Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNP6

Protein Details
Accession C5DNP6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-173APASAPAKSKRQTKRDKNADKIRYKYKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-171PAKSKRQTKRDKNADKIRYK
Subcellular Location(s) mito 16, E.R. 4, extr 3, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008506  SND2/TMEM208  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
KEGG lth:KLTH0G18810g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05620  TMEM208_SND2  
Amino Acid Sequences MAGKASKKQAHTNAAVLKRLYTVAGAILALAAVRLLLSGGSWFKLIAFHAPAAACVYMLEKGGRPKFDADGRVVREGMDLNQEGLTEWMFDIVYLSLFADVGHAVFNTSKFWYVMLLVPVYLGYKIKGAAGPMLGGMRNAQAPSAGAPASAPAKSKRQTKRDKNADKIRYKYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.58
3 0.49
4 0.42
5 0.35
6 0.32
7 0.25
8 0.17
9 0.13
10 0.09
11 0.1
12 0.08
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.03
19 0.02
20 0.02
21 0.02
22 0.02
23 0.02
24 0.03
25 0.05
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.09
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.16
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.21
53 0.24
54 0.27
55 0.27
56 0.24
57 0.27
58 0.29
59 0.29
60 0.27
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.15
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.17
140 0.25
141 0.32
142 0.42
143 0.5
144 0.58
145 0.68
146 0.76
147 0.84
148 0.87
149 0.91
150 0.92
151 0.93
152 0.93
153 0.91