Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMI2

Protein Details
Accession C5DMI2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
989-1011AVALDDKKRRVRKTCIDTRQAYFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039920  MET18/MMS19  
IPR024687  MMS19_C  
IPR029240  MMS19_N  
Gene Ontology GO:0097361  C:CIA complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0016226  P:iron-sulfur cluster assembly  
GO:0097428  P:protein maturation by iron-sulfur cluster transfer  
KEGG lth:KLTH0G09152g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12460  MMS19_C  
PF14500  MMS19_N  
Amino Acid Sequences MSHSYSSQNLRADVVSIIANVESDEAKALELSKKVALKVSEGQLKLVELVICLREYITSPEQIERQHALHCLSTILGELPKHTLLKNDVSVILDFYLGKFDDIYCMKETLYGLSHIVNMKCFYSNQVSSVLKPLKDDYQSTQYLAATRYYAFLVLQHLLEKFRESMSTNLPLNNLFIETFLSIAGGEKDPRNLLISFHLNSAISSALENISQYKEDLFDTLFCYFPITFKPPKNDPYRITNIDLKVALRSAISASPYFEEDAFGNLIDKMTASSPSVKNDTLLTMKACIERFGGEACIKNWVPIWNALKFEIMNNVDADESVTESNEPEFNNYEESLRIITSISAQLLNLKEGAFDKFQSHIFDELEPNFKYEKDLKQSSAILAAVARTNVTSFNKVMDDVLKLFFDNVSDLDVNKLKLLILNLSFFFDAYIEVFSPYSNKAQNKAVPDNKLAQYKDQILMILSKSLKGSSKSEVSLRTLSVVQLTKLVKMPGFLSGEEVSLIVQYLTETILTDDNKNVYFACLEGLKVTSDVSENSVVEISLNQMLKHLEKEGTHTVVLGEEEAVPVERILKVILDFTTSRHKLVVESIIGISNIICHFSKYVEEKEYCFMLVSCLYSLFDNNQEVLTNDVASHLKKSIETELLASSKNVAIYSDDHNLHLISAVFYFLNVNAPQANHQIELDRFLVLFTEDTKVLKSPARSVIIFAKLLSAFDKACKIPGGLLLNESIRLLKVQHEKCSEFEKLAYLELLAVLSNKWCTEDNVNANLDISNTALIDLEIEAWCTKGLAMKNSKLAETYTDKFVKLLGDADIGPASAKLFGVFVMDIPTLDRIKGISWNNNVRLLYKQKLFSDVAPKLVSGYSATSDMSLKANYLLALSLLLKNTPNKITINYIPNLLSLLLQAVQLNNSDVRVSALTTIRGTVNQASQLITEHIHSLIPLLMRLTNPDKHNAYLVRLTALEILRDFTDHVPLNYLLPYKDDIIKGLAVALDDKKRRVRKTCIDTRQAYFELGQVPFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.12
4 0.12
5 0.1
6 0.1
7 0.08
8 0.09
9 0.08
10 0.07
11 0.09
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.12
16 0.15
17 0.16
18 0.19
19 0.23
20 0.25
21 0.27
22 0.31
23 0.3
24 0.3
25 0.36
26 0.41
27 0.44
28 0.41
29 0.41
30 0.37
31 0.36
32 0.32
33 0.27
34 0.2
35 0.12
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.13
41 0.11
42 0.13
43 0.19
44 0.2
45 0.23
46 0.25
47 0.28
48 0.32
49 0.33
50 0.36
51 0.33
52 0.31
53 0.3
54 0.31
55 0.3
56 0.28
57 0.27
58 0.22
59 0.18
60 0.17
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.16
67 0.19
68 0.21
69 0.2
70 0.23
71 0.25
72 0.31
73 0.33
74 0.31
75 0.3
76 0.3
77 0.3
78 0.26
79 0.22
80 0.16
81 0.14
82 0.11
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.16
89 0.18
90 0.21
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.19
97 0.19
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.2
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.21
107 0.22
108 0.21
109 0.23
110 0.26
111 0.26
112 0.25
113 0.31
114 0.31
115 0.31
116 0.39
117 0.4
118 0.32
119 0.33
120 0.34
121 0.34
122 0.36
123 0.38
124 0.35
125 0.37
126 0.38
127 0.37
128 0.37
129 0.31
130 0.3
131 0.28
132 0.24
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.11
139 0.11
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.2
153 0.24
154 0.29
155 0.29
156 0.29
157 0.29
158 0.27
159 0.26
160 0.23
161 0.18
162 0.12
163 0.1
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.19
179 0.17
180 0.17
