Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHS9

Protein Details
Accession C5DHS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-39HIKQHGRRLDHDERKRKREARESHKVAERABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-78HDERKRKREARESHKVAERAQKLTGWKGKQFAKKRYAEKVAMRKKIKAHEESKAKGSGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lth:KLTH0E06842g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MPQNEYIEQHIKQHGRRLDHDERKRKREARESHKVAERAQKLTGWKGKQFAKKRYAEKVAMRKKIKAHEESKAKGSGKPLEESGEALPTYLLEREQANSAKAISSSIKQKRLEKADKFSVPLPKVRGISEEEMFKVVKTGKSRSKSWKRMITKHTFVGDGFTRRPVKTERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVFLPILAVKKNPQSPMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGMVTSGGKVVWGKYAQITNEPDRDGCVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.56
4 0.6
5 0.63
6 0.67
7 0.74
8 0.76
9 0.8
10 0.8
11 0.85
12 0.82
13 0.81
14 0.81
15 0.81
16 0.8
17 0.82
18 0.82
19 0.79
20 0.8
21 0.73
22 0.68
23 0.67
24 0.61
25 0.53
26 0.48
27 0.43
28 0.39
29 0.45
30 0.48
31 0.43
32 0.42
33 0.46
34 0.52
35 0.58
36 0.64
37 0.65
38 0.67
39 0.7
40 0.73
41 0.75
42 0.74
43 0.72
44 0.72
45 0.73
46 0.73
47 0.74
48 0.71
49 0.67
50 0.65
51 0.67
52 0.66
53 0.63
54 0.59
55 0.58
56 0.64
57 0.62
58 0.6
59 0.58
60 0.51
61 0.44
62 0.44
63 0.42
64 0.36
65 0.34
66 0.31
67 0.27
68 0.26
69 0.26
70 0.22
71 0.17
72 0.14
73 0.12
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.1
91 0.11
92 0.2
93 0.26
94 0.33
95 0.36
96 0.41
97 0.46
98 0.54
99 0.61
100 0.56
101 0.57
102 0.57
103 0.55
104 0.52
105 0.48
106 0.46
107 0.38
108 0.37
109 0.33
110 0.29
111 0.29
112 0.27
113 0.26
114 0.22
115 0.23
116 0.21
117 0.19
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.13
125 0.15
126 0.21
127 0.27
128 0.31
129 0.37
130 0.46
131 0.55
132 0.61
133 0.66
134 0.7
135 0.7
136 0.74
137 0.78
138 0.75
139 0.69
140 0.64
141 0.57
142 0.48
143 0.4
144 0.36
145 0.3
146 0.24
147 0.21
148 0.23
149 0.25
150 0.24
151 0.27
152 0.28
153 0.3
154 0.35
155 0.44
156 0.47
157 0.5
158 0.52
159 0.51
160 0.52
161 0.55
162 0.57
163 0.55
164 0.52
165 0.47
166 0.53
167 0.6
168 0.61
169 0.62
170 0.59
171 0.58
172 0.57
173 0.54
174 0.48
175 0.4
176 0.34
177 0.25
178 0.17
179 0.11
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.09
187 0.12
188 0.19
189 0.23
190 0.27
191 0.29
192 0.32
193 0.33
194 0.39
195 0.41
196 0.35
197 0.31
198 0.32
199 0.32
200 0.28
201 0.25
202 0.18
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.09
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.19
229 0.24
230 0.25
231 0.3
232 0.36
233 0.36
234 0.4
235 0.4
236 0.36
237 0.35
238 0.35
239 0.3
240 0.25
241 0.2