FuNGI

A0A5N5JMW5

Protein Details

Accession

A0A5N5JMW5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
458-480	DTPEPSKKSKKARVEAQPTPKTK	Hydrophilic
560-585	VEEPKTNGKAKKEKKSKTIKPEAASE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
125-154	KKKAAEPSKGAKLEKKLEASSDKSKAKAVK
429-447	AKKSKSKDADTTDKKKKRK
464-469	KKSKKA
566-582	NGKAKKEKKSKTIKPEA

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAGPKAPIGSLKGHAEKSSALARGASNNKLASTSAATKRANLKKEESESDSSSDSDSDASDSGDIDHDTVLREIASKASGPKSKAETKVSAPAAKKTALKKQDSSSDESSSESESDSDDESDDDKKKAAEPSKGAKLEKKLEASSDKSKAKAVKKTESEDESESDSSSSESSSESESEEEETPAKKAVAKPTETKKQSKPDASSSSSSSSEASSSDSDEEADESMAIDDRNGNNALVRNQVPEIVANEFHLRKAEDGTNAADVAQFFSEAKKEGKQIWYFTTPASIPIEVVEKLEIPLERAQKGQSILSHNGDDYGVAFEDAATSRAIKLLIPSKAGDKYRMLDAPVAQTMHLKRVTQFSQDGESTLSLTQTAAAPSRSYRPQPKGLKARFQPIGIPSSAPVKIGSDASDEDVDMAEAPALPSSQKTPAKKSKSKDADTTDKKKKRKLDVATDEPAADTPEPSKKSKKARVEAQPTPKTKPEISSSQPGKVTPILPPAVPSLRLPSSSQTAPASTPSSSKTSKAKAAAMEPTSSAVKKESAIPLPSNFRRSSSSFSSQAVEEPKTNGKAKKEKKSKTIKPEAASEAPKKTTPVPVPNFPSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.35
3	0.33
4	0.33
5	0.34
6	0.29
7	0.24
8	0.24
9	0.24
10	0.31
11	0.35
12	0.35
13	0.33
14	0.32
15	0.32
16	0.31
17	0.3
18	0.24
19	0.25
20	0.3
21	0.32
22	0.39
23	0.39
24	0.42
25	0.52
26	0.57
27	0.58
28	0.55
29	0.56
30	0.57
31	0.63
32	0.64
33	0.61
34	0.58
35	0.54
36	0.51
37	0.46
38	0.37
39	0.32
40	0.26
41	0.2
42	0.14
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.11
51	0.11
52	0.09
53	0.1
54	0.1
55	0.11
56	0.11
57	0.1
58	0.09
59	0.1
60	0.1
61	0.11
62	0.12
63	0.12
64	0.16
65	0.23
66	0.28
67	0.29
68	0.34
69	0.4
70	0.46
71	0.51
72	0.53
73	0.5
74	0.49
75	0.56
76	0.55
77	0.54
78	0.48
79	0.47
80	0.44
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.47
85	0.49
86	0.53
87	0.53
88	0.55
89	0.6
90	0.59
91	0.6
92	0.54
93	0.49
94	0.43
95	0.4
96	0.35
97	0.28
98	0.24
99	0.18
100	0.14
101	0.12
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.16
109	0.18
110	0.17
111	0.17
112	0.17
113	0.21
114	0.28
115	0.33
116	0.35
117	0.39
118	0.46
119	0.54
120	0.58
121	0.56
122	0.54
123	0.55
124	0.55
125	0.54
126	0.51
127	0.43
128	0.42
129	0.45
130	0.45
131	0.46
132	0.47
133	0.44
134	0.41
135	0.44
136	0.47
137	0.5
138	0.52
139	0.52
140	0.53
141	0.56
142	0.6
143	0.62
144	0.57
145	0.54
146	0.48
147	0.42
148	0.36
149	0.31
150	0.26
151	0.2
152	0.17
153	0.14
154	0.12
155	0.1
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.13
166	0.13
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.18
174	0.26
175	0.3
176	0.33
177	0.4
178	0.47
179	0.57
180	0.59
181	0.62
182	0.6
183	0.63
184	0.67
185	0.67
186	0.63
187	0.61
188	0.62
189	0.6
190	0.55
191	0.48
192	0.43
193	0.37
194	0.33
195	0.25
196	0.19
197	0.15
198	0.13
199	0.13
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.08
216	0.08
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.14
222	0.15
223	0.16
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.16
228	0.14
229	0.13
230	0.13
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.14
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.11
240	0.14
241	0.15
242	0.13
243	0.14
244	0.15
245	0.14
246	0.14
247	0.13
248	0.11
249	0.09
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.05
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.1
258	0.11
259	0.13
260	0.16
261	0.22
262	0.24
263	0.25
264	0.28
265	0.29
266	0.27
267	0.25
268	0.24
269	0.18
270	0.17
271	0.16
272	0.12
273	0.1
274	0.1
275	0.12
276	0.09
277	0.1
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.08
283	0.08
284	0.12
285	0.14
286	0.15
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.18
291	0.17
292	0.16
293	0.18
294	0.2
295	0.21
296	0.21
297	0.18
298	0.18
299	0.16
300	0.13
301	0.09
302	0.07
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.06
316	0.09
317	0.14
318	0.15
319	0.16
320	0.16
321	0.18
322	0.23
323	0.24
324	0.24
325	0.2
326	0.2
327	0.22
328	0.23
329	0.21
330	0.18
331	0.18
332	0.17
333	0.17
334	0.16
335	0.13
336	0.15
337	0.15
338	0.18
339	0.19
340	0.17
341	0.17
342	0.23
343	0.24
344	0.24
345	0.25
346	0.22
347	0.23
348	0.23
349	0.22
350	0.17
351	0.16
352	0.14
353	0.12
354	0.1
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.1
364	0.15
365	0.18
366	0.23
367	0.31
368	0.35
369	0.44
370	0.51
371	0.59
372	0.65
373	0.66
374	0.7
375	0.64
376	0.66
377	0.59
378	0.52
379	0.47
380	0.38
381	0.37
382	0.28
383	0.25
384	0.18
385	0.19
386	0.19
387	0.16
388	0.14
389	0.12
390	0.12
391	0.13
392	0.13
393	0.11
394	0.11
395	0.13
396	0.12
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.07
402	0.06
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.08
411	0.16
412	0.22
413	0.26
414	0.35
415	0.45
416	0.55
417	0.61
418	0.64
419	0.66
420	0.7
421	0.71
422	0.7
423	0.68
424	0.69
425	0.71
426	0.76
427	0.76
428	0.75
429	0.76
430	0.75
431	0.76
432	0.76
433	0.76
434	0.75
435	0.76
436	0.77
437	0.78
438	0.75
439	0.67
440	0.57
441	0.47
442	0.38
443	0.29
444	0.2
445	0.13
446	0.12
447	0.18
448	0.22
449	0.26
450	0.33
451	0.39
452	0.49
453	0.58
454	0.65
455	0.67
456	0.73
457	0.8
458	0.81
459	0.83
460	0.83
461	0.82
462	0.76
463	0.72
464	0.67
465	0.61
466	0.54
467	0.49
468	0.45
469	0.43
470	0.45
471	0.5
472	0.49
473	0.49
474	0.49
475	0.44
476	0.42
477	0.37
478	0.33
479	0.26
480	0.29
481	0.26
482	0.24
483	0.25
484	0.26
485	0.26
486	0.26
487	0.23
488	0.23
489	0.24
490	0.26
491	0.26
492	0.25
493	0.28
494	0.27
495	0.3
496	0.25
497	0.25
498	0.24
499	0.25
500	0.24
501	0.2
502	0.21
503	0.21
504	0.25
505	0.26
506	0.29
507	0.34
508	0.37
509	0.43
510	0.45
511	0.46
512	0.44
513	0.47
514	0.5
515	0.44
516	0.4
517	0.34
518	0.32
519	0.31
520	0.27
521	0.24
522	0.18
523	0.17
524	0.17
525	0.23
526	0.27
527	0.3
528	0.34
529	0.36
530	0.39
531	0.47
532	0.51
533	0.51
534	0.46
535	0.43
536	0.44
537	0.44
538	0.46
539	0.45
540	0.46
541	0.43
542	0.44
543	0.44
544	0.39
545	0.4
546	0.38
547	0.33
548	0.28
549	0.29
550	0.33
551	0.37
552	0.43
553	0.44
554	0.48
555	0.56
556	0.64
557	0.71
558	0.76
559	0.79
560	0.83
561	0.88
562	0.89
563	0.89
564	0.91
565	0.88
566	0.81
567	0.79
568	0.76
569	0.72
570	0.7
571	0.65
572	0.6
573	0.55
574	0.53
575	0.48
576	0.45
577	0.47
578	0.47
579	0.52
580	0.53
581	0.58

A0A5N5JMW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer