Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNL3

Protein Details
Accession C5DNL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-163SNDVMRTRRIAQPRKKRQLGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-157K
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.333, nucl 12, mito 11.5, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015007  NUP2/50/61  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR000156  Ran_bind_dom  
IPR045255  RanBP1-like  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0046907  P:intracellular transport  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG lth:KLTH0G17974g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08911  NUP50  
PF00638  Ran_BP1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50196  RANBD1  
Amino Acid Sequences MFGCNSHRSCSRDKCLKLMHITYYVYVAWSSENLDIFHSAQYSVTAITLRSCCVCRGSTPRSGIDFCRASARDIFLVDRLQNVKSVLDSFDGSSQGFLKLVTTPFRAMAKRIADAQITRESLATDADDQEVDLEPSNGFKKASNDVMRTRRIAQPRKKRQLGAGAGTSAESSMANAFSFSGGPSSTAGAGASRATTSDAAQGARRKALNLQFQAKIAQFIAADPCADLSSVFAQYQKYFRDTQSAEKPAAQPAAEIAAKPAAKPAAKPAAPAAKSDSESDSDDGDVKVQGPTFTLTQKPTTTSSVFSFGPKKPAKRDPSDSESEVEIKGPQFTFQNNAASKPSDSVFKLKPEATEADSKPSETSEKAKGQAQPHQPKFSFGAEKATKPAFTFGKPAAVEDKPTQEKPAFSFSFGANKTSDDSSKTASALGSSSEPSKPDTEQKAAPFSFSKSSAAPAQEANPKPFSFSQPAATANKQDGSVKPSFTFGQPAADKPKPSFTFGAPGNASAASGEAQKDGSGEKPKPFTFGASSSPAAPSFSFGKPAAAAASKEPPSGGFKFSLPFSSNTSAPAAGQNASQSTEANGSEPAATEKAEAAPETKPEAASEPKADTEQGQAMVMSNGEEAENLLFSKRAKLMVINPETKAYESRGVGELKLLQNKDDKAKVRILCRSDGMGHILLNTKVVKSFQYTPADADKENFVKCPVVNADGKLENYIIRVKQKADGRQLCKSISDAQESM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.7
3 0.73
4 0.72
5 0.67
6 0.62
7 0.57
8 0.56
9 0.47
10 0.42
11 0.34
12 0.26
13 0.21
14 0.16
15 0.12
16 0.11
17 0.13
18 0.13
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.18
24 0.19
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.14
29 0.13
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.14
35 0.15
36 0.16
37 0.18
38 0.2
39 0.21
40 0.24
41 0.25
42 0.27
43 0.35
44 0.39
45 0.44
46 0.47
47 0.5
48 0.51
49 0.53
50 0.49
51 0.49
52 0.44
53 0.37
54 0.41
55 0.37
56 0.35
57 0.36
58 0.36
59 0.29
60 0.29
61 0.3
62 0.23
63 0.26
64 0.24
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.24
69 0.23
70 0.21
71 0.19
72 0.2
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.12
87 0.15
88 0.18
89 0.2
90 0.21
91 0.23
92 0.29
93 0.29
94 0.28
95 0.32
96 0.32
97 0.31
98 0.33
99 0.33
100 0.31
101 0.31
102 0.33
103 0.32
104 0.29
105 0.28
106 0.25
107 0.22
108 0.19
109 0.19
110 0.16
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.18
128 0.22
129 0.31
130 0.35
131 0.38
132 0.46
133 0.52
134 0.54
135 0.54
136 0.52
137 0.5
138 0.54
139 0.6
140 0.62
141 0.66
142 0.73
143 0.81
144 0.83
145 0.79
146 0.76
147 0.75
148 0.71
149 0.65
150 0.56
151 0.46
152 0.4
153 0.37
154 0.3
155 0.2
156 0.13
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.18
188 0.23
189 0.23
190 0.26
191 0.26
192 0.23
193 0.29
194 0.35
195 0.4
196 0.4
197 0.44
198 0.41
199 0.41
200 0.44
201 0.37
202 0.31
203 0.23
204 0.18
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.18
223 0.18
224 0.2
225 0.21
226 0.21
227 0.28
228 0.28
229 0.34
230 0.39
231 0.4
232 0.38
233 0.39
234 0.39
235 0.34
236 0.34
237 0.26
238 0.17
239 0.15
240 0.17
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.21
252 0.26
253 0.26
254 0.27
255 0.29
256 0.34
257 0.34
258 0.34
259 0.32
260 0.27
261 0.28
262 0.29
263 0.26
264 0.2
265 0.21
266 0.21
267 0.17
268 0.14
269 0.14
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.14
282 0.15
283 0.17
284 0.18
285 0.2
286 0.21
287 0.23
288 0.22
289 0.21
290 0.21
291 0.22
292 0.21
293 0.22
294 0.24
295 0.22
296 0.3
297 0.32
298 0.35
299 0.38
300 0.47
301 0.51
302 0.53
303 0.6
