Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNF6

Protein Details
Accession C5DNF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-98LEDAPKSRTKKKKGKERDPNLPKRPTNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-94KSRTKKKKGKERDPNLPK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG lth:KLTH0G16566g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSDADLKRSLGDLQESNQVLALAVQRTRLAVKRLRLEYGTLLERLESRIDKDPELCYEDPLPSLESFKSQILEDAPKSRTKKKKGKERDPNLPKRPTNAYLLFCEMNKEKMKQSSGANDVSKALTDAWKGLDENARRPYYDLYNEDRDRYQREMQAYAQSKTEDRKPLKKGEEEDEDEIEEDDDTDETQPDVDATTDLPTSEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.27
4 0.26
5 0.23
6 0.18
7 0.17
8 0.18
9 0.14
10 0.13
11 0.15
12 0.14
13 0.16
14 0.19
15 0.22
16 0.25
17 0.29
18 0.36
19 0.43
20 0.46
21 0.48
22 0.45
23 0.44
24 0.4
25 0.39
26 0.34
27 0.25
28 0.23
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.15
34 0.16
35 0.24
36 0.26
37 0.26
38 0.28
39 0.29
40 0.28
41 0.33
42 0.3
43 0.24
44 0.23
45 0.23
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.13
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.17
60 0.17
61 0.2
62 0.21
63 0.26
64 0.3
65 0.38
66 0.44
67 0.51
68 0.59
69 0.64
70 0.73
71 0.78
72 0.85
73 0.87
74 0.86
75 0.87
76 0.89
77 0.9
78 0.87
79 0.83
80 0.73
81 0.66
82 0.63
83 0.54
84 0.49
85 0.43
86 0.37
87 0.3
88 0.32
89 0.28
90 0.23
91 0.23
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.23
98 0.25
99 0.25
100 0.26
101 0.27
102 0.28
103 0.31
104 0.29
105 0.25
106 0.25
107 0.22
108 0.19
109 0.14
110 0.11
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.17
119 0.17
120 0.23
121 0.29
122 0.29
123 0.28
124 0.3
125 0.31
126 0.3
127 0.34
128 0.32
129 0.31
130 0.39
131 0.4
132 0.4
133 0.4
134 0.38
135 0.36
136 0.37
137 0.37
138 0.32
139 0.34
140 0.35
141 0.35
142 0.41
143 0.41
144 0.36
145 0.33
146 0.3
147 0.3
148 0.31
149 0.36
150 0.36
151 0.39
152 0.47
153 0.5
154 0.58
155 0.63
156 0.65
157 0.63
158 0.61
159 0.63
160 0.59
161 0.57
162 0.49
163 0.43
164 0.36
165 0.32
166 0.25
167 0.16
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.1