Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHU5

Protein Details
Accession C5DHU5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-45VVIPASSKARRRRRDVGGIRKNVSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-35KARRRRRD
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 14, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG lth:KLTH0E07194g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLGRRLAGAKPQSGALFKRFVVIPASSKARRRRRDVGGIRKNVSVEELELDKALDLRDPKELEFKLRQLREFTKNLATQIRVADDLVKKEAAQKELGNKSKEEDTADAASVILGTHNHHDRYQRRSLLQGEDLSSIILSVSHQVKKLLPEAILKRINDDELVLRSLINHRNSDWNAIISKLDQSPEKLDGVSQRALKNYILSKAKNLSLGSIRKADAMLLSNINHDLTKFNTSMYEFLFYNLSNLKPSQDPSSKYNNEVYTVMESLLDRYDEAQKVIAGKNVAIEAQEGIMPKVEMNQFILNCCIKFASKLLDVSKMNRFLTKFNRDYHILPNKENYTVIAQFYTKLGLHDKAWDIFATMKFLSADHKPDAKTYTCMLSLCNKEKNYAKAIDLFNEMIDLKVDPTPETLNALVKTLATVSGDPVASEGKAESLRLLAWKYLHQNEDLVNLRSGNFEDTILAMMSLCAYDGDAGLARALYFKYITTRFKSNFESWRMRQGDHSSVDYKKVWASTLNPFLFNYLMLAYANYSPGKLPLLLGFEQGAVTRRNLINNVDYLYKFQNDEAGPRAKLPMLPLADISEPSQILLESRAVWQFNLEFGGLCDLRISPLGSSKVLKDLAASAESIEDFSFQVLHQIALWKTQIVNHNALNPKSIMTYLTIPLKLGEKKEFLLRMSEFSYEQQTFEQHISSLYMNTKQQLLTARPGSSTHLTHSEIKKQPSSQTSFNEESSLAFLSSMKHKIIRNSSIYELTMKAAIRFQDQALATKAWESRGSYRKTLAFQNLPVAERTKKDAAFASLMVDFFTQQQMYTDAMGIIMASQRHISWRYPMVKRLHRKLVELEDTRSIKILMEIVNKRSKSDSSAEAVTSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.33
4 0.3
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.29
9 0.28
10 0.28
11 0.3
12 0.38
13 0.39
14 0.47
15 0.56
16 0.62
17 0.68
18 0.73
19 0.76
20 0.78
21 0.83
22 0.86
23 0.87
24 0.87
25 0.86
26 0.8
27 0.73
28 0.64
29 0.53
30 0.45
31 0.35
32 0.26
33 0.21
34 0.19
35 0.17
36 0.17
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.22
45 0.24
46 0.25
47 0.32
48 0.34
49 0.37
50 0.41
51 0.47
52 0.5
53 0.53
54 0.55
55 0.54
56 0.6
57 0.6
58 0.58
59 0.55
60 0.53
61 0.51
62 0.52
63 0.5
64 0.45
65 0.4
66 0.39
67 0.36
68 0.28
69 0.26
70 0.29
71 0.27
72 0.29
73 0.28
74 0.26
75 0.24
76 0.31
77 0.35
78 0.31
79 0.3
80 0.31
81 0.38
82 0.47
83 0.54
84 0.49
85 0.45
86 0.45
87 0.46
88 0.45
89 0.39
90 0.31
91 0.29
92 0.29
93 0.28
94 0.25
95 0.2
96 0.18
97 0.14
98 0.12
99 0.08
100 0.06
101 0.08
102 0.14
103 0.19
104 0.21
105 0.24
106 0.33
107 0.38
108 0.45
109 0.53
110 0.53
111 0.5
112 0.54
113 0.56
114 0.53
115 0.52
116 0.48
117 0.4
118 0.35
119 0.33
120 0.27
121 0.22
122 0.16
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.1
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.21
131 0.24
132 0.27
133 0.31
134 0.29
135 0.25
136 0.31
137 0.34
138 0.41
139 0.44
140 0.4
141 0.39
142 0.38
143 0.37
144 0.29
145 0.27
146 0.21
147 0.18
148 0.19
149 0.16
150 0.14
151 0.15
152 0.21
153 0.27
154 0.27
155 0.27
156 0.27
157 0.35
158 0.37
159 0.4
160 0.35
161 0.31
162 0.28
163 0.27
164 0.26
165 0.18
166 0.21
167 0.17
168 0.18
169 0.17
170 0.18
171 0.21
172 0.23
173 0.23
174 0.19
175 0.19
176 0.22
177 0.25
178 0.27
179 0.28
180 0.28
181 0.29
182 0.31
183 0.29
184 0.29
185 0.28
186 0.31
187 0.33
188 0.32
189 0.34
190 0.37
191 0.38
192 0.37
193 0.34
194 0.3
195 0.31
196 0.34
197 0.33
198 0.32
199 0.3
200 0.27
201 0.27
202 0.24
203 0.18
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.18
235 0.23
236 0.27
237 0.3
238 0.33
239 0.43
240 0.43
241 0.44
242 0.47
243 0.4
244 0.37
245 0.34
246 0.31
247 0.23
248 0.22
249 0.19
250 0.14
251 0.13
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.07
256 0.09
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.13
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.21
288 0.18
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.18
298 0.19
299 0.25
300 0.25
301 0.28
302 0.32
303 0.32
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.29
308 0.37
309 0.43
310 0.41
311 0.39
312 0.43
313 0.42
314 0.44
315 0.48
316 0.48
317 0.42
318 0.39
319 0.41
320 0.39
321 0.37
322 0.35
323 0.26
324 0.21
325 0.2
326 0.19
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.14
351 0.13
352 0.16
353 0.16
354 0.19
355 0.19
356 0.21
357 0.24
358 0.22
359 0.23
360 0.2
361 0.2
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.2
