Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMW3

Protein Details
Accession C5DMW3    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-125PSRAATPPAKATKRKKSTKAAGRTSTGTGKKRKRTPSSIKSITQFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-115TPPAKATKRKKSTKAAGRTSTGTGKKRKRT
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG lth:KLTH0G12166g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MNFDIVQRRLSLADDVVDSDSPMQEQDELPMTQIPGDSSANVLISTQVQSKLDEMELKKVMKKNLTQFAFESLGATESAPPSRAATPPAKATKRKKSTKAAGRTSTGTGKKRKRTPSSIKSITQFNTENYESLADNRRSRHVVSLLSGKKKKIKDIIDRLQVEDASGSPGPSKSHFSTYSPHEWSHILQLLKSKFPKCPPGQVEAVYKYVYGGAEKDNVWYSSQMPPSDPETQASQEFHYNAQQPMVFSLSQAVEEEFVDAESPALISESFGREQMKGPSFLDEQCISDTTDETGVELKIDEDVARAFRTRMLQPYWLREDVKMKEQPGVSGDKLMKSSSGAARPKEQRWLHLSYNGVDDATKNFPKSPTSTPEPRSGPQVLQRHTYRTPSGLAGRDQLIDLTQCSFNAVKSLISPLKSEVQVPATRTTTWNDKNHSRPQNYGALHQKVQLRLCGGIADSEIYSTLRSRQVVWRLQDFDLQDSEEETKYQLLELDFETVDSKVDLSTAPHHRLSVIKSPTSIASPGDLCDFEVSVKRNASVPPSLPLSAKNLRESLRAIGLKPARTRSEMAEQMGCASQHLIGENAQEQRQGLFDQFTHLVEQSPSLLEKVYTFEPLVLSELIDFLVQKDPFIDKIDDSTIKQWADQMGICLRSAAED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.14
8 0.12
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.14
14 0.17
15 0.16
16 0.18
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.11
32 0.13
33 0.15
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.26
41 0.24
42 0.29
43 0.33
44 0.35
45 0.4
46 0.43
47 0.48
48 0.48
49 0.53
50 0.55
51 0.6
52 0.6
53 0.57
54 0.53
55 0.52
56 0.47
57 0.39
58 0.31
59 0.21
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.18
70 0.19
71 0.23
72 0.26
73 0.29
74 0.36
75 0.45
76 0.5
77 0.57
78 0.65
79 0.71
80 0.76
81 0.82
82 0.83
83 0.84
84 0.87
85 0.88
86 0.88
87 0.87
88 0.82
89 0.76
90 0.7
91 0.63
92 0.61
93 0.59
94 0.56
95 0.56
96 0.6
97 0.66
98 0.71
99 0.78
100 0.79
101 0.82
102 0.85
103 0.85
104 0.87
105 0.85
106 0.81
107 0.73
108 0.71
109 0.61
110 0.56
111 0.48
112 0.39
113 0.38
114 0.34
115 0.31
116 0.25
117 0.25
118 0.19
119 0.21
120 0.28
121 0.27
122 0.3
123 0.32
124 0.36
125 0.38
126 0.39
127 0.41
128 0.36
129 0.33
130 0.32
131 0.4
132 0.41
133 0.48
134 0.51
135 0.49
136 0.52
137 0.53
138 0.57
139 0.56
140 0.58
141 0.6
142 0.67
143 0.72
144 0.74
145 0.72
146 0.66
147 0.6
148 0.5
149 0.39
150 0.29
151 0.2
152 0.14
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.21
160 0.19
161 0.25
162 0.27
163 0.28
164 0.32
165 0.37
166 0.42
167 0.4
168 0.37
169 0.33
170 0.33
171 0.31
172 0.32
173 0.3
174 0.23
175 0.21
176 0.27
177 0.28
178 0.32
179 0.37
180 0.34
181 0.34
182 0.39
183 0.48
184 0.44
185 0.52
186 0.5
187 0.49
188 0.5
189 0.48
190 0.49
191 0.41
192 0.39
193 0.3
194 0.26
195 0.21
196 0.19
197 0.15
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.19
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.21
214 0.25
215 0.29
216 0.27
217 0.22
218 0.22
219 0.23
220 0.24
221 0.23
222 0.2
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.2
227 0.21
228 0.19
229 0.2
230 0.19
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.13
235 0.1
236 0.12
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.04
253 0.03
254 0.04
255 0.05
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.19
263 0.2
264 0.19
265 0.19
266 0.21