304 0.57
305 0.59
306 0.6
307 0.54
308 0.46
309 0.4
310 0.34
311 0.27
312 0.2
313 0.15
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.13
321 0.14
322 0.21
323 0.19
324 0.21
325 0.21
326 0.21
327 0.21
328 0.19
329 0.17
330 0.14
331 0.14
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.23
336 0.22
337 0.22
338 0.22
339 0.22
340 0.2
341 0.25
342 0.23
343 0.25
344 0.24
345 0.24
346 0.22
347 0.21
348 0.2
349 0.14
350 0.17
351 0.18
352 0.2
353 0.22
354 0.25
355 0.29
356 0.31
357 0.37
358 0.44
359 0.48
360 0.49
361 0.53
362 0.49
363 0.47
364 0.46
365 0.42
366 0.35
367 0.25
368 0.31
369 0.27
370 0.27
371 0.28
372 0.26
373 0.23
374 0.2
375 0.24
376 0.16
377 0.16
378 0.18
379 0.16
380 0.2
381 0.2
382 0.2
383 0.2
384 0.19
385 0.21
386 0.19
387 0.24
388 0.22
389 0.23
390 0.25
391 0.22
392 0.23
393 0.22
394 0.29
395 0.23
396 0.21
397 0.22
398 0.2
399 0.26
400 0.25
401 0.25
402 0.17
403 0.17
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.15
412 0.14
413 0.13
414 0.12
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.2
426 0.24
427 0.26
428 0.28
429 0.3
430 0.34
431 0.32
432 0.33
433 0.27
434 0.25
435 0.24
436 0.22
437 0.21
438 0.15
439 0.18
440 0.19
441 0.19
442 0.17
443 0.16
444 0.18
445 0.25
446 0.26
447 0.27
448 0.27
449 0.26
450 0.28
451 0.29
452 0.29
453 0.26
454 0.25
455 0.25
456 0.24
457 0.28
458 0.29
459 0.28
460 0.26
461 0.22
462 0.22
463 0.19
464 0.2
465 0.18
466 0.21
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.21
471 0.22
472 0.2
473 0.22
474 0.16
475 0.2
476 0.2
477 0.22
478 0.28
479 0.29
480 0.3
481 0.28
482 0.37
483 0.32
484 0.35
485 0.34
486 0.28
487 0.32
488 0.31
489 0.36
490 0.27
491 0.25
492 0.23
493 0.2
494 0.19
495 0.12
496 0.12
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.12
506 0.18
507 0.21
508 0.24
509 0.3
510 0.3
511 0.33
512 0.33
513 0.31
514 0.27
515 0.27
516 0.27
517 0.25
518 0.26
519 0.23
520 0.24
521 0.21
522 0.19
523 0.17
524 0.15
525 0.15
526 0.15
527 0.18
528 0.17
529 0.18
530 0.17
531 0.17
532 0.17
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.2
537 0.2
538 0.2
539 0.19
540 0.19
541 0.22
542 0.23
543 0.23
544 0.18
545 0.18
546 0.2
547 0.21
548 0.23
549 0.2
550 0.2
551 0.23
552 0.25
553 0.24
554 0.24
555 0.25
556 0.21
557 0.19
558 0.2
559 0.16
560 0.14
561 0.14
562 0.13
563 0.13
564 0.14
565 0.14
566 0.12
567 0.11
568 0.14
569 0.13
570 0.13
571 0.12
572 0.11
573 0.11
574 0.11
575 0.12
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.11
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.17
587 0.17
588 0.16
589 0.16
590 0.2
591 0.22
592 0.24
593 0.25
594 0.24
595 0.24
596 0.25
597 0.25
598 0.22
599 0.21
600 0.2
601 0.18
602 0.16
603 0.15
604 0.15
605 0.14
606 0.13
607 0.1
608 0.07
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.07
615 0.06
616 0.07
617 0.08
618 0.09
619 0.14
620 0.16
621 0.17
622 0.18
623 0.21
624 0.28
625 0.37
626 0.44
627 0.43
628 0.42
629 0.43
630 0.43
631 0.41
632 0.35
633 0.29
634 0.28
635 0.24
636 0.26
637 0.28
638 0.28
639 0.26
640 0.27
641 0.29
642 0.28
643 0.34
644 0.32
645 0.3
646 0.35
647 0.39
648 0.43
649 0.45
650 0.44
651 0.42
652 0.49
653 0.52
654 0.54
655 0.58
656 0.55
657 0.51
658 0.49
659 0.48
660 0.42
661 0.39
662 0.36
663 0.29
664 0.25
665 0.23
666 0.24
667 0.21
668 0.22
669 0.21
670 0.17
671 0.17
672 0.18
673 0.19
674 0.21
675 0.27
676 0.32
677 0.38
678 0.38
679 0.4
680 0.46
681 0.47
682 0.42
683 0.38
684 0.37
685 0.35
686 0.35
687 0.32
688 0.27
689 0.27
690 0.27
691 0.31
692 0.27
693 0.29
694 0.31
695 0.31
696 0.35
697 0.35
698 0.36
699 0.31
700 0.29
701 0.24
702 0.23
703 0.27
704 0.26
705 0.29
706 0.32
707 0.32
708 0.39
709 0.46
710 0.52
711 0.57
712 0.62
713 0.62
714 0.67
715 0.69
716 0.64
717 0.58
718 0.52
719 0.49
720 0.45