Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5Q016

Protein Details
Accession A0A5N5Q016    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-283VEVPKQKKVPEKPKVEEKKGPLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-275KKVPEKPK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019364  Mediatior_Med8_fun/met  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10232  Med8  
Amino Acid Sequences MSTLDLNPDEFRSLESLRQRLATLTANLKSLQDNVARSNPLPSPSSLQASARIAQHNLHSLQALLSDKQDLFSRLAVHPSTNFPGREHEMILQTFLRKRLEPDVEGWVEQAKEIAVRAGVEGGLKGGPGGGKGGGGGGGGKEEAGEDEEDEDEDEEGYRPEEDEDEDGGDRDALADLWGDVRDALMRRVRGFVEEESQDVYTAEERELGVERVRTGLRRDLEEDDEEESDEEEEGGEGGDTQGRGQDEGEDEDVVMLGPGGVEVPKQKKVPEKPKVEEKKGPLAEPEHALWFGVRADTGVPNNLRAAAGGVAAAAGMNGLPLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.33
4 0.33
5 0.35
6 0.34
7 0.31
8 0.32
9 0.31
10 0.28
11 0.31
12 0.31
13 0.31
14 0.31
15 0.3
16 0.28
17 0.25
18 0.25
19 0.23
20 0.23
21 0.26
22 0.31
23 0.32
24 0.31
25 0.34
26 0.31
27 0.3
28 0.3
29 0.27
30 0.28
31 0.29
32 0.33
33 0.3
34 0.29
35 0.31
36 0.31
37 0.33
38 0.31
39 0.3
40 0.27
41 0.27
42 0.28
43 0.29
44 0.27
45 0.24
46 0.21
47 0.18
48 0.17
49 0.19
50 0.18
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.2
61 0.18
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.21
66 0.23
67 0.25
68 0.26
69 0.26
70 0.23
71 0.28
72 0.31
73 0.31
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.25
78 0.26
79 0.22
80 0.21
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.2
85 0.23
86 0.29
87 0.32
88 0.3
89 0.3
90 0.33
91 0.32
92 0.31
93 0.28
94 0.22
95 0.18
96 0.16
97 0.13
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.1
172 0.12
173 0.14
174 0.14
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.21
204 0.22
205 0.23
206 0.26
207 0.27
208 0.29
209 0.29
210 0.27
211 0.23
212 0.21
213 0.19
214 0.16
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.14
236 0.15
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.07
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.11
251 0.16
252 0.21
253 0.23
254 0.28
255 0.37
256 0.48
257 0.58
258 0.62
259 0.67
260 0.69
261 0.78
262 0.85
263 0.83
264 0.8
265 0.75
266 0.76
267 0.69
268 0.63
269 0.57
270 0.5
271 0.45
272 0.41
273 0.37
274 0.29
275 0.26
276 0.24
277 0.2
278 0.17
279 0.15
280 0.12
281 0.1
282 0.08
283 0.1
284 0.13
285 0.15
286 0.21
287 0.21
288 0.22
289 0.23
290 0.24
291 0.22
292 0.18
293 0.18
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.04
302 0.03
303 0.02
304 0.03