Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DC45

Protein Details
Accession C5DC45    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-100QEKLERLKKLRASKKSKHKTGVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-96KLERLKKLRASKKSKHK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG lth:KLTH0A07700g  -  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MASESSDSEGYISEDDHDVLLVDKRKFQGKDVFDDQIDSEEEDSEVDTAGQVSKSRKKASAHELEENPKPVSSEDIKQEKLERLKKLRASKKSKHKTGVVYLSKIPPYMKPAKMRQILSRFGEVDRLFLKREDEQRHKNRVKGGGNKKVMFEEGWAEFVRKKDAKLCASTLNGNILGGKKGSFYHDDVMNVKYLSGFKWADLTEQIARENDVRQAKLQLEVSQANKMNAEFIRNIEKSKMLNNIRSKKRSNVSEATSNENSDSQPAPAHFKQRKVTTNRASGPEHLKKASSGRLEGVIKNLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.11
5 0.09
6 0.1
7 0.15
8 0.2
9 0.2
10 0.24
11 0.27
12 0.35
13 0.36
14 0.4
15 0.44
16 0.42
17 0.49
18 0.5
19 0.51
20 0.43
21 0.43
22 0.38
23 0.31
24 0.28
25 0.2
26 0.16
27 0.12
28 0.12
29 0.1
30 0.11
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.11
39 0.17
40 0.25
41 0.32
42 0.36
43 0.41
44 0.44
45 0.51
46 0.58
47 0.62
48 0.6
49 0.61
50 0.62
51 0.61
52 0.61
53 0.56
54 0.47
55 0.37
56 0.32
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.24
61 0.29
62 0.34
63 0.35
64 0.36
65 0.4
66 0.41
67 0.46
68 0.48
69 0.48
70 0.49
71 0.56
72 0.61
73 0.68
74 0.71
75 0.72
76 0.75
77 0.76
78 0.81
79 0.84
80 0.84
81 0.81
82 0.77
83 0.73
84 0.71
85 0.72
86 0.65
87 0.57
88 0.52
89 0.49
90 0.43
91 0.38
92 0.31
93 0.22
94 0.25
95 0.3
96 0.33
97 0.36
98 0.42
99 0.5
100 0.55
101 0.56
102 0.56
103 0.54
104 0.55
105 0.5
106 0.47
107 0.38
108 0.32
109 0.36
110 0.28
111 0.25
112 0.2
113 0.19
114 0.17
115 0.17
116 0.19
117 0.17
118 0.25
119 0.31
120 0.38
121 0.47
122 0.54
123 0.64
124 0.65
125 0.64
126 0.61
127 0.61
128 0.6
129 0.6
130 0.61
131 0.6
132 0.62
133 0.6
134 0.56
135 0.48
136 0.42
137 0.32
138 0.23
139 0.16
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.18
147 0.16
148 0.17
149 0.2
150 0.27
151 0.29
152 0.31
153 0.32
154 0.29
155 0.3
156 0.31
157 0.26
158 0.21
159 0.18
160 0.15
161 0.14
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.16
172 0.18
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.19
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.18
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.14
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.19
198 0.21
199 0.21
200 0.21
201 0.24
202 0.23
203 0.26
204 0.26
205 0.22
206 0.22
207 0.25
208 0.25
209 0.28
210 0.29
211 0.26
212 0.25
213 0.23
214 0.23
215 0.2
216 0.22
217 0.17
218 0.17
219 0.25
220 0.25
221 0.27
222 0.24
223 0.27
224 0.25
225 0.28
226 0.35
227 0.32
228 0.4
229 0.49
230 0.57
231 0.64
232 0.7
233 0.7
234 0.69
235 0.72
236 0.7
237 0.68
238 0.65
239 0.62
240 0.63
241 0.61
242 0.6
243 0.53
244 0.47
245 0.4
246 0.34
247 0.29
248 0.23
249 0.22
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.25
254 0.27
255 0.37
256 0.39
257 0.46
258 0.53
259 0.58
260 0.66
261 0.66
262 0.73
263 0.72
264 0.76
265 0.75
266 0.72
267 0.67
268 0.64
269 0.66
270 0.64
271 0.6
272 0.53
273 0.48
274 0.46
275 0.48
276 0.5
277 0.45
278 0.39
279 0.36
280 0.41
281 0.43
282 0.41