Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E231

Protein Details
Accession C5E231    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37KPSLKFKPKALARRSKEEREASHydrophilic
40-71KPAPEEIKKPFNNKKKYSKRENGPNGQRRIPKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-68PSLKFKPKALARRSKEEREASVPKPAPEEIKKPFNNKKKYSKRENGPNGQRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG lth:KLTH0H01738g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSGTGRLPTLSQGNAKPSLKFKPKALARRSKEEREASVPKPAPEEIKKPFNNKKKYSKRENGPNGQRRIPKYLLNTRVVNAGFGAENFTGGGGDMRTGFIKTEGSNHDYLQKGLKAANEGDEGLDSEGEGATKINMGREYKSSELYASEEEDEDESSSADIDEEALQSKRLARFFPVRALRVKHDEVELVKKEIQDTMSDPTTRDPTPGLPKLEDPQDGGQGLQEVLNNRSLELQDKLNDLRLQNEFASVDSGEAMQEVALLNQDYRHIQKKIIKINNQPGKFMFFQLPAVLPDFEEPKPPAPDAVEEPTVKPENEDEKTEEPTKESQDSSKKPEDSAKKPEPETIQEPKPLAGRIGSLRIHKSGRLSVKIGNVEMDVSRGAENTFLQEVVALDEREEERTVELLGQIVGKAVVTPKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.43
4 0.44
5 0.51
6 0.54
7 0.55
8 0.54
9 0.56
10 0.63
11 0.7
12 0.75
13 0.75
14 0.73
15 0.79
16 0.83
17 0.81
18 0.81
19 0.77
20 0.72
21 0.7
22 0.7
23 0.61
24 0.63
25 0.57
26 0.5
27 0.47
28 0.44
29 0.43
30 0.43
31 0.48
32 0.45
33 0.52
34 0.56
35 0.62
36 0.7
37 0.72
38 0.77
39 0.78
40 0.82
41 0.83
42 0.88
43 0.9
44 0.9
45 0.9
46 0.91
47 0.92
48 0.91
49 0.91
50 0.9
51 0.85
52 0.83
53 0.8
54 0.73
55 0.7
56 0.62
57 0.57
58 0.57
59 0.61
60 0.6
61 0.59
62 0.56
63 0.49
64 0.52
65 0.46
66 0.37
67 0.27
68 0.21
69 0.15
70 0.13
71 0.16
72 0.1
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.1
89 0.16
90 0.19
91 0.23
92 0.24
93 0.24
94 0.29
95 0.28
96 0.28
97 0.27
98 0.24
99 0.21
100 0.21
101 0.22
102 0.2
103 0.19
104 0.21
105 0.17
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.1
111 0.09
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.12
123 0.14
124 0.15
125 0.18
126 0.22
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.12
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.19
160 0.25
161 0.27
162 0.35
163 0.36
164 0.35
165 0.38
166 0.4
167 0.4
168 0.39
169 0.38
170 0.31
171 0.27
172 0.26
173 0.24
174 0.28
175 0.25
176 0.22
177 0.22
178 0.21
179 0.2
180 0.2
181 0.19
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.18
190 0.17
191 0.16
192 0.13
193 0.15
194 0.21
195 0.25
196 0.25
197 0.23
198 0.24
199 0.26
200 0.28
201 0.24
202 0.19
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.12
223 0.15
224 0.15
225 0.18
226 0.2
227 0.18
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.18
232 0.18
233 0.15
234 0.13
235 0.14
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.07
252 0.08
253 0.12
254 0.18
255 0.18
256 0.24
257 0.3
258 0.37
259 0.46
260 0.52
261 0.56
262 0.59
263 0.68
264 0.71
265 0.66
266 0.6
267 0.51
268 0.48
269 0.41
270 0.35
271 0.27
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.19
276 0.15
277 0.16
278 0.14
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.17
284 0.18
285 0.2
286 0.22
287 0.22
288 0.22
289 0.2
290 0.22
291 0.22
292 0.25
293 0.25
294 0.23
295 0.24
296 0.28
297 0.29
298 0.26
299 0.23
300 0.23
301 0.26
302 0.28
303 0.3
304 0.3
305 0.3
306 0.35
307 0.38
308 0.34
309 0.3
310 0.31
311 0.32
312 0.31
313 0.3
314 0.32
315 0.37
316 0.42
317 0.47
318 0.52
319 0.49
320 0.48
321 0.55
322 0.57
323 0.55
324 0.6
325 0.61
326 0.6
327 0.6
328 0.63
329 0.59
330 0.57
331 0.56
332 0.54
333 0.5
334 0.48
335 0.47
336 0.43
337 0.42
338 0.36
339 0.3
340 0.23
341 0.22
342 0.21
343 0.26
344 0.28
345 0.3
346 0.32
347 0.36
348 0.37
349 0.36
350 0.37
351 0.39
352 0.43
353 0.43
354 0.42
355 0.42
356 0.46
357 0.47
358 0.43
359 0.36
360 0.29
361 0.26
362 0.23
363 0.2
364 0.13
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.14
378 0.17
379 0.14
380 0.13
381 0.17
382 0.18
383 0.2
384 0.21
385 0.18
386 0.16
387 0.16
388 0.17
389 0.14
390 0.14
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.09