0.28
378	0.32
379	0.32
380	0.31
381	0.28
382	0.31
383	0.32
384	0.34
385	0.33
386	0.32
387	0.33
388	0.34
389	0.36
390	0.34
391	0.33
392	0.35
393	0.31
394	0.28
395	0.28
396	0.25
397	0.21
398	0.2
399	0.15
400	0.11
401	0.17
402	0.2
403	0.21
404	0.21
405	0.22
406	0.23
407	0.24
408	0.23
409	0.22
410	0.23
411	0.23
412	0.23
413	0.23
414	0.21
415	0.23
416	0.25
417	0.21
418	0.19
419	0.18
420	0.18
421	0.24
422	0.25
423	0.25
424	0.3
425	0.36
426	0.39
427	0.38
428	0.4
429	0.34
430	0.34
431	0.34
432	0.32
433	0.29
434	0.31
435	0.31
436	0.29
437	0.28
438	0.27
439	0.24
440	0.19
441	0.14
442	0.08
443	0.11
444	0.1
445	0.12
446	0.15
447	0.15
448	0.16
449	0.18
450	0.21
451	0.22
452	0.25
453	0.31
454	0.32
455	0.39
456	0.39
457	0.4
458	0.4
459	0.4
460	0.42
461	0.35
462	0.33
463	0.27
464	0.29
465	0.28
466	0.25
467	0.24
468	0.2
469	0.27
470	0.26
471	0.28
472	0.26
473	0.26
474	0.28
475	0.28
476	0.28
477	0.21
478	0.22
479	0.18
480	0.17
481	0.16
482	0.13
483	0.11
484	0.13
485	0.12
486	0.08
487	0.09
488	0.09
489	0.1
490	0.11
491	0.12
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.14
498	0.15
499	0.17
500	0.17
501	0.15
502	0.16
503	0.17
504	0.19
505	0.18
506	0.19
507	0.17
508	0.21
509	0.2
510	0.21
511	0.2
512	0.21
513	0.19
514	0.21
515	0.23
516	0.21
517	0.22
518	0.25
519	0.26
520	0.25
521	0.25
522	0.21
523	0.18
524	0.15
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.13
532	0.14
533	0.14
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.11
539	0.08
540	0.09
541	0.1
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.17
546	0.2
547	0.21
548	0.19
549	0.2
550	0.18
551	0.22
552	0.24
553	0.21
554	0.22
555	0.26
556	0.27
557	0.27
558	0.28
559	0.25
560	0.26
561	0.26
562	0.22
563	0.17
564	0.15
565	0.14
566	0.13
567	0.12
568	0.11
569	0.09
570	0.09
571	0.09
572	0.12
573	0.12
574	0.12
575	0.12
576	0.12
577	0.13
578	0.14
579	0.13
580	0.1
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.09
585	0.09
586	0.1
587	0.11
588	0.12
589	0.12
590	0.12
591	0.13
592	0.12
593	0.12
594	0.15
595	0.15
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.14
600	0.14
601	0.13
602	0.09
603	0.11
604	0.12
605	0.12
606	0.12
607	0.11
608	0.11
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.11
613	0.11
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.1
619	0.1
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.13
624	0.13
625	0.12
626	0.14
627	0.15
628	0.16
629	0.18
630	0.18
631	0.16
632	0.16
633	0.16
634	0.14
635	0.1
636	0.09
637	0.06
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.08
648	0.09
649	0.09
650	0.11
651	0.11
652	0.1
653	0.11
654	0.15
655	0.19
656	0.24
657	0.26
658	0.25
659	0.3
660	0.35
661	0.38
662	0.37
663	0.31
664	0.3
665	0.28
666	0.26
667	0.21
668	0.16
669	0.12
670	0.1
671	0.1
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.07
677	0.07
678	0.07
679	0.06
680	0.07
681	0.06
682	0.06
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.08
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.1
698	0.12
699	0.12
700	0.11
701	0.12
702	0.1
