Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBY2

Protein Details
Accession C5DBY2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
361-409LAQEKKQDVEREKRRQMRSKLSGQEQDKIDQKMREKRERRMRNRQKVRMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-374R
391-409QKMREKRERRMRNRQKVRM
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 8, nucl 7, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG lth:KLTH0A06270g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSILEPFLKLSNYANKLNEKYAAMPIGELRALTLAERIRFYNWTFEIWALALLAAVYGAYVIGTRLNSRRATQLFDSLTDGFQKLAFAKVGFSTKAGEKKQYVAEQNNTWYTTFATGRSSIESITARAHMTARYNPLTLLMERVVGLFFPSLFEKDLGEFLEVSIVPNGIYVTSPNADLPKEDAVTAILSRFKFIASIVNKSVMTKARETNYFLSLTHTSESEKLPVEYVFMSESNQLNGFFEHYAGPEFKDLLAKCSRFLSFVSFTDLPEEKPITDKLWNLKQKPRCVIHCEFVTGTKDLNLLNQLIAEIVKIFDAVTQDYAQNPTKAFLTNDMLKKASNLRSQELQKIVKVMKQVERELAQEKKQDVEREKRRQMRSKLSGQEQDKIDQKMREKRERRMRNRQKVRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.49
4 0.51
5 0.49
6 0.42
7 0.4
8 0.39
9 0.36
10 0.29
11 0.26
12 0.24
13 0.23
14 0.21
15 0.18
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.2
24 0.21
25 0.22
26 0.25
27 0.27
28 0.31
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.27
33 0.26
34 0.22
35 0.21
36 0.12
37 0.11
38 0.08
39 0.06
40 0.06
41 0.04
42 0.03
43 0.03
44 0.02
45 0.02
46 0.02
47 0.03
48 0.03
49 0.05
50 0.06
51 0.11
52 0.15
53 0.2
54 0.23
55 0.25
56 0.33
57 0.33
58 0.38
59 0.36
60 0.4
61 0.36
62 0.36
63 0.37
64 0.3
65 0.29
66 0.25
67 0.23
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.11
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.12
76 0.14
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.28
83 0.29
84 0.32
85 0.31
86 0.35
87 0.4
88 0.43
89 0.45
90 0.44
91 0.47
92 0.44
93 0.47
94 0.46
95 0.41
96 0.35
97 0.28
98 0.23
99 0.22
100 0.19
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.16
118 0.19
119 0.23
120 0.23
121 0.23
122 0.22
123 0.24
124 0.24
125 0.2
126 0.19
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.16
183 0.14
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.23
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.22
194 0.23
195 0.25
196 0.28
197 0.27
198 0.25
199 0.23
200 0.2
201 0.21
202 0.19
203 0.18
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.14
239 0.13
240 0.16
241 0.22
242 0.22
243 0.22
244 0.24
245 0.24
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.19
250 0.19
251 0.25
252 0.23
253 0.23
254 0.26
255 0.26
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.15
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.19
264 0.21
265 0.25
266 0.33
267 0.41
268 0.44
269 0.51
270 0.55
271 0.6
272 0.66
273 0.66
274 0.62
275 0.62
276 0.62
277 0.6
278 0.54
279 0.49
280 0.41
281 0.37
282 0.35
283 0.27
284 0.23
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.16
289 0.14
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.18
310 0.19
311 0.2
312 0.19
313 0.19
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.2
318 0.24
319 0.29
320 0.33
321 0.34
322 0.34
323 0.32
324 0.33
325 0.36
326 0.38
327 0.37
328 0.37
329 0.39
330 0.46
331 0.5
332 0.54
333 0.54
334 0.49
335 0.44
336 0.46
337 0.44
338 0.38
339 0.4
340 0.39
341 0.39
342 0.42
343 0.43
344 0.43
345 0.43
346 0.44
347 0.45
348 0.45
349 0.43
350 0.42
351 0.41
352 0.41
353 0.44
354 0.49
355 0.51
356 0.56
357 0.62
358 0.67
359 0.76
360 0.79
361 0.84
362 0.86
363 0.87
364 0.87
365 0.85
366 0.84
367 0.83
368 0.82
369 0.82
370 0.75
371 0.73
372 0.65
373 0.62
374 0.59
375 0.55
376 0.52
377 0.49
378 0.55
379 0.57
380 0.64
381 0.69
382 0.71
383 0.76
384 0.81
385 0.86
386 0.88
387 0.9
388 0.91
389 0.92