181 0.2
182 0.24
183 0.23
184 0.23
185 0.24
186 0.21
187 0.2
188 0.2
189 0.14
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.18
214 0.21
215 0.27
216 0.32
217 0.39
218 0.42
219 0.51
220 0.58
221 0.61
222 0.59
223 0.6
224 0.63
225 0.6
226 0.59
227 0.57
228 0.49
229 0.45
230 0.42
231 0.34
232 0.27
233 0.23
234 0.19
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.15
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.15
261 0.17
262 0.21
263 0.24
264 0.23
265 0.23
266 0.23
267 0.25
268 0.2
269 0.2
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.2
274 0.2
275 0.18
276 0.16
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.16
281 0.14
282 0.16
283 0.15
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.19
289 0.2
290 0.24
291 0.28
292 0.25
293 0.26
294 0.26
295 0.25
296 0.23
297 0.22
298 0.22
299 0.19
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.12
317 0.12
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.1
325 0.09
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.14
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.15
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.19
352 0.19
353 0.22
354 0.2
355 0.2
356 0.18
357 0.17
358 0.19
359 0.22
360 0.26
361 0.29
362 0.32
363 0.32
364 0.35
365 0.36
366 0.32
367 0.29
368 0.23
369 0.15
370 0.12
371 0.11
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.05
376 0.06
377 0.09
378 0.1
379 0.12
380 0.12
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.11
426 0.15
427 0.16
428 0.19
429 0.23
430 0.27
431 0.31
432 0.38
433 0.4
434 0.38
435 0.39
436 0.42
437 0.4
438 0.42
439 0.37
440 0.31
441 0.29
442 0.28
443 0.27
444 0.22
445 0.19
446 0.14
447 0.15
448 0.13
449 0.13
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.14
456 0.16
457 0.16
458 0.19
459 0.19
460 0.22
461 0.22
462 0.23
463 0.22
464 0.2
465 0.18
466 0.16
467 0.14
468 0.15
469 0.14
470 0.11
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.14
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.08
488 0.06
489 0.06
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.04
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.06
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.11
539 0.16
540 0.17
541 0.18
542 0.17
543 0.16
544 0.15
545 0.13
546 0.13
547 0.08
548 0.06
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.04
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.08
564 0.08
565 0.1
566 0.19
567 0.19
568 0.2
569 0.19
570 0.19
571 0.18
572 0.2
573 0.21
574 0.12
575 0.13
576 0.13
577 0.12
578 0.12
579 0.11
580 0.09
581 0.07
582 0.07
583 0.08
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.12
589 0.14
590 0.17
591 0.2
592 0.22
593 0.23
594 0.24
595 0.24
596 0.2
597 0.17
598 0.14
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.11
615 0.1
616 0.08
617 0.07
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.11
622 0.1
623 0.11
624 0.11
625 0.13
626 0.15
627 0.15
628 0.15
629 0.16
630 0.16
631 0.17
632 0.17
633 0.15
634 0.13
635 0.11
636 0.11
637 0.1
638 0.08
639 0.08
640 0.11
641 0.14
642 0.19
643 0.18
644 0.18
645 0.19
646 0.18
647 0.17
648 0.15
649 0.12
650 0.07
651 0.06
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.06
657 0.09
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.1
662 0.12
663 0.16
664 0.17
665 0.14
666 0.14
667 0.16
668 0.15
669 0.18
670 0.17
671 0.13
672 0.12
673 0.11
674 0.11
675 0.09
676 0.09
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.1
682 0.1
683 0.12
684 0.15
685 0.15
686 0.18
687 0.24
688 0.27
689 0.26
690 0.28
691 0.31
692 0.32
693 0.3
694 0.25
695 0.22
696 0.18
697 0.19
698 0.17
699 0.13
700 0.11
701 0.12
702 0.16
703 0.13
704 0.14
705 0.15
706 0.14
707 0.13
708 0.18
709 0.2
710 0.17
711 0.17
712 0.17
713 0.17
714 0.17
715 0.16
716 0.11
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.14
721 0.23
722 0.27
723 0.34
724 0.39
725 0.4
726 0.42
727 0.46
728 0.41
729 0.32
730 0.29
731 0.24
732 0.2
733 0.19
734 0.17
735 0.12
736 0.1
737 0.09
738 0.09
739 0.06
740 0.05
741 0.05
742 0.06
743 0.07
744 0.07
745 0.08
746 0.09
747 0.12
748 0.16
749 0.23
750 0.27
751 0.31
752 0.32
753 0.3
754 0.29
755 0.27
756 0.23
757 0.16
758 0.12
759 0.07
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.05
766 0.06
767 0.06
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.1
775 0.13
776 0.2
777 0.26
778 0.29
779 0.36
780 0.37
781 0.37
782 0.34
783 0.32
784 0.29
785 0.29
786 0.29
787 0.3
788 0.3
789 0.3
790 0.29
791 0.29
792 0.25
793 0.19
794 0.18
795 0.12
796 0.12
797 0.12
798 0.13
799 0.12
800 0.11
801 0.1
802 0.08
803 0.08
804 0.06
805 0.06
806 0.05
807 0.05
808 0.06
809 0.07
810 0.07
811 0.07
812 0.09
813 0.1
814 0.09
815 0.1
816 0.13
817 0.12
818 0.12
819 0.12
820 0.1
821 0.11
822 0.18
823 0.23
824 0.27
825 0.34
826 0.43
827 0.45
828 0.5
829 0.49
830 0.43
831 0.45
832 0.44
833 0.43
834 0.4
835 0.42
836 0.38
837 0.43
838 0.44
839 0.41
840 0.45
841 0.4
842 0.39
843 0.34
844 0.33
845 0.29
846 0.27
847 0.23
848 0.15
849 0.15
850 0.12
851 0.12
852 0.12
853 0.12
854 0.13
855 0.13
856 0.14
857 0.13
858 0.11
859 0.11
860 0.12
861 0.11
862 0.11
863 0.09
864 0.07
865 0.09
866 0.1
867 0.11
868 0.11
869 0.12
870 0.14
871 0.17
872 0.22
873 0.23
874 0.24
875 0.24
876 0.26
877 0.31
878 0.35
879 0.39
880 0.35
881 0.36
882 0.33
883 0.31
884 0.3
885 0.23
886 0.17
887 0.1
888 0.11
889 0.09
890 0.09
891 0.1
892 0.09
893 0.1
894 0.11
895 0.12
896 0.11
897 0.11
898 0.11
899 0.1
900 0.12
901 0.12
902 0.12
903 0.14
904 0.16
905 0.18
906 0.18
907 0.2
908 0.18
909 0.18
910 0.21
911 0.2
912 0.2
913 0.21
914 0.22
915 0.21
916 0.2
917 0.21
918 0.2
919 0.17
920 0.15
921 0.14
922 0.13
923 0.12
924 0.12
925 0.11
926 0.12
927 0.12
928 0.11
929 0.11
930 0.13
931 0.13
932 0.19
933 0.24
934 0.28
935 0.3
936 0.36
937 0.38
938 0.38
939 0.44
940 0.41
941 0.4
942 0.38
943 0.37
944 0.32
945 0.29
946 0.28
947 0.27
948 0.25
949 0.22
950 0.18
951 0.19
952 0.17
953 0.17
954 0.19
955 0.14
956 0.21
957 0.21
958 0.21
959 0.23
960 0.23
961 0.24
962 0.25
963 0.26
964 0.19
965 0.2
966 0.22
967 0.21
968 0.25
969 0.25
970 0.23
971 0.24
972 0.24
973 0.21
974 0.2
975 0.17
976 0.13
977 0.15
978 0.19
979 0.25
980 0.28
981 0.34
982 0.43
983 0.51
984 0.59
985 0.65
986 0.7
987 0.72
988 0.79
989 0.85
990 0.86
991 0.86
992 0.84
993 0.79
994 0.76
995 0.66
996 0.58
997 0.47
998 0.4
999 0.37