FuNGI

C5DNP3

Protein Details

Accession

C5DNP3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1187-1206	MKVTDLKKKLSQKLGRPFTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19, cyto_mito 11.5, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0110165 C:cellular anatomical entity GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	lth:KLTH0G18744g -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLRFSRSCSRMLVSKRLTSQLRCVSQTAFLRKPSGNIDGLSGATGREDIGFLKSSSVSMSPHFGPFDHSHAVVSAAESRDIMNLWSLLEACLHSGYMERAFSILKSLYALKSHQAYFIDDYNKFLMKYAETLHDIKDLDKKLFHDIQETFPACEYNDKTLAILIHHALKLSSSAEAKLEHCKIYFKMAVSGQRSILSNVDVLTVPNYKSLVHDLKLVSLNELPAAVRPLIESGNIVTGEMLSSQQSSEINAKALSHGEVALDRNIEPLDKDAKELLAVDTIGMKVVRHTLLGLSFTEDQKKQITSFNFDTSSNLLNFDQEKESIDFFEMFRNLKSEEERRSFESALDEFNQDRQHQLENRATDAAKERWRHDFEEAKSRGDLSIQKKLNIKLWEWFNLMLPLVKEEVRRCAAVANKTAQDTSLSPQEKKQNKARQEYGPYLTLVDPEKMCVITILELLKLNSTGGIIEGMRTARAVISVGKAIEMEFRAEMLLKNESHVFKDVNKKSHEFKLMVQRARATFRSIKIEESKVLWPQEARAKIGSILISMLIHVAKVKVEGVDPVTNEKIKGEAPAFSHGYQYHNGSKLGVLKIHRSLIHQLNGERLVAAVQPQLLPMLVKPRAWNSWNSGGYYYTQSTLIRSKDSPEQVAYLKAVSDAGAIDNVYRGLNVLGETPWTVNRKMFNVMSQVWNSGKPFLDIPGIQEKLTLTPQPPRDADPSVHREWKLKNKELANEFSGNRSARCDANYKLEIARAFLGEKFYFPHNLDFRGRAYPLSPHFNHLGNDMSRGLMTFWHGKRLGSTGLRWLKVHLSNLFGFDKAPLEDRVRFAEDHIDDIRDSAEHPLDGKCWWKEADKPWQALATCMELNEALKMSNPDDFVSHQPVHQDGTCNGLQHYAALGGDIEGATQVNLVPSDRPQDVYSHVAKLVVARLEKAAANGDETAALLKDKIKRKVVKQTVMTNVYGVTYIGATHQIDKQLSTLFNDHKRSYELSKYLTKHVFASVRELFEGAHLIQDWLGECAKRISKSIRLDVDEKTLKNGNKPDFMSSVIWTTPLGLPIVQPYRENGKKQVATNLQTVFISDPFAINPINARRQKAGFPPNFIHSLDASHMLLSAAKCGEKGLDFAAVHDSYWTHACDVDTMNVVLREQFIKLHEVDLIERLKDEFDERYKNYLQILKIDKKSEVAMKVTDLKKKLSQKLGRPFTLADEIYMEKKRIQLLSSEDASEQAEGANMVTTVSLVAGAGDISNLEKTSDASCLVVLAPLTLPQIPPKGDFDVRELEKSKYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.56
3	0.6
4	0.63
5	0.59
6	0.62
7	0.61
8	0.61
9	0.57
10	0.54
11	0.48
12	0.49
13	0.54
14	0.53
15	0.48
16	0.46
17	0.48
18	0.47
19	0.49
20	0.46
21	0.44
22	0.38
23	0.33
24	0.32
25	0.28
26	0.27
27	0.24
28	0.19
29	0.14
30	0.11
31	0.11
32	0.08
33	0.07
34	0.08
35	0.08
36	0.11
37	0.13
38	0.13
39	0.15
40	0.15
41	0.15
42	0.17
43	0.17
44	0.16
45	0.16
46	0.2
47	0.2
48	0.23
49	0.23
50	0.21
51	0.26
52	0.28
53	0.31
54	0.3
55	0.28
56	0.25
57	0.25
58	0.26
59	0.2
60	0.18
61	0.18
62	0.16
63	0.16
64	0.16
65	0.16
66	0.15
67	0.16
68	0.15
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.11
74	0.1
75	0.11
76	0.11
77	0.1
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.1
82	0.12
83	0.14
84	0.14
85	0.13
86	0.13
87	0.14
88	0.14
89	0.17
90	0.15
91	0.12
92	0.14
93	0.17
94	0.19
95	0.21
96	0.23
97	0.23
98	0.28
99	0.28
100	0.3
101	0.28
102	0.3
103	0.3
104	0.34
105	0.36
106	0.31
107	0.33
108	0.32
109	0.33
110	0.29
111	0.27
112	0.24
113	0.19
114	0.21
115	0.22
116	0.23
117	0.26
118	0.27
119	0.27
120	0.29
121	0.28
122	0.27
123	0.32
124	0.3
125	0.29
126	0.3
127	0.31
128	0.35
129	0.39
130	0.38
131	0.37
132	0.36
133	0.38
134	0.44
135	0.43
136	0.36
137	0.32
138	0.32
139	0.25
140	0.3
141	0.29
142	0.25
143	0.26
144	0.25
145	0.25
146	0.26
147	0.27
148	0.21
149	0.2
150	0.16
151	0.18
152	0.19
153	0.19
154	0.16
155	0.16
156	0.16
157	0.15
158	0.16
159	0.12
160	0.13
161	0.15
162	0.17
163	0.18
164	0.25
165	0.27
166	0.26
167	0.25
168	0.28
169	0.28
170	0.33
171	0.35
172	0.28
173	0.31
174	0.33
175	0.4
176	0.4
177	0.41
178	0.35
179	0.34
180	0.34
181	0.3
182	0.27
183	0.2
184	0.17
185	0.15
186	0.15
187	0.13
188	0.12
189	0.13
190	0.15
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.14
195	0.16
196	0.23
197	0.25
198	0.23
199	0.28
200	0.26
201	0.3
202	0.35
203	0.33
204	0.28
205	0.24
206	0.23
207	0.18
208	0.18
209	0.14
210	0.11
211	0.13
212	0.11
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.09
220	0.12
221	0.12
222	0.11
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.08
232	0.08
233	0.1
234	0.14
235	0.14
236	0.15
237	0.15
238	0.16
239	0.15
240	0.17
241	0.15
242	0.12
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.13
255	0.18
256	0.17
257	0.19
258	0.18
259	0.18
260	0.18
261	0.19
262	0.16
263	0.11
264	0.11
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.09
270	0.08
271	0.07
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.11
276	0.11
277	0.13
278	0.14
279	0.14
280	0.14
281	0.16
282	0.18
283	0.23
284	0.22
285	0.22
286	0.24
287	0.25
288	0.23
289	0.27
290	0.29
291	0.3
292	0.33
293	0.35
294	0.34
295	0.33
296	0.33
297	0.29
298	0.29
299	0.22
300	0.21
301	0.17
302	0.17
303	0.18
304	0.19
305	0.18
306	0.15
307	0.18
308	0.17
309	0.18
310	0.16
311	0.17
312	0.15
313	0.14
314	0.18
315	0.17
316	0.16
317	0.16
318	0.17
319	0.17
320	0.18
321	0.24
322	0.25
323	0.32
324	0.36
325	0.39
326	0.4
327	0.44
328	0.42
329	0.37
330	0.35
331	0.28
332	0.26
333	0.24
334	0.22
335	0.19
336	0.22
337	0.24
338	0.19
339	0.2
340	0.18
341	0.23
342	0.25
343	0.31
344	0.34
345	0.32
346	0.34
347	0.35
348	0.33
349	0.29
350	0.3
351	0.3
352	0.31
353	0.33
354	0.34
355	0.4
356	0.43
357	0.44
358	0.44
359	0.46
360	0.43
361	0.5
362	0.49
363	0.42
364	0.39
365	0.37
366	0.31
367	0.26
368	0.3
369	0.25
370	0.32
371	0.32
372	0.36
373	0.4
374	0.43
375	0.46
376	0.42
377	0.38
378	0.35
379	0.37
380	0.38
381	0.34
382	0.33
383	0.27
384	0.25
385	0.23
386	0.19
387	0.15
388	0.12
389	0.12
390	0.13
391	0.15
392	0.15
393	0.2
394	0.21
395	0.21
396	0.2
397	0.22
398	0.26
399	0.28
400	0.3
401	0.28
402	0.28
403	0.29
404	0.29
405	0.25
