Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBN5

Protein Details
Accession C5DBN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-250SSGLRRSKRYQRLRSKGAEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-246RRSKRYQRLRSK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005036  CBM21_dom  
IPR038175  CBM21_dom_sf  
KEGG lth:KLTH0A04092g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03370  CBM_21  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51159  CBM21  
Amino Acid Sequences MYIRRPPSDTNGDVMNRSLAFLHKPQRVSQPKPFAEESLRRNTDLNRGKVQVNEMHDDYFSSQTPASADGSVAGDVSSQLRVNPYFPANENYYYNSSGDGDDADNEPPPLVRKKSGEVVRSNLKLAQRSRSLPATPSGREPDKRIGAPPPGPQRSKSVHFDQRDVVKFKYFWQEDSPLDVASQDVLEGPLDEDPHTLTLQADAAVRSDGSDAEPRDLTMTMSNLQIEKRMSSGLRRSKRYQRLRSKGAEKDGATKPGLYRENFATLSDDDQSSLKSNIFLNIAHNSYCFLQDLSLIADQHYLVGHVLVKNIFYDKEVVVRYTRDHWRTVHEVECVWESSGDDVLPGMGMDRFKLVIDLATLGDDGGAAPRAPRAGPAAAFALVKLEFCIRYTTRSSHERVEHWDNNGGRNYVVDVVCAAQRMGFTDPFGPPH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.33
3 0.25
4 0.23
5 0.22
6 0.18
7 0.2
8 0.27
9 0.34
10 0.37
11 0.39
12 0.43
13 0.53
14 0.6
15 0.63
16 0.66
17 0.68
18 0.65
19 0.69
20 0.66
21 0.6
22 0.59
23 0.59
24 0.55
25 0.55
26 0.55
27 0.5
28 0.5
29 0.49
30 0.5
31 0.52
32 0.51
33 0.46
34 0.47
35 0.48
36 0.48
37 0.5
38 0.46
39 0.41
40 0.41
41 0.36
42 0.33
43 0.31
44 0.3
45 0.27
46 0.24
47 0.2
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.18
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.26
75 0.26
76 0.28
77 0.29
78 0.29
79 0.3
80 0.29
81 0.27
82 0.23
83 0.2
84 0.18
85 0.16
86 0.14
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.13
96 0.18
97 0.2
98 0.24
99 0.26
100 0.3
101 0.39
102 0.45
103 0.47
104 0.45
105 0.47
106 0.5
107 0.49
108 0.46
109 0.41
110 0.38
111 0.38
112 0.36
113 0.38
114 0.35
115 0.37
116 0.39
117 0.4
118 0.38
119 0.34
120 0.37
121 0.35
122 0.31
123 0.33
124 0.34
125 0.35
126 0.36
127 0.39
128 0.41
129 0.4
130 0.4
131 0.38
132 0.38
133 0.38
134 0.4
135 0.42
136 0.45
137 0.46
138 0.47
139 0.46
140 0.47
141 0.47
142 0.48
143 0.47
144 0.46
145 0.47
146 0.48
147 0.49
148 0.47
149 0.49
150 0.49
151 0.47
152 0.4
153 0.34
154 0.32
155 0.33
156 0.38
157 0.31
158 0.28
159 0.29
160 0.32
161 0.29
162 0.33
163 0.31
164 0.21
165 0.2
166 0.18
167 0.14
168 0.1
169 0.09
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.14
219 0.23
220 0.3
221 0.36
222 0.41
223 0.47
224 0.56
225 0.66
226 0.72
227 0.74
228 0.76
229 0.78
230 0.79
231 0.81
232 0.78
233 0.73
234 0.67
235 0.62
236 0.52
237 0.51
238 0.46
239 0.42
240 0.34
241 0.3
242 0.26
243 0.28
244 0.31
245 0.24
246 0.24
247 0.23
248 0.27
249 0.26
250 0.26
251 0.21
252 0.17
253 0.18
254 0.17
255 0.15
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.12
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.07
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.12
301 0.11
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.18
306 0.19
307 0.21
308 0.25
309 0.33
310 0.31
311 0.34
312 0.34
313 0.38
314 0.43
315 0.44
316 0.41
317 0.34
318 0.31
319 0.3
320 0.3
321 0.25
322 0.19
323 0.16
324 0.13
325 0.12
326 0.13
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.14
361 0.16
362 0.17
363 0.19
364 0.19
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.16
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.13
375 0.2
376 0.18
377 0.23
378 0.28
379 0.32
380 0.36
381 0.42
382 0.45
383 0.47
384 0.51
385 0.5
386 0.53
387 0.59
388 0.57
389 0.54
390 0.58
391 0.51
392 0.51
393 0.52
394 0.44
395 0.34
396 0.3
397 0.29
398 0.27
399 0.25
400 0.19
401 0.16
402 0.17
403 0.18
404 0.18
405 0.15
406 0.1
407 0.11
408 0.13
409 0.17
410 0.16
411 0.17
412 0.21