Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBM0

Protein Details
Accession C5DBM0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-29GGLLTRFARMRKKPQQPLTDLTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-314TKKIVPKAAPKAASRP
325-333VPAAKPKTR
362-371KRVVRKNTPA
373-374AK
379-395LPSRTPGKPPPSKKGGT
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR015415  Spast_Vps4_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
KEGG lth:KLTH0A03696g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF09336  Vps4_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
CDD cd19509  RecA-like_VPS4-like  
Amino Acid Sequences MDASKEGGLLTRFARMRKKPQQPLTDLTELYSQIANESIYYLKLEEKHEYKKAVLGWKALNTHVLYELTQIEYHYPNTGAYTRDEISIQNGVRELYHRSLSHLERVSKLCQEDEKSHEHYKPHSSSLPGRPRPPTANSRSMLKTLREPGRLKYNRNHPSSAPNITSPTSRSNSNVNFTTSKPLGHDNVFQGFDEDHNLIEFSDDEPAAKLEEDAKSDTKSDITFDFDVHDYFDDYLDMDQEELKRLETLNNLEGVQKSVGNMSIESSALDPKIKEKPSVTKSAQTSATVPKEKVMHKTTKKIVPKAAPKAASRPGVSTQTTRSRVPAAKPKTRPTVKAAQSTPVLRSRVASPPPKSSALINKRVVRKNTPAAAKTSESLPSRTPGKPPPSKKGGTVAAKNASNGTKKQPAKTATPTSSINSNSSASRKRLLKSPTPPPVAPTESAPKESEVSPDDEKILKEALEDELIDQMRGIDKTAAKQIFSEIVVHGDEVHWDDIAGLESAKSSLKEAVVYPFLRPDLFRGLREPVRGMLLFGPPGTGKTMLARAVATESNSTFFSISASSLTSKYLGESEKLVRALFAIAKKLSPSIVFVDEIDSIMGSRNNDGENESSRRIKNEFLIQWSSLSNAAAGNKEGSEDEEDERVLVLAATNLPWSIDEAARRRFVRRQYIPLPEPETRKKQMNKLLAHQTHTLTEEDFEELLALTDGYSGSDITSLAKDAAMGPLRELGDQLLFTPRDQIRPITLQDVKNSLEYIKPSVSKEGLTEYEDWAKKFGSSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.44
3 0.55
4 0.63
5 0.73
6 0.75
7 0.83
8 0.87
9 0.83
10 0.81
11 0.78
12 0.73
13 0.62
14 0.53
15 0.47
16 0.37
17 0.33
18 0.28
19 0.2
20 0.15
21 0.16
22 0.14
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.15
30 0.19
31 0.22
32 0.29
33 0.34
34 0.41
35 0.46
36 0.49
37 0.46
38 0.46
39 0.48
40 0.49
41 0.46
42 0.44
43 0.43
44 0.45
45 0.47
46 0.43
47 0.42
48 0.34
49 0.31
50 0.29
51 0.25
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.19
65 0.2
66 0.19
67 0.19
68 0.23
69 0.22
70 0.23
71 0.23
72 0.2
73 0.22
74 0.27
75 0.24
76 0.21
77 0.21
78 0.2
79 0.2
80 0.21
81 0.23
82 0.2
83 0.26
84 0.24
85 0.28
86 0.34
87 0.36
88 0.43
89 0.44
90 0.43
91 0.42
92 0.46
93 0.45
94 0.43
95 0.42
96 0.37
97 0.36
98 0.39
99 0.39
100 0.4
101 0.43
102 0.44
103 0.48
104 0.49
105 0.46
106 0.46
107 0.5
108 0.49
109 0.48
110 0.45
111 0.44
112 0.49
113 0.56
114 0.62
115 0.59
116 0.61
117 0.6
118 0.62
119 0.63
120 0.61
121 0.61
122 0.58
123 0.6
124 0.56
125 0.58
126 0.55
127 0.55
128 0.52
129 0.45
130 0.44
131 0.45
132 0.5
133 0.52
134 0.51
135 0.51
136 0.57
137 0.6
138 0.59
139 0.59
140 0.63
141 0.64
142 0.67
143 0.65
144 0.56
145 0.58
146 0.58
147 0.55
148 0.47
149 0.4
150 0.38
151 0.36
152 0.36
153 0.3
154 0.31
155 0.27
156 0.26
157 0.26
158 0.32
159 0.34
160 0.38
161 0.37
162 0.35
163 0.35
164 0.34
165 0.4
166 0.32
167 0.29
168 0.26
169 0.28
170 0.27
171 0.27
172 0.3
173 0.26
174 0.29
175 0.29
176 0.27
177 0.24
178 0.21
179 0.19
180 0.18
181 0.15
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.06
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.14
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.13
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.17
213 0.16
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.16
235 0.19
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.16
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.12
259 0.2
260 0.21
261 0.23
262 0.25
263 0.34
264 0.38
265 0.46
266 0.45
267 0.44
268 0.44
269 0.46
270 0.44
271 0.36
272 0.34
273 0.32
274 0.36
275 0.32
276 0.31
277 0.29
278 0.32
279 0.34
280 0.38
281 0.38
282 0.41
283 0.43
284 0.51
285 0.55
286 0.58
287 0.63
288 0.6
289 0.61
290 0.59
291 0.63
292 0.63
293 0.62
294 0.58
295 0.52
296 0.53
297 0.52
298 0.48
299 0.4
300 0.35
301 0.31
302 0.31
303 0.32
