Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E2H8

Protein Details
Accession C5E2H8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
434-453RNVMRPYKSLRERKKKLLITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-448ERKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
KEGG lth:KLTH0H05060g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MNNWQLTFQSPVDLTEHLRKPYLLYDERDKNVTRTMFDEHANLVWAGDTYGRISSYDPSYSLYTRYAGHIGGLPVVDMLSHPGGVMSLSADSIHFASRQGVTRLNLTSADIAQLCEMKAMCFSSIAGNHVYCAGSNSGSGIIDIDLQKGALFNNIDYASKVKMMRSDNKTILIGKQTGTIDLLDQSSNQLIRSFAAHSATISDMDLRDNTLVTVGKSRRFNQMCSDPFVNVYDLRMMRQLTPVAFSHNQNIGSSGSAGADFVRLHPVLPTVMTVASTSGAFDFIDLADPTLRSQYCHPCHSISQFQLSPSGDYIAVLEHDNTISTWSRSGGMSGFTNSSAILEYPDYPDDGPPGNVSVNDESYPLSSVGMPYYSEKLLSSWPHVIFRSGGTLPRKMQDSGGLIQTPSSRLFQLSTHNSQTYSLVPYNTAKYGRRNVMRPYKSLRERKKKLLITDEDGTDKRELMRYKALNDYEVPPAYTKLQMVYGKYGVEDFDFKAFNKTQLSGLECDIENSYTNAILQLYRFVPEFYNFVVSCLREEPGPENSILAELGYLYDMMDKAKGVVCRSANFQKLLTSLPSAKDLGLLRDSLATELSDSLAGLDIDYHGNAMEAENKIAVPGTDVPQAFNKFLLSKLIAEEVQKKINTTHSIALEELVGIRLSTETRSISSCGSYERGTSIVPSLDVTSPATNNTKYSNKKLSNQTVLPYIESSMNRIRHKRALCEKCQKLENIEQEQTVRNLPPLLSLNICLSSSEWDIAKTVKNWLAKDFYATLSKDRPILKLHPTDLKTNSAIFKYDLNAYVARVTDDMSEPHLVTYAKVFDPKTKQDKWFMFNDYLVIEVDEDEALDITPWWKTPEILIYSDAEELRKPFVPVSSFRIDDSVLYRDYFANGIREGVKKEYQHLTASEAPQPGSLVAMDAEFVILADEEVEISCRGQRTLIKPKKTALARISVLRGDDGDDFGVPFIDDYVVNTNHIENYLTRYSGIEPGDLDPETSNKTLVPRQMVYRKIWLLLQMGCVFVGHGLYNDFRNISIYVPPEQIRDTALYFLQGKRYLALRFLAHALLDADVQSGNHDSIEDAYTALVIYKKYLQLESSNLFENTLNQLYEEGRACGFKVPGDRSVAPM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.36
4 0.34
5 0.36
6 0.34
7 0.34
8 0.39
9 0.43
10 0.4
11 0.4
12 0.47
13 0.54
14 0.56
15 0.59
16 0.54
17 0.48
18 0.5
19 0.47
20 0.39
21 0.34
22 0.36
23 0.35
24 0.34
25 0.34
26 0.28
27 0.26
28 0.26
29 0.22
30 0.17
31 0.14
32 0.12
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.17
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.22
46 0.25
47 0.26
48 0.27
49 0.25
50 0.22
51 0.22
52 0.24
53 0.23
54 0.19
55 0.19
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.06
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.06
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.13
84 0.16
85 0.21
86 0.23
87 0.27
88 0.27
89 0.32
90 0.32
91 0.31
92 0.28
93 0.25
94 0.24
95 0.19
96 0.21
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.16
111 0.17
112 0.19
113 0.2
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.19
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.2
145 0.17
146 0.2
147 0.22
148 0.18
149 0.24
150 0.31
151 0.39
152 0.44
153 0.51
154 0.49
155 0.51
156 0.51
157 0.47
158 0.43
159 0.39
160 0.34
161 0.26
162 0.29
163 0.26
164 0.25
165 0.24
166 0.2
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.11
200 0.19
201 0.21
202 0.27
203 0.32
204 0.35
205 0.43
206 0.45
207 0.46
208 0.46
209 0.53
210 0.5
211 0.51
212 0.5
213 0.4
214 0.39
215 0.38
216 0.31
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.22
226 0.24
227 0.18
228 0.21
229 0.2
230 0.24
231 0.26
232 0.26
233 0.28
234 0.29
235 0.29
236 0.26
237 0.28
238 0.21
239 0.19
240 0.18
241 0.13
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.19
281 0.28
282 0.32
283 0.36
284 0.38
285 0.36
286 0.4
287 0.44
288 0.45
289 0.37
290 0.38
291 0.36
292 0.34
293 0.35
294 0.33
295 0.28
296 0.22
297 0.21
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.11
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.13