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.07
707	0.1
708	0.08
709	0.09
710	0.1
711	0.14
712	0.17
713	0.24
714	0.25
715	0.32
716	0.36
717	0.36
718	0.34
719	0.33
720	0.31
721	0.3
722	0.3
723	0.25
724	0.23
725	0.23
726	0.28
727	0.31
728	0.31
729	0.3
730	0.31
731	0.34
732	0.36
733	0.35
734	0.31
735	0.27
736	0.29
737	0.26
738	0.3
739	0.26
740	0.28
741	0.34
742	0.36
743	0.41
744	0.45
745	0.48
746	0.44
747	0.52
748	0.51
749	0.46
750	0.44
751	0.39
752	0.33
753	0.28
754	0.25
755	0.17
756	0.12
757	0.13
758	0.12
759	0.1
760	0.1
761	0.11
762	0.13
763	0.12
764	0.12
765	0.12
766	0.18
767	0.17
768	0.19
769	0.24
770	0.25
771	0.26
772	0.26
773	0.27
774	0.24
775	0.25
776	0.27
777	0.26
778	0.25
779	0.27
780	0.26
781	0.24
782	0.22
783	0.23
784	0.22
785	0.18
786	0.16
787	0.14
788	0.15
789	0.14
790	0.13
791	0.13
792	0.11
793	0.08
794	0.07
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.07
799	0.09
800	0.09
801	0.09
802	0.09
803	0.12
804	0.14
805	0.17
806	0.17
807	0.16
808	0.16
809	0.18
810	0.18
811	0.17
812	0.15
813	0.13
814	0.11
815	0.1
816	0.1
817	0.08
818	0.08
819	0.06
820	0.08
821	0.06
822	0.07
823	0.06
824	0.08
825	0.12
826	0.15
827	0.15
828	0.13
829	0.13
830	0.15
831	0.16
832	0.14
833	0.1
834	0.07
835	0.09
836	0.12
837	0.13
838	0.13
839	0.12
840	0.12
841	0.13
842	0.13
843	0.13
844	0.11
845	0.11
846	0.09
847	0.09
848	0.1
849	0.08
850	0.09
851	0.09
852	0.08
853	0.08
854	0.09
855	0.09
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.12
860	0.15
861	0.17
862	0.2
863	0.22
864	0.21
865	0.21
866	0.21
867	0.17
868	0.13
869	0.13
870	0.09
871	0.08
872	0.09
873	0.09
874	0.08
875	0.08
876	0.08
877	0.07
878	0.07
879	0.1
880	0.12
881	0.12
882	0.14
883	0.17
884	0.19
885	0.26
886	0.3
887	0.28
888	0.31
889	0.33
890	0.33
891	0.39
892	0.43
893	0.4
894	0.38
895	0.37
896	0.31
897	0.29
898	0.28
899	0.22
900	0.18
901	0.14
902	0.16
903	0.17
904	0.17
905	0.18
906	0.18
907	0.21
908	0.25
909	0.28
910	0.3
911	0.35
912	0.37
913	0.4
914	0.47
915	0.51
916	0.53
917	0.6
918	0.62
919	0.61
920	0.69
921	0.66
922	0.6
923	0.58
924	0.55
925	0.53
926	0.48
927	0.45
928	0.39
929	0.39
930	0.38
931	0.35
932	0.31
933	0.25
934	0.25
935	0.27
936	0.24
937	0.24
938	0.24
939	0.19
940	0.18
941	0.21
942	0.2
943	0.16
944	0.18
945	0.16
946	0.15
947	0.16
948	0.17
949	0.13
950	0.12
951	0.14
952	0.13
953	0.13
954	0.14
955	0.14
956	0.13
957	0.18
958	0.18
959	0.23
960	0.27
961	0.31
962	0.36
963	0.35
964	0.36
965	0.34
966	0.36
967	0.3
968	0.28
969	0.28
970	0.22
971	0.24
972	0.27
973	0.25
974	0.23
975	0.22
976	0.2
977	0.17
978	0.23
979	0.22
980	0.18
981	0.18
982	0.18
983	0.23
984	0.24
985	0.24
986	0.19
987	0.19
988	0.2
989	0.21
990	0.22
991	0.21
992	0.26
993	0.28
994	0.31
995	0.37
996	0.41
997	0.49
998	0.53
999	0.57
1000	0.6
1001	0.58
1002	0.59
1003	0.58
1004	0.54
1005	0.55
1006	0.51
1007	0.43
1008	0.37
1009	0.35
1010	0.31
1011	0.28
1012	0.27
1013	0.2
1014	0.2
1015	0.2
1016	0.25
1017	0.27
1018	0.28
1019	0.29
1020	0.32

A0A5N5PNV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer