Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5DHU5

Protein Details
Accession C5DHU5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-45VVIPASSKARRRRRDVGGIRKNVSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-35KARRRRRD
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 14, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG lth:KLTH0E07194g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLGRRLAGAKPQSGALFKRFVVIPASSKARRRRRDVGGIRKNVSVEELELDKALDLRDPKELEFKLRQLREFTKNLATQIRVADDLVKKEAAQKELGNKSKEEDTADAASVILGTHNHHDRYQRRSLLQGEDLSSIILSVSHQVKKLLPEAILKRINDDELVLRSLINHRNSDWNAIISKLDQSPEKLDGVSQRALKNYILSKAKNLSLGSIRKADAMLLSNINHDLTKFNTSMYEFLFYNLSNLKPSQDPSSKYNNEVYTVMESLLDRYDEAQKVIAGKNVAIEAQEGIMPKVEMNQFILNCCIKFASKLLDVSKMNRFLTKFNRDYHILPNKENYTVIAQFYTKLGLHDKAWDIFATMKFLSADHKPDAKTYTCMLSLCNKEKNYAKAIDLFNEMIDLKVDPTPETLNALVKTLATVSGDPVASEGKAESLRLLAWKYLHQNEDLVNLRSGNFEDTILAMMSLCAYDGDAGLARALYFKYITTRFKSNFESWRMRQGDHSSVDYKKVWASTLNPFLFNYLMLAYANYSPGKLPLLLGFEQGAVTRRNLINNVDYLYKFQNDEAGPRAKLPMLPLADISEPSQILLESRAVWQFNLEFGGLCDLRISPLGSSKVLKDLAASAESIEDFSFQVLHQIALWKTQIVNHNALNPKSIMTYLTIPLKLGEKKEFLLRMSEFSYEQQTFEQHISSLYMNTKQQLLTARPGSSTHLTHSEIKKQPSSQTSFNEESSLAFLSSMKHKIIRNSSIYELTMKAAIRFQDQALATKAWESRGSYRKTLAFQNLPVAERTKKDAAFASLMVDFFTQQQMYTDAMGIIMASQRHISWRYPMVKRLHRKLVELEDTRSIKILMEIVNKRSKSDSSAEAVTSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.33
4 0.3
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.29
9 0.28
10 0.28
11 0.3
12 0.38
13 0.39
14 0.47
15 0.56
16 0.62
17 0.68
18 0.73
19 0.76
20 0.78
21 0.83
22 0.86
23 0.87
24 0.87
25 0.86
26 0.8
27 0.73
28 0.64
29 0.53
30 0.45
31 0.35
32 0.26
33 0.21
34 0.19
35 0.17
36 0.17
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.22
45 0.24
46 0.25
47 0.32
48 0.34
49 0.37
50 0.41
51 0.47
52 0.5
53 0.53
54 0.55
55 0.54
56 0.6
57 0.6
58 0.58
59 0.55
60 0.53
61 0.51
62 0.52
63 0.5
64 0.45
65 0.4
66 0.39
67 0.36
68 0.28
69 0.26
70 0.29
71 0.27
72 0.29
73 0.28
74 0.26
75 0.24
76 0.31
77 0.35
78 0.31
79 0.3
80 0.31
81 0.38
82 0.47
83 0.54
84 0.49
85 0.45
86 0.45
87 0.46
88 0.45
89 0.39
90 0.31
91 0.29
92 0.29
93 0.28
94 0.25
95 0.2
96 0.18
97 0.14
98 0.12
99 0.08
100 0.06
101 0.08
102 0.14
103 0.19
104 0.21
105 0.24
106 0.33
107 0.38
108 0.45
109 0.53
110 0.53
111 0.5
112 0.54
113 0.56
114 0.53
115 0.52
116 0.48
117 0.4
118 0.35
119 0.33
120 0.27
121 0.22
122 0.16
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.1
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.21
131 0.24
132 0.27
133 0.31
134 0.29
135 0.25
136 0.31
137 0.34
138 0.41
139 0.44
140 0.4
141 0.39
142 0.38
143 0.37
144 0.29
145 0.27
146 0.21
147 0.18
148 0.19
149 0.16
150 0.14
151 0.15
152 0.21
153 0.27
154 0.27
155 0.27
156 0.27
157 0.35
158 0.37
159 0.4
160 0.35
161 0.31
162 0.28
163 0.27
164 0.26
165 0.18
166 0.21
167 0.17
168 0.18
169 0.17
170 0.18
171 0.21
172 0.23
173 0.23
174 0.19
175 0.19
176 0.22
177 0.25
178 0.27
179 0.28
180 0.28
181 0.29
182 0.31
183 0.29
184 0.29
185 0.28
186 0.31
187 0.33
188 0.32
189 0.34
190 0.37
191 0.38
192 0.37
193 0.34
194 0.3
195 0.31
196 0.34
197 0.33
198 0.32
199 0.3
200 0.27
201 0.27
202 0.24
203 0.18
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.18
235 0.23
236 0.27
237 0.3
238 0.33
239 0.43
240 0.43
241 0.44
242 0.47
243 0.4
244 0.37
245 0.34
246 0.31
247 0.23
248 0.22
249 0.19
250 0.14
251 0.13
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.07
256 0.09
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.13
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.21
288 0.18
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.18
298 0.19
299 0.25
300 0.25
301 0.28
302 0.32
303 0.32
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.29
308 0.37
309 0.43
310 0.41
311 0.39
312 0.43
313 0.42
314 0.44
315 0.48
316 0.48
317 0.42
318 0.39
319 0.41
320 0.39
321 0.37
322 0.35
323 0.26
324 0.21
325 0.2
326 0.19
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.14
351 0.13
352 0.16
353 0.16
354 0.19
355 0.19
356 0.21
357 0.24
358 0.22
359 0.23
360 0.2
361 0.2
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.2
366 0.25
367 0.27
368 0.32
369 0.3
370 0.32
371 0.36
372 0.38
373 0.36
374 0.32
375 0.29
376 0.29
377 0.29
378 0.27
379 0.25
380 0.22
381 0.17
382 0.16
383 0.15
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.07
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.07
424 0.08
425 0.11
426 0.15
427 0.18
428 0.18
429 0.18
430 0.18
431 0.17
432 0.21
433 0.21
434 0.19
435 0.16
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.11
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.02
454 0.02
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.09
469 0.14
470 0.18
471 0.2
472 0.26
473 0.27
474 0.31
475 0.36
476 0.37
477 0.4
478 0.43
479 0.47
480 0.42
481 0.5
482 0.48
483 0.44
484 0.42
485 0.4
486 0.39
487 0.33
488 0.35
489 0.29
490 0.28
491 0.3
492 0.27
493 0.23
494 0.19
495 0.17
496 0.15
497 0.14
498 0.16
499 0.19
500 0.28
501 0.27
502 0.27
503 0.26
504 0.26
505 0.25
506 0.21
507 0.15
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.08
515 0.07
516 0.08
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.12
524 0.12
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.09
532 0.09
533 0.13
534 0.14
535 0.15
536 0.17
537 0.19
538 0.18
539 0.19
540 0.2
541 0.18
542 0.17
543 0.18
544 0.18
545 0.17
546 0.16
547 0.14
548 0.18
549 0.16
550 0.18
551 0.21
552 0.23
553 0.22
554 0.22
555 0.23
556 0.18
557 0.19
558 0.18
559 0.19
560 0.17
561 0.17
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.17
566 0.16
567 0.12
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.09
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.12
584 0.1
585 0.07
586 0.07
587 0.12
588 0.11
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.07
596 0.12
597 0.14
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.2
602 0.2
603 0.19
604 0.15
605 0.15
606 0.15
607 0.15
608 0.14
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.08
614 0.07
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.05
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.14
624 0.14
625 0.16
626 0.17
627 0.14
628 0.14
629 0.18
630 0.24
631 0.24
632 0.28
633 0.26
634 0.33
635 0.37
636 0.37
637 0.35
638 0.29
639 0.25
640 0.22
641 0.21
642 0.15
643 0.12
644 0.14
645 0.15
646 0.19
647 0.19
648 0.18
649 0.19
650 0.23
651 0.24
652 0.25
653 0.26
654 0.24
655 0.26
656 0.31
657 0.33
658 0.28
659 0.31
660 0.28
661 0.27
662 0.27
663 0.27
664 0.22
665 0.21
666 0.27
667 0.22
668 0.21
669 0.19
670 0.19
671 0.2
672 0.2
673 0.19
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.13
678 0.15
679 0.15
680 0.18
681 0.19
682 0.2
683 0.21
684 0.19
685 0.21
686 0.25
687 0.26
688 0.29
689 0.32
690 0.31
691 0.3
692 0.31
693 0.33
694 0.32
695 0.29
696 0.25
697 0.26
698 0.29
699 0.35
700 0.39
701 0.44
702 0.46
703 0.5
704 0.51
705 0.5
706 0.53
707 0.54
708 0.55
709 0.52
710 0.51
711 0.53
712 0.51
713 0.49
714 0.43
715 0.35
716 0.3
717 0.26
718 0.21
719 0.14
720 0.11
721 0.11
722 0.12
723 0.17
724 0.2
725 0.2
726 0.24
727 0.26
728 0.35
729 0.42
730 0.47
731 0.47
732 0.48
733 0.5
734 0.48
735 0.46
736 0.4
737 0.32
738 0.26
739 0.24
740 0.21
741 0.18
742 0.18
743 0.19
744 0.19
745 0.2
746 0.19
747 0.23
748 0.23
749 0.25
750 0.26
751 0.25
752 0.22
753 0.25
754 0.26
755 0.22
756 0.24
757 0.25
758 0.3
759 0.38
760 0.44
761 0.43
762 0.47
763 0.49
764 0.49
765 0.53
766 0.52
767 0.49
768 0.45
769 0.5
770 0.48
771 0.44
772 0.43
773 0.4
774 0.35
775 0.32
776 0.36
777 0.35
778 0.32
779 0.33
780 0.35
781 0.35
782 0.34
783 0.32
784 0.29
785 0.24
786 0.23
787 0.21
788 0.18
789 0.14
790 0.12
791 0.15
792 0.12
793 0.11
794 0.12
795 0.14
796 0.15
797 0.15
798 0.15
799 0.11
800 0.11
801 0.1
802 0.09
803 0.08
804 0.09
805 0.08
806 0.09
807 0.1
808 0.1
809 0.16
810 0.19
811 0.2
812 0.24
813 0.33
814 0.41
815 0.46
816 0.53
817 0.58
818 0.65
819 0.73
820 0.76
821 0.78
822 0.72
823 0.72
824 0.72
825 0.71
826 0.71
827 0.65
828 0.59
829 0.57
830 0.56
831 0.52
832 0.45
833 0.36
834 0.27
835 0.24
836 0.24
837 0.21
838 0.28
839 0.33
840 0.39
841 0.47
842 0.47
843 0.47
844 0.47
845 0.44
846 0.4
847 0.4
848 0.38
849 0.35
850 0.38
851 0.36