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.15
365 0.15
366 0.17
367 0.21
368 0.22
369 0.24
370 0.25
371 0.25
372 0.21
373 0.2
374 0.21
375 0.16
376 0.21
377 0.21
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.29
382 0.25
383 0.25
384 0.23
385 0.24
386 0.22
387 0.23
388 0.21
389 0.18
390 0.18
391 0.18
392 0.16
393 0.14
394 0.13
395 0.11
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.2
400 0.24
401 0.27
402 0.29
403 0.3
404 0.29
405 0.29
406 0.29
407 0.23
408 0.21
409 0.18
410 0.15
411 0.16
412 0.17
413 0.18
414 0.2
415 0.21
416 0.2
417 0.24
418 0.3
419 0.36
420 0.39
421 0.41
422 0.47
423 0.55
424 0.55
425 0.53
426 0.54
427 0.56
428 0.61
429 0.66
430 0.68
431 0.69
432 0.72
433 0.78
434 0.8
435 0.76
436 0.72
437 0.71
438 0.65
439 0.59
440 0.55
441 0.47
442 0.41
443 0.36
444 0.33
445 0.24
446 0.2
447 0.15
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.25
452 0.24
453 0.27
454 0.32
455 0.32
456 0.28
457 0.29
458 0.28
459 0.24
460 0.23
461 0.21
462 0.15
463 0.16
464 0.16
465 0.15
466 0.12
467 0.1
468 0.14
469 0.16
470 0.16
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.08
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.15
484 0.15
485 0.16
486 0.16
487 0.17
488 0.16
489 0.18
490 0.2
491 0.17
492 0.17
493 0.16
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.11
498 0.1
499 0.09
500 0.08
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.09
516 0.13
517 0.12
518 0.13
519 0.14
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.08
525 0.1
526 0.11
527 0.12
528 0.13
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.1
534 0.07
535 0.04
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.2
554 0.25
555 0.25
556 0.24
557 0.24
558 0.2
559 0.2
560 0.2
561 0.17
562 0.14
563 0.13
564 0.13
565 0.14
566 0.13
567 0.12
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.13
572 0.12
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.08
577 0.08
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.05
606 0.07
607 0.08
608 0.12
609 0.12
610 0.13
611 0.17
612 0.19
613 0.17
614 0.16
615 0.15
616 0.12
617 0.12
618 0.14
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.12
623 0.12
624 0.13
625 0.17
626 0.17
627 0.2
628 0.19
629 0.19
630 0.19
631 0.23
632 0.25
633 0.23
634 0.24
635 0.21
636 0.22
637 0.22
638 0.21
639 0.16
640 0.12
641 0.1
642 0.07
643 0.05
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.05
648 0.05
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.1
653 0.11
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.13
659 0.12
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.11
665 0.1
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.08
671 0.09
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.12
676 0.14
677 0.13
678 0.14
679 0.17
680 0.24
681 0.27
682 0.34
683 0.41
684 0.43
685 0.5
686 0.58
687 0.61
688 0.6
689 0.57
690 0.52
691 0.47
692 0.44
693 0.37
694 0.29
695 0.22
696 0.19
697 0.18
698 0.2
699 0.21
700 0.27
701 0.31
702 0.34
703 0.38
704 0.41
705 0.44
706 0.49
707 0.54
708 0.56
709 0.61
710 0.68
711 0.68
712 0.65
713 0.66
714 0.58
715 0.53
716 0.51
717 0.5
718 0.45
719 0.42
720 0.38
721 0.36
722 0.36
723 0.32
724 0.27
725 0.19
726 0.14
727 0.14
728 0.13
729 0.14
730 0.15
731 0.15
732 0.14
733 0.15
734 0.15
735 0.15
736 0.15
737 0.12
738 0.1
739 0.11
740 0.12
741 0.12
742 0.11
743 0.1
744 0.11
745 0.12
746 0.14
747 0.12
748 0.16
749 0.2
750 0.23
751 0.24
