Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5N0D4

Protein Details
Accession A0A5N5N0D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-265RSEGERSRSRSRSRSYNRSRSPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-154RKLRRKGR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.832, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKHNQTHHQADERRFLDERGSSAALAPNGLNPATILEKAVRERIVDSYFYKEQCFGVNEADVVDRVVAYVDFIGGTYGSTQKPSPFLCLAFKLLQLAPSDAILKEYLEYGGEKFKYLRALAVFYVRLTRTAKDVYTTLEPYLEDRRKLRRKGRAGTSLTFVDVFVDDLLTKERVCGTSLWKMPKRDVLEDLEVLEPRVSPLGDIEDLLEDEGKNGDVPSSREETPAGMDVDEDERGEKEGSRSEGERSRSRSRSRSYNRSRSPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.52
3 0.45
4 0.41
5 0.36
6 0.33
7 0.29
8 0.29
9 0.24
10 0.25
11 0.28
12 0.22
13 0.2
14 0.18
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.1
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.13
25 0.16
26 0.19
27 0.23
28 0.22
29 0.2
30 0.22
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.24
35 0.27
36 0.3
37 0.3
38 0.3
39 0.26
40 0.24
41 0.25
42 0.26
43 0.2
44 0.19
45 0.18
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.12
50 0.1
51 0.08
52 0.06
53 0.05
54 0.06
55 0.05
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.08
66 0.08
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.16
71 0.17
72 0.2
73 0.19
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.25
78 0.22
79 0.22
80 0.2
81 0.18
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.1
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.06
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.12
107 0.14
108 0.14
109 0.16
110 0.15
111 0.12
112 0.14
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.23
133 0.34
134 0.42
135 0.5
136 0.56
137 0.58
138 0.64
139 0.7
140 0.75
141 0.74
142 0.7
143 0.63
144 0.58
145 0.49
146 0.4
147 0.32
148 0.24
149 0.15
150 0.1
151 0.09
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.22
166 0.27
167 0.35
168 0.39
169 0.41
170 0.42
171 0.48
172 0.47
173 0.42
174 0.41
175 0.37
176 0.35
177 0.33
178 0.33
179 0.27
180 0.23
181 0.21
182 0.17
183 0.12
184 0.09
185 0.1
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.12
206 0.16
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.22
214 0.18
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.19
228 0.22
229 0.25
230 0.26
231 0.31
232 0.36
233 0.41
234 0.46
235 0.48
236 0.55
237 0.59
238 0.66
239 0.69
240 0.7
241 0.74
242 0.77
243 0.81
244 0.82
245 0.85