Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DKB1

Protein Details
Accession C5DKB1    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43SSNVKVNQPKWRQPQEPEGAHydrophilic
685-710IMEKDQRQKEKEAKKKEQARLREAKEBasic
747-772VDITKSMLKKLKKQWEQQKKLHEEYFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
691-715RQKEKEAKKKEQARLREAKEAERRL
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015803  Cys-tRNA-ligase  
IPR024909  Cys-tRNA/MSH_ligase  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR032678  tRNA-synt_1_cat_dom  
IPR009080  tRNAsynth_Ia_anticodon-bd  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004817  F:cysteine-tRNA ligase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006423  P:cysteinyl-tRNA aminoacylation  
KEGG lth:KLTH0F03168g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01406  tRNA-synt_1e  
CDD cd00672  CysRS_core  
Amino Acid Sequences MYKCRTISKIWKTCERSVGMSATSSNVKVNQPKWRQPQEPEGAPRLKLYNSLTRQKEDFVTISGDKNVTWYSCGPTVYDSSHMGHARNYVSIDINRRILQDYFGYRIRFVQNVTDVDDKIILRARQSHLFERFAAENKEVTPLIQEKVNSALFAYIEANLKKSFSSIGEYKAWFSSLDISKEKEANPKFAMYTSAVSDCITALEGTNDAETFLGLVKEVLIPVLDKESGSTINEPEIFRKLPAFWEREFNKDMAALNVLEPSVTTRVSEYVPEIVDFVKRIIDNGYAYATGDGSVYFDTVAFDKSEKHDYAKCQPWNKGKLDLINDAEGSLSNFSSTNGKRSSNDFALWKSSKPGEPEWDSPWGKGRPGWHIECSVMACDVLGPNIDIHTGGIDLAFPHHDNEIAQSEAFYDNHQWVNYFLHTGHLHIEGQKMSKSLKNFITIGEALKKYSARQLRLAFSSAQWNSQLDFKEVLLVEVKSLEQSFNNFFRNARALKADLAHREDMGQHVSKKLGDKEKSLLTELAAFQDKVHNAFCDNLSTPVALKFLSELVTKANLYISSAGSDIRIEPLLEVVRYITKILEVIGFPSRDDHLGWLDEAGGQSQTGENREELLMPYVKCLSNFRDDVRRLAIDKASSTEFLKLTDRVRDNDILDLNVSIDDRSDQASLVKFLTNDEKEEYKKQIMEKDQRQKEKEAKKKEQARLREAKEAERRLKAQLSPNEMFRNSELYSVWDEEGLPLKDKDGVDITKSMLKKLKKQWEQQKKLHEEYFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.68
3 0.61
4 0.56
5 0.53
6 0.44
7 0.38
8 0.32
9 0.27
10 0.26
11 0.23
12 0.21
13 0.22
14 0.27
15 0.34
16 0.39
17 0.47
18 0.54
19 0.63
20 0.71
21 0.77
22 0.78
23 0.76
24 0.81
25 0.79
26 0.78
27 0.75
28 0.72
29 0.66
30 0.6
31 0.56
32 0.49
33 0.41
34 0.38
35 0.36
36 0.38
37 0.42
38 0.51
39 0.52
40 0.54
41 0.55
42 0.52
43 0.5
44 0.44
45 0.38
46 0.3
47 0.32
48 0.29
49 0.29
50 0.29
51 0.26
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.2
59 0.23
60 0.24
61 0.22
62 0.23
63 0.25
64 0.24
65 0.25
66 0.23
67 0.21
68 0.28
69 0.29
70 0.27
71 0.26
72 0.28
73 0.26
74 0.26
75 0.25
76 0.2
77 0.23
78 0.26
79 0.31
80 0.31
81 0.34
82 0.34
83 0.34
84 0.35
85 0.31
86 0.3
87 0.29
88 0.28
89 0.29
90 0.32
91 0.32
92 0.29
93 0.34
94 0.34
95 0.3
96 0.28
97 0.29
98 0.3
99 0.3
100 0.34
101 0.32
102 0.3
103 0.29
104 0.3
105 0.24
106 0.21
107 0.25
108 0.21
109 0.2
110 0.27
111 0.3
112 0.35
113 0.4
114 0.45
115 0.45
116 0.46
117 0.45
118 0.42
119 0.41
120 0.38
121 0.36
122 0.3
123 0.26
124 0.24
125 0.27
126 0.23
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.22
135 0.22
136 0.18
137 0.15
138 0.15
139 0.12
140 0.14
141 0.13
142 0.1
143 0.14
144 0.15
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.12
152 0.18
153 0.18
154 0.22
155 0.27
156 0.27
157 0.29
158 0.27
159 0.26
160 0.2
161 0.18
162 0.22
163 0.21
164 0.25
165 0.26
166 0.28
167 0.3
168 0.33
169 0.34
170 0.35
171 0.34
172 0.35
173 0.35
174 0.34
175 0.32
176 0.29
177 0.3
178 0.23
179 0.22
180 0.18
181 0.18
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.13
220 0.16
221 0.16
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.17
228 0.2
229 0.26
230 0.28
231 0.26
232 0.34
233 0.35
234 0.39
235 0.4
236 0.33
237 0.28
238 0.25
239 0.25
240 0.17
241 0.16
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.16
293 0.16
294 0.19
295 0.22
296 0.26
297 0.34
298 0.41
299 0.45
300 0.45
301 0.51
302 0.57
303 0.6
304 0.58
305 0.55
306 0.49
307 0.47
308 0.46
309 0.42
310 0.35
311 0.29
312 0.27
313 0.21
314 0.19
315 0.14
316 0.11
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.13
323 0.13
324 0.18
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.26
329 0.31
330 0.26
331 0.28
332 0.24
333 0.23
334 0.28
335 0.28
336 0.25
337 0.22
338 0.22
339 0.22
340 0.24
341 0.25
342 0.24
343 0.27
344 0.3
345 0.3
346 0.35
347 0.34
348 0.31
349 0.35
350 0.3
351 0.26
352 0.25
353 0.25
354 0.23
355 0.28
356 0.3
357 0.26
358 0.26
359 0.25
360 0.24
361 0.22
362 0.16
363 0.11
364 0.08
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.09
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.15
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.15
422 0.16
423 0.19
424 0.21
425 0.23
426 0.22
427 0.22
428 0.24
429 0.22
430 0.22
431 0.22
432 0.19
433 0.16
434 0.18
435 0.18
436 0.14
437 0.21
438 0.25
439 0.23
440 0.29
441 0.33
442 0.34
443 0.35
444 0.37
445 0.3
446 0.25
447 0.31
448 0.24
449 0.22
450 0.2
451 0.18
452 0.17
453 0.2
454 0.2
455 0.14
456 0.15
457 0.13
458 0.16
459 0.16
460 0.16
461 0.14
462 0.12
463 0.11
464 0.1
465 0.1
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.09
471 0.13
472 0.16
473 0.19
474 0.18
475 0.18
476 0.2
477 0.25
478 0.23
479 0.21
480 0.2
481 0.19
482 0.21
483 0.23
484 0.25
485 0.24
486 0.27
487 0.25
488 0.23
489 0.22
490 0.21
491 0.2
492 0.19
493 0.18
494 0.15
495 0.16
496 0.17
497 0.18
498 0.22
499 0.27
500 0.32
501 0.31
502 0.33
503 0.36
504 0.39
505 0.39
506 0.37
507 0.31
508 0.22
509 0.23
510 0.2
511 0.19
512 0.17
513 0.15
514 0.13
515 0.17
516 0.17
517 0.16
518 0.17
519 0.15
520 0.14
521 0.16
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.16
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.14
530 0.14
531 0.1
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.1
544 0.11
545 0.13
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.1
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.11
564 0.12
565 0.09
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.08
571 0.1
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.16
576 0.16
577 0.15
578 0.16
579 0.15
580 0.13
581 0.14
582 0.14
583 0.12
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.08
589 0.06
590 0.07
591 0.08
592 0.1
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.13
597 0.14
598 0.15
599 0.14
600 0.17
601 0.19
602 0.17
603 0.19
604 0.21
605 0.21
606 0.21
607 0.24
608 0.24
609 0.27
610 0.3
611 0.32
612 0.38
613 0.39
614 0.41
615 0.42
616 0.41
617 0.35
618 0.37
619 0.36
620 0.28
621 0.28
622 0.27
623 0.24
624 0.23
625 0.22
626 0.23
627 0.2
628 0.2
629 0.22
630 0.23
631 0.24
632 0.31
633 0.33
634 0.32
635 0.37
636 0.38
637 0.36
638 0.38
639 0.36
640 0.28
641 0.25
642 0.22
643 0.18
644 0.15
645 0.14
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.1
651 0.1
652 0.1
653 0.12
654 0.15
655 0.16
656 0.16
657 0.17
658 0.15
659 0.18
660 0.27
661 0.25
662 0.25
663 0.28
664 0.31
665 0.34
666 0.39
667 0.42
668 0.38
669 0.4
670 0.42
671 0.47
672 0.52
673 0.58
674 0.64
675 0.69
676 0.73
677 0.79
678 0.78
679 0.79
680 0.78
681 0.79
682 0.78
683 0.78
684 0.79
685 0.8
686 0.86
687 0.87
688 0.86
689 0.85
690 0.85
691 0.84
692 0.79
693 0.78
694 0.7
695 0.7
696 0.71
697 0.71
698 0.68
699 0.65
700 0.62
701 0.59
702 0.62
703 0.58
704 0.58
705 0.56
706 0.58
707 0.54
708 0.58
709 0.58
710 0.53
711 0.5
712 0.42
713 0.39
714 0.31
715 0.3
716 0.25
717 0.22
718 0.25
719 0.25
720 0.24
721 0.19
722 0.18
723 0.19
724 0.25
725 0.24
726 0.23
727 0.21
728 0.21
729 0.26
730 0.26
731 0.27
732 0.26
733 0.27
734 0.26
735 0.28
736 0.3
737 0.31
738 0.32
739 0.34
740 0.35
741 0.39
742 0.46
743 0.54
744 0.63
745 0.66
746 0.76
747 0.81
748 0.86
749 0.89
750 0.88
751 0.89
752 0.86
753 0.85