304 0.28
305 0.28
306 0.32
307 0.35
308 0.32
309 0.31
310 0.32
311 0.34
312 0.38
313 0.42
314 0.41
315 0.47
316 0.52
317 0.57
318 0.62
319 0.62
320 0.6
321 0.56
322 0.58
323 0.54
324 0.56
325 0.51
326 0.44
327 0.44
328 0.42
329 0.39
330 0.34
331 0.3
332 0.22
333 0.23
334 0.22
335 0.26
336 0.3
337 0.35
338 0.32
339 0.36
340 0.4
341 0.4
342 0.37
343 0.33
344 0.38
345 0.38
346 0.43
347 0.44
348 0.46
349 0.52
350 0.57
351 0.58
352 0.53
353 0.52
354 0.49
355 0.5
356 0.49
357 0.42
358 0.39
359 0.39
360 0.35
361 0.29
362 0.24
363 0.24
364 0.2
365 0.21
366 0.19
367 0.18
368 0.22
369 0.22
370 0.25
371 0.27
372 0.34
373 0.41
374 0.45
375 0.5
376 0.52
377 0.52
378 0.49
379 0.48
380 0.46
381 0.43
382 0.41
383 0.38
384 0.35
385 0.34
386 0.33
387 0.29
388 0.25
389 0.22
390 0.21
391 0.22
392 0.27
393 0.29
394 0.31
395 0.35
396 0.36
397 0.39
398 0.44
399 0.46
400 0.4
401 0.41
402 0.39
403 0.34
404 0.34
405 0.3
406 0.25
407 0.2
408 0.19
409 0.17
410 0.2
411 0.23
412 0.21
413 0.26
414 0.28
415 0.28
416 0.34
417 0.38
418 0.42
419 0.45
420 0.52
421 0.55
422 0.56
423 0.54
424 0.49
425 0.49
426 0.43
427 0.36
428 0.3
429 0.28
430 0.25
431 0.27
432 0.26
433 0.22
434 0.21
435 0.21
436 0.2
437 0.15
438 0.18
439 0.17
440 0.17
441 0.17
442 0.17
443 0.17
444 0.16
445 0.15
446 0.1
447 0.09
448 0.1
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.13
464 0.2
465 0.2
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.05
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.08
495 0.08
496 0.1
497 0.11
498 0.13
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.17
504 0.17
505 0.16
506 0.16
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.24
511 0.29
512 0.31
513 0.32
514 0.31
515 0.22
516 0.23
517 0.22
518 0.21
519 0.17
520 0.16
521 0.15
522 0.13
523 0.13
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.13
534 0.12
535 0.14
536 0.14
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.13
557 0.13
558 0.12
559 0.15
560 0.17
561 0.2
562 0.21
563 0.2
564 0.17
565 0.16
566 0.17
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.18
572 0.18
573 0.18
574 0.18
575 0.14
576 0.15
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.16
582 0.15
583 0.15
584 0.12
585 0.09
586 0.07
587 0.08
588 0.1
589 0.09
590 0.09
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.14
595 0.15
596 0.19
597 0.23
598 0.26
599 0.3
600 0.31
601 0.34
602 0.34
603 0.34
604 0.33
605 0.38
606 0.37
607 0.37
608 0.4
609 0.37
610 0.37
611 0.34
612 0.3
613 0.22
614 0.18
615 0.13
616 0.11
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.11
622 0.12
623 0.12
624 0.12
625 0.14
626 0.15
627 0.16
628 0.16
629 0.16
630 0.15
631 0.15
632 0.13
633 0.1
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.09
644 0.1
645 0.12
646 0.18
647 0.24
648 0.29
649 0.36
650 0.37
651 0.4
652 0.44
653 0.51
654 0.56
655 0.57
656 0.61
657 0.62
658 0.7
659 0.69
660 0.69
661 0.66
662 0.61
663 0.61
664 0.61
665 0.61
666 0.57
667 0.63
668 0.63
669 0.66
670 0.7
671 0.71
672 0.68
673 0.69
674 0.75
675 0.7
676 0.67
677 0.61
678 0.53
679 0.47
680 0.43
681 0.35
682 0.25
683 0.22
684 0.18
685 0.17
686 0.15
687 0.12
688 0.11
689 0.1
690 0.09
691 0.08
692 0.07
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.08
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.09
708 0.1
709 0.16
710 0.19
711 0.18
712 0.18
713 0.22
714 0.23
715 0.23
716 0.23
717 0.18
718 0.15
719 0.15
720 0.15
721 0.18
722 0.18
723 0.18
724 0.26
725 0.27
726 0.3
727 0.32
728 0.34
729 0.33
730 0.37
731 0.4
732 0.4
733 0.45
734 0.43
735 0.45
736 0.46
737 0.42
738 0.38
739 0.37
740 0.3
741 0.27
742 0.26
743 0.27
744 0.28
745 0.3
746 0.31
747 0.36
748 0.36
749 0.33
750 0.32
751 0.34
752 0.31
753 0.3
754 0.29
755 0.27
756 0.35
757 0.37
758 0.36
759 0.32
760 0.29
761 0.27