752 0.26
753 0.29
754 0.26
755 0.29
756 0.26
757 0.23
758 0.24
759 0.24
760 0.24
761 0.23
762 0.24
763 0.26
764 0.26
765 0.26
766 0.26
767 0.3
768 0.34
769 0.36
770 0.38
771 0.41
772 0.42
773 0.45
774 0.43
775 0.42
776 0.36
777 0.33
778 0.33
779 0.25
780 0.25
781 0.2
782 0.19
783 0.17
784 0.18
785 0.17
786 0.17
787 0.16
788 0.16
789 0.17
790 0.15
791 0.14
792 0.12
793 0.11
794 0.1
795 0.11
796 0.11
797 0.12
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.14
802 0.12
803 0.12
804 0.13
805 0.13
806 0.13
807 0.17
808 0.18
809 0.22
810 0.29
811 0.37
812 0.43
813 0.47
814 0.5
815 0.55
816 0.6
817 0.57
818 0.56
819 0.52
820 0.46
821 0.4
822 0.37
823 0.27
824 0.23
825 0.19
826 0.14
827 0.09
828 0.07
829 0.08
830 0.06
831 0.06
832 0.05
833 0.05
834 0.05
835 0.05
836 0.05
837 0.05
838 0.05
839 0.06
840 0.09
841 0.09
842 0.09
843 0.11
844 0.18
845 0.2
846 0.21
847 0.22
848 0.21
849 0.21
850 0.23
851 0.22
852 0.16
853 0.14
854 0.14
855 0.16
856 0.16
857 0.16
858 0.15
859 0.18
860 0.21
861 0.22
862 0.28
863 0.3
864 0.29
865 0.28
866 0.29
867 0.25
868 0.23
869 0.23
870 0.2
871 0.16
872 0.16
873 0.17
874 0.16
875 0.16
876 0.16
877 0.15
878 0.14
879 0.14
880 0.15
881 0.17
882 0.19
883 0.21
884 0.24
885 0.28
886 0.26
887 0.31
888 0.35
889 0.34
890 0.34
891 0.32
892 0.33
893 0.34
894 0.36
895 0.35
896 0.31
897 0.29
898 0.26
899 0.26
900 0.2
901 0.15
902 0.12
903 0.08
904 0.07
905 0.06
906 0.06
907 0.05
908 0.05
909 0.04
910 0.04
911 0.04
912 0.04
913 0.03
914 0.04
915 0.04
916 0.04
917 0.04
918 0.06
919 0.06
920 0.06
921 0.09
922 0.1
923 0.1
924 0.14
925 0.2
926 0.27
927 0.38
928 0.47
929 0.52
930 0.54
931 0.58
932 0.63
933 0.61
934 0.61
935 0.54
936 0.53
937 0.48
938 0.49
939 0.49
940 0.42
941 0.39
942 0.31
943 0.26
944 0.2
945 0.18
946 0.15
947 0.13
948 0.11
949 0.11
950 0.1
951 0.1
952 0.07
953 0.07
954 0.06
955 0.06
956 0.06
957 0.08
958 0.14
959 0.14
960 0.15
961 0.16
962 0.16
963 0.16
964 0.17
965 0.16
966 0.11
967 0.17
968 0.19
969 0.18
970 0.18
971 0.19
972 0.2
973 0.24
974 0.24
975 0.18
976 0.17
977 0.19
978 0.21
979 0.2
980 0.19
981 0.14
982 0.16
983 0.19
984 0.18
985 0.17
986 0.15
987 0.2
988 0.24
989 0.28
990 0.32
991 0.31
992 0.4
993 0.47
994 0.51
995 0.5
996 0.54
997 0.5
998 0.45
999 0.44
1000 0.39
1001 0.35
1002 0.31
1003 0.32
1004 0.25
1005 0.23
1006 0.22
1007 0.2
1008 0.17
1009 0.13
1010 0.12
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.09
1014 0.11
1015 0.12
1016 0.14
1017 0.14
1018 0.13
1019 0.15
1020 0.15
1021 0.15
1022 0.18
1023 0.19
1024 0.21
1025 0.25
1026 0.26
1027 0.26
1028 0.27
1029 0.26
1030 0.24
1031 0.23
1032 0.21
1033 0.19
1034 0.18
1035 0.2
1036 0.22
1037 0.23
1038 0.27
1039 0.28
1040 0.27
1041 0.27
1042 0.31
1043 0.29
1044 0.29
1045 0.31
1046 0.26
1047 0.25
1048 0.26
1049 0.25
1050 0.2
1051 0.2
1052 0.18
1053 0.14
1054 0.13
1055 0.11
1056 0.09
1057 0.09
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.11
1061 0.1
1062 0.1
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.11
1066 0.13
1067 0.12
1068 0.1
1069 0.09
1070 0.09
1071 0.09
1072 0.1
1073 0.1
1074 0.09
1075 0.12
1076 0.16
1077 0.2
1078 0.23
1079 0.25
1080 0.26
1081 0.28
1082 0.34
1083 0.34
1084 0.33
1085 0.33
1086 0.3
1087 0.3
1088 0.27
1089 0.26
1090 0.26
1091 0.26
1092 0.23
1093 0.19
1094 0.2
1095 0.2
1096 0.24
1097 0.23
1098 0.19
1099 0.17
1100 0.18
1101 0.19
1102 0.22
1103 0.22
1104 0.21
1105 0.27
1106 0.3
1107 0.34
1108 0.4