267 0.22
268 0.21
269 0.23
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.12
297 0.14
298 0.18
299 0.19
300 0.26
301 0.27
302 0.32
303 0.34
304 0.34
305 0.33
306 0.3
307 0.34
308 0.28
309 0.33
310 0.31
311 0.27
312 0.29
313 0.28
314 0.27
315 0.23
316 0.24
317 0.17
318 0.18
319 0.18
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.14
324 0.11
325 0.14
326 0.13
327 0.2
328 0.22
329 0.23
330 0.3
331 0.34
332 0.35
333 0.42
334 0.39
335 0.36
336 0.38
337 0.42
338 0.37
339 0.36
340 0.35
341 0.27
342 0.28
343 0.24
344 0.19
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.22
355 0.24
356 0.25
357 0.31
358 0.37
359 0.39
360 0.45
361 0.46
362 0.43
363 0.43
364 0.39
365 0.34
366 0.35
367 0.39
368 0.34
369 0.37
370 0.38
371 0.38
372 0.38
373 0.39
374 0.33
375 0.27
376 0.27
377 0.23
378 0.26
379 0.23
380 0.22
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.14
386 0.11
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.09
393 0.1
394 0.09
395 0.11
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.21
405 0.21
406 0.21
407 0.18
408 0.2
409 0.21
410 0.23
411 0.25
412 0.22
413 0.22
414 0.23
415 0.24
416 0.28
417 0.34
418 0.37
419 0.39
420 0.44
421 0.5
422 0.59
423 0.65
424 0.59
425 0.55
426 0.54
427 0.56
428 0.5
429 0.5
430 0.48
431 0.43
432 0.41
433 0.43
434 0.42
435 0.38
436 0.38
437 0.34
438 0.27
439 0.23
440 0.22
441 0.18
442 0.15
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.11
453 0.13
454 0.14
455 0.17
456 0.23
457 0.31
458 0.37
459 0.4
460 0.43
461 0.43
462 0.43
463 0.45
464 0.39
465 0.32
466 0.27
467 0.24
468 0.18
469 0.16
470 0.17
471 0.13
472 0.13
473 0.11
474 0.11
475 0.1
476 0.11
477 0.11
478 0.09
479 0.11
480 0.11
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.13
485 0.11
486 0.11
487 0.09
488 0.09
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.08
493 0.15
494 0.21
495 0.26
496 0.26
497 0.26
498 0.27
499 0.3
500 0.33
501 0.35
502 0.34
503 0.31
504 0.31
505 0.32
506 0.32
507 0.31
508 0.27
509 0.18
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.16
514 0.15
515 0.13
516 0.13
517 0.12
518 0.11
519 0.15
520 0.17
521 0.19
522 0.2
523 0.2
524 0.22
525 0.24
526 0.27
527 0.27
528 0.26
529 0.26
530 0.28
531 0.29
532 0.27
533 0.27
534 0.3
535 0.32
536 0.34
537 0.34
538 0.34
539 0.35
540 0.37
541 0.37
542 0.33
543 0.35
544 0.33
545 0.3
546 0.34
547 0.37
548 0.41
549 0.43
550 0.46
551 0.41
552 0.43
553 0.45
554 0.41
555 0.46
556 0.44
557 0.43
558 0.39
559 0.35
560 0.34
561 0.34
562 0.28
563 0.19
564 0.16
565 0.13
566 0.12
567 0.13
568 0.12
569 0.11
570 0.13
571 0.17
572 0.2
573 0.2
574 0.2
575 0.2
576 0.19
577 0.2
578 0.19
579 0.16
580 0.15
581 0.14
582 0.18
583 0.2
584 0.2
585 0.2
586 0.19
587 0.2
588 0.17
589 0.18
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.13
594 0.13
595 0.12
596 0.12
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.17
604 0.19
605 0.15
606 0.13
607 0.11
608 0.11
609 0.1
610 0.1
611 0.09
612 0.08
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.17
617 0.19
618 0.21
619 0.26
620 0.26
621 0.19
622 0.24
623 0.3
624 0.3
625 0.31
626 0.32
627 0.34
628 0.32
629 0.31
630 0.3
631 0.26
632 0.27
633 0.25
634 0.26
635 0.26
636 0.27
637 0.26
638 0.24