Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBD9

Protein Details
Accession C5DBD9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-331HVKAYVPREQREKRKEKWYSFLFNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, mito_nucl 12.666, cyto_mito 11.166, nucl 6, cyto_nucl 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003782  SCO1/SenC  
IPR036249  Thioredoxin-like_sf  
IPR013766  Thioredoxin_domain  
KEGG lth:KLTH0A01804g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02630  SCO1-SenC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51352  THIOREDOXIN_2  
CDD cd02968  SCO  
Amino Acid Sequences MLSRTGVFTVLKRSTRLSGYALRPLSTRSCLRVEDQGTSRSRVTPRGGAPSGASSSTDPSDQSAFSGNTPPKSTTFEDADPKRKPLSRIAIGGTETKSQKATSGSIEFATWKAAALVLTLGGTLYYFFSKEKRRLEIEKEAEANRGYGKPLVGGPFKLVDFNGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSHCPDICPDELDKLSEWLDGLKKKGIELQPIFITCDPARDPPHVLKEYLSEFHPDLIGLTGEYNDIKNACKQYRVYFSTPPSLKPGQDYLVDHSIFFYLMDPEGQFIDALGRQYDAETGVAKIEEHVKAYVPREQREKRKEKWYSFLFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.41
4 0.37
5 0.39
6 0.41
7 0.47
8 0.45
9 0.41
10 0.39
11 0.39
12 0.38
13 0.36
14 0.35
15 0.31
16 0.34
17 0.35
18 0.37
19 0.42
20 0.4
21 0.4
22 0.4
23 0.43
24 0.42
25 0.43
26 0.42
27 0.39
28 0.4
29 0.39
30 0.4
31 0.4
32 0.41
33 0.46
34 0.46
35 0.41
36 0.4
37 0.37
38 0.34
39 0.27
40 0.24
41 0.16
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.14
49 0.14
50 0.16
51 0.15
52 0.16
53 0.23
54 0.24
55 0.26
56 0.28
57 0.29
58 0.27
59 0.32
60 0.33
61 0.3
62 0.32
63 0.32
64 0.39
65 0.43
66 0.5
67 0.47
68 0.47
69 0.48
70 0.48
71 0.47
72 0.46
73 0.49
74 0.46
75 0.47
76 0.46
77 0.43
78 0.4
79 0.41
80 0.33
81 0.29
82 0.25
83 0.23
84 0.21
85 0.19
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.18
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.15
96 0.15
97 0.11
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.11
116 0.18
117 0.25
118 0.29
119 0.33
120 0.38
121 0.42
122 0.48
123 0.53
124 0.5
125 0.47
126 0.46
127 0.42
128 0.38
129 0.34
130 0.28
131 0.2
132 0.16
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.15
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.16
192 0.17
193 0.23
194 0.24
195 0.29
196 0.28
197 0.3
198 0.29
199 0.3
200 0.31
201 0.25
202 0.27
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.2
207 0.22
208 0.22
209 0.26
210 0.26
211 0.35
212 0.33
213 0.32
214 0.28
215 0.29
216 0.3
217 0.28
218 0.24
219 0.19
220 0.17
221 0.18
222 0.17
223 0.13
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.14
237 0.21
238 0.22
239 0.27
240 0.29
241 0.35
242 0.43
243 0.48
244 0.47
245 0.47
246 0.49
247 0.54
248 0.52
249 0.47
250 0.45
251 0.42
252 0.38
253 0.35
254 0.35
255 0.28
256 0.31
257 0.31
258 0.3
259 0.34
260 0.33
261 0.29
262 0.27
263 0.24
264 0.2
265 0.18
266 0.13
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.07
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.16
293 0.16
294 0.17
295 0.18
296 0.2
297 0.24
298 0.28
299 0.34
300 0.35
301 0.4
302 0.48
303 0.57
304 0.64
305 0.71
306 0.77
307 0.77
308 0.82
309 0.86
310 0.82
311 0.83