366 0.25
367 0.27
368 0.32
369 0.3
370 0.32
371 0.36
372 0.38
373 0.36
374 0.32
375 0.29
376 0.29
377 0.29
378 0.27
379 0.25
380 0.22
381 0.17
382 0.16
383 0.15
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.07
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.07
424 0.08
425 0.11
426 0.15
427 0.18
428 0.18
429 0.18
430 0.18
431 0.17
432 0.21
433 0.21
434 0.19
435 0.16
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.11
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.02
454 0.02
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.09
469 0.14
470 0.18
471 0.2
472 0.26
473 0.27
474 0.31
475 0.36
476 0.37
477 0.4
478 0.43
479 0.47
480 0.42
481 0.5
482 0.48
483 0.44
484 0.42
485 0.4
486 0.39
487 0.33
488 0.35
489 0.29
490 0.28
491 0.3
492 0.27
493 0.23
494 0.19
495 0.17
496 0.15
497 0.14
498 0.16
499 0.19
500 0.28
501 0.27
502 0.27
503 0.26
504 0.26
505 0.25
506 0.21
507 0.15
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.08
515 0.07
516 0.08
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.12
524 0.12
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.09
532 0.09
533 0.13
534 0.14
535 0.15
536 0.17
537 0.19
538 0.18
539 0.19
540 0.2
541 0.18
542 0.17
543 0.18
544 0.18
545 0.17
546 0.16
547 0.14
548 0.18
549 0.16
550 0.18
551 0.21
552 0.23
553 0.22
554 0.22
555 0.23
556 0.18
557 0.19
558 0.18
559 0.19
560 0.17
561 0.17
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.17
566 0.16
567 0.12
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.09
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.12
584 0.1
585 0.07
586 0.07
587 0.12
588 0.11
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.07
596 0.12
597 0.14
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.2
602 0.2
603 0.19
604 0.15
605 0.15
606 0.15
607 0.15
608 0.14
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.08
614 0.07
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.05
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.14
624 0.14
625 0.16
626 0.17
627 0.14
628 0.14
629 0.18
630 0.24
631 0.24
632 0.28
633 0.26
634 0.33
635 0.37
636 0.37
637 0.35
638 0.29
639 0.25
640 0.22
641 0.21
642 0.15
643 0.12
644 0.14
645 0.15
646 0.19
647 0.19
648 0.18
649 0.19
650 0.23
651 0.24
652 0.25
653 0.26
654 0.24
655 0.26
656 0.31
657 0.33
658 0.28
659 0.31
660 0.28
661 0.27
662 0.27
663 0.27
664 0.22
665 0.21
666 0.27
667 0.22
668 0.21
669 0.19
670 0.19
671 0.2
672 0.2
673 0.19
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.13
678 0.15
679 0.15
680 0.18
681 0.19
682 0.2
683 0.21
684 0.19
685 0.21
686 0.25
687 0.26
688 0.29
689 0.32
690 0.31
691 0.3
692 0.31
693 0.33
694 0.32
695 0.29
696 0.25
697 0.26
698 0.29
699 0.35
700 0.39
701 0.44
702 0.46
703 0.5
704 0.51
705 0.5
706 0.53
707 0.54
708 0.55
709 0.52
710 0.51
711 0.53
712 0.51
713 0.49
714 0.43
715 0.35
716 0.3
717 0.26
718 0.21
719 0.14
720 0.11
721 0.11
722 0.12
723 0.17
724 0.2
725 0.2
726 0.24
727 0.26
728 0.35
729 0.42
730 0.47
731 0.47
732 0.48
733 0.5
734 0.48
735 0.46
736 0.4
737 0.32
738 0.26
739 0.24
740 0.21
741 0.18
742 0.18
743 0.19
744 0.19
745 0.2
746 0.19
747 0.23
748 0.23
749 0.25
750 0.26
751 0.25
752 0.22
753 0.25
754 0.26
755 0.22
756 0.24
757 0.25
758 0.3
759 0.38
760 0.44
761 0.43
762 0.47
763 0.49
764 0.49
765 0.53
766 0.52
767 0.49
768 0.45
769 0.5
770 0.48
771 0.44
772 0.43
773 0.4
774 0.35
775 0.32
776 0.36
777 0.35
778 0.32
779 0.33
780 0.35
781 0.35
782 0.34
783 0.32
784 0.29
785 0.24
786 0.23
787 0.21
788 0.18
789 0.14
790 0.12
791 0.15
792 0.12
793 0.11
794 0.12
795 0.14
796 0.15
797 0.15
798 0.15
799 0.11
800 0.11
801 0.1
802 0.09
803 0.08
804 0.09
805 0.08
806 0.09
807 0.1
808 0.1
809 0.16
810 0.19
811 0.2
812 0.24
813 0.33
814 0.41
815 0.46
816 0.53
817 0.58
818 0.65
819 0.73
820 0.76
821 0.78
822 0.72
823 0.72
824 0.72
825 0.71
826 0.71
827 0.65
828 0.59
829 0.57
830 0.56
831 0.52
832 0.45
833 0.36
834 0.27
835 0.24
836 0.24
837 0.21
838 0.28
839 0.33
840 0.39
841 0.47
842 0.47
843 0.47
844 0.47
845 0.44
846 0.4
847 0.4
848 0.38
849 0.35
850 0.38
851 0.36