406	0.22
407	0.18
408	0.17
409	0.21
410	0.22
411	0.22
412	0.27
413	0.37
414	0.41
415	0.46
416	0.53
417	0.54
418	0.59
419	0.67
420	0.68
421	0.66
422	0.66
423	0.65
424	0.58
425	0.51
426	0.43
427	0.36
428	0.3
429	0.25
430	0.19
431	0.17
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.09
438	0.09
439	0.07
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.08
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.1
471	0.09
472	0.09
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.09
479	0.11
480	0.1
481	0.12
482	0.15
483	0.16
484	0.17
485	0.18
486	0.17
487	0.19
488	0.3
489	0.33
490	0.36
491	0.39
492	0.4
493	0.43
494	0.48
495	0.48
496	0.39
497	0.39
498	0.43
499	0.48
500	0.47
501	0.44
502	0.41
503	0.39
504	0.41
505	0.37
506	0.31
507	0.28
508	0.28
509	0.35
510	0.32
511	0.34
512	0.34
513	0.35
514	0.3
515	0.29
516	0.29
517	0.25
518	0.25
519	0.22
520	0.18
521	0.19
522	0.24
523	0.23
524	0.22
525	0.19
526	0.19
527	0.18
528	0.2
529	0.17
530	0.1
531	0.09
532	0.07
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.05
540	0.04
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.09
547	0.11
548	0.11
549	0.13
550	0.15
551	0.14
552	0.14
553	0.13
554	0.12
555	0.1
556	0.12
557	0.1
558	0.11
559	0.13
560	0.17
561	0.19
562	0.18
563	0.2
564	0.18
565	0.19
566	0.18
567	0.2
568	0.19
569	0.19
570	0.19
571	0.17
572	0.18
573	0.2
574	0.2
575	0.19
576	0.17
577	0.18
578	0.2
579	0.22
580	0.21
581	0.19
582	0.24
583	0.25
584	0.28
585	0.27
586	0.26
587	0.26
588	0.26
589	0.24
590	0.18
591	0.13
592	0.1
593	0.08
594	0.08
595	0.06
596	0.05
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.11
604	0.12
605	0.12
606	0.13
607	0.16
608	0.2
609	0.21
610	0.23
611	0.22
612	0.29
613	0.29
614	0.29
615	0.27
616	0.24
617	0.24
618	0.24
619	0.2
620	0.12
621	0.12
622	0.11
623	0.12
624	0.16
625	0.15
626	0.15
627	0.15
628	0.17
629	0.22
630	0.23
631	0.23
632	0.19
633	0.2
634	0.19
635	0.19
636	0.17
637	0.11
638	0.1
639	0.08
640	0.07
641	0.06
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.09
662	0.11
663	0.11
664	0.13
665	0.14
666	0.16
667	0.19
668	0.19
669	0.18
670	0.2
671	0.2
672	0.21
673	0.2
674	0.2
675	0.18
676	0.19
677	0.17
678	0.15
679	0.14
680	0.12
681	0.12
682	0.11
683	0.12
684	0.11
685	0.13
686	0.18
687	0.19
688	0.17
689	0.18
690	0.17
691	0.16
692	0.18
693	0.17
694	0.11
695	0.17
696	0.19
697	0.23
698	0.23
699	0.25
700	0.26
701	0.27
702	0.28
703	0.29
704	0.32
705	0.32
706	0.36
707	0.33
708	0.34
709	0.37
710	0.46
711	0.47
712	0.47
713	0.49
714	0.48
715	0.53
716	0.53
717	0.52
718	0.45
719	0.4
720	0.34
721	0.3
722	0.31
723	0.25
724	0.22
725	0.2
726	0.19
727	0.16
728	0.18
729	0.2
730	0.18
731	0.24
732	0.25
733	0.24
734	0.23
735	0.24
736	0.22
737	0.2
738	0.18
739	0.12
740	0.12
741	0.11
742	0.14
743	0.12
744	0.12
745	0.12
746	0.13
747	0.15
748	0.16
749	0.21
750	0.2
751	0.24
752	0.25
753	0.25
754	0.26
755	0.26
756	0.25
757	0.19
758	0.18
759	0.19
760	0.21
761	0.27
762	0.26
763	0.25
764	0.27
765	0.29
766	0.28
767	0.24
768	0.25
769	0.18
770	0.2
771	0.17
772	0.15
773	0.12
774	0.12
775	0.11
776	0.07
777	0.09
778	0.15
779	0.15
780	0.22
781	0.22
782	0.22
783	0.23
784	0.25
785	0.27
786	0.21
787	0.22
788	0.25
789	0.29
790	0.31
791	0.3
792	0.29
793	0.29
794	0.3
795	0.33
796	0.25
797	0.24
798	0.23
799	0.26
800	0.26
801	0.2
802	0.18
803	0.14
804	0.14
805	0.11
806	0.13
807	0.12
808	0.15
809	0.17
810	0.19
811	0.21
812	0.22
813	0.21
814	0.2
815	0.24
816	0.21
817	0.23
818	0.22
819	0.2
820	0.17
821	0.17
822	0.17
823	0.1
824	0.1
825	0.09
826	0.09
827	0.08
828	0.09
829	0.1
830	0.1
831	0.11
832	0.16
833	0.14
834	0.16
835	0.17
836	0.18
837	0.24
838	0.3
839	0.4
840	0.4
841	0.42
842	0.4
843	0.42
844	0.4
845	0.35
846	0.3
847	0.23
848	0.17
849	0.15
850	0.14
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.09
855	0.06
856	0.07
857	0.09
858	0.09
859	0.11
860	0.12
861	0.11
862	0.12
863	0.15
864	0.17
865	0.21
866	0.21
867	0.19
868	0.2
869	0.2
870	0.21
871	0.2
872	0.2
873	0.14
874	0.19
875	0.19
876	0.18
877	0.18
878	0.17
879	0.15
880	0.13
881	0.13
882	0.08
883	0.07
884	0.06
885	0.06
886	0.05
887	0.05
888	0.05
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.03
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.05
897	0.05
898	0.06
899	0.08
900	0.12
901	0.12
902	0.14
903	0.15
904	0.16
905	0.19
906	0.23
907	0.24
908	0.22
909	0.21
910	0.19
911	0.19
912	0.18
913	0.19
914	0.17
915	0.15
916	0.14
917	0.14
918	0.16
919	0.16
920	0.15
921	0.15
922	0.12
923	0.13
924	0.12
925	0.12
926	0.1
927	0.1
928	0.1
929	0.07
930	0.07
931	0.06
932	0.1
933	0.17
934	0.25
935	0.32
936	0.4
937	0.46
938	0.54
939	0.64
940	0.7
941	0.71
942	0.69
943	0.7
944	0.69
945	0.66
946	0.59
947	0.48
948	0.39
949	0.31
950	0.25
951	0.17
952	0.09
953	0.05
954	0.05
955	0.06
956	0.08
957	0.08
958	0.1
959	0.12
960	0.16
961	0.16
962	0.17
963	0.18
964	0.18
965	0.18
966	0.19
967	0.22
968	0.25
969	0.32
970	0.37
971	0.36
972	0.35
973	0.37
974	0.38
975	0.38
976	0.39
977	0.35
978	0.35
979	0.41
980	0.42
981	0.47
982	0.46
983	0.42
984	0.36
985	0.38
986	0.37
987	0.31
988	0.36
989	0.31
990	0.3
991	0.29
992	0.28
993	0.22
994	0.18
995	0.2
996	0.12
997	0.1
998	0.09
999	0.09
1000	0.09
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.14
1008	0.18
1009	0.19
1010	0.22
1011	0.26
1012	0.33
1013	0.4
1014	0.47
1015	0.48
1016	0.47
1017	0.49
1018	0.47
1019	0.51
1020	0.48
1021	0.41
1022	0.38
1023	0.38
1024	0.36
1025	0.4
1026	0.46
1027	0.42
1028	0.43
1029	0.44
1030	0.44
1031	0.39
1032	0.41
1033	0.36
1034	0.3
1035	0.27
1036	0.21
1037	0.2
1038	0.16
1039	0.17
1040	0.14
1041	0.14
1042	0.13
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.17
1046	0.22
1047	0.2
1048	0.2
1049	0.22
1050	0.31
1051	0.36
1052	0.4
1053	0.4
1054	0.45
1055	0.48
1056	0.5
1057	0.56
1058	0.54
1059	0.52
1060	0.54
1061	0.49
1062	0.41
1063	0.36
1064	0.35
1065	0.27
1066	0.19
1067	0.17
1068	0.12
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.12
1072	0.11
1073	0.1
1074	0.15
1075	0.19
1076	0.29
1077	0.32
1078	0.35
1079	0.39
1080	0.41
1081	0.47
1082	0.5
1083	0.55
1084	0.5
1085	0.52
1086	0.53
1087	0.52
1088	0.52
1089	0.47
1090	0.4
1091	0.3
1092	0.28
1093	0.23
1094	0.22
1095	0.18
1096	0.15
1097	0.15
1098	0.12
1099	0.15
1100	0.13
1101	0.14
1102	0.12
1103	0.12
1104	0.12
1105	0.13
1106	0.14
1107	0.12
1108	0.14
1109	0.12
1110	0.17
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.23
1114	0.21
1115	0.2
1116	0.19
1117	0.18
1118	0.14
1119	0.16
1120	0.16
1121	0.11
1122	0.13
1123	0.13
1124	0.15
1125	0.17
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.16
1129	0.18
1130	0.17
1131	0.17
1132	0.15
1133	0.14
1134	0.14
1135	0.12
1136	0.14
1137	0.14
1138	0.17
1139	0.18
1140	0.18
1141	0.18
1142	0.18
1143	0.19
1144	0.22
1145	0.22
1146	0.19
1147	0.19
1148	0.18
1149	0.17
1150	0.17
1151	0.18
1152	0.19
1153	0.23
1154	0.31
1155	0.33
1156	0.39
1157	0.4
1158	0.41
1159	0.44
1160	0.43
1161	0.38
1162	0.39
1163	0.45
1164	0.48
1165	0.51
1166	0.52
1167	0.48
1168	0.45
1169	0.47
1170	0.45
1171	0.41
1172	0.35
1173	0.31
1174	0.32
1175	0.4
1176	0.43
1177	0.46
1178	0.41
1179	0.42
1180	0.47
1181	0.55
1182	0.6
1183	0.62
1184	0.65
1185	0.69
1186	0.77
1187	0.81
1188	0.75
1189	0.69
1190	0.61
1191	0.55
1192	0.54
1193	0.44
1194	0.33
1195	0.28
1196	0.27
1197	0.3
1198	0.32
1199	0.29
1200	0.23
1201	0.27
1202	0.31
1203	0.3
1204	0.29
1205	0.29
1206	0.33
1207	0.38
1208	0.38
1209	0.37
1210	0.32
1211	0.3
1212	0.3
1213	0.25
1214	0.18
1215	0.11
1216	0.09
1217	0.08
1218	0.08
1219	0.07
1220	0.06
1221	0.06
1222	0.06
1223	0.06
1224	0.05
1225	0.05
1226	0.05
1227	0.04
1228	0.04
1229	0.04
1230	0.04
1231	0.04
1232	0.04
1233	0.04
1234	0.06
1235	0.07
1236	0.08
1237	0.08
1238	0.08
1239	0.1
1240	0.12
1241	0.13
1242	0.13
1243	0.12
1244	0.12
1245	0.12
1246	0.12
1247	0.12
1248	0.1
1249	0.1
1250	0.09
1251	0.1
1252	0.12
1253	0.12
1254	0.13
1255	0.17
1256	0.22
1257	0.23
1258	0.26
1259	0.28
1260	0.33
1261	0.36
1262	0.37
1263	0.37
1264	0.41
1265	0.42
1266	0.46
1267	0.44
1268	0.41
1269	0.43

C5DNP3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer