Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5LCW1

Protein Details
Accession A0A5N5LCW1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
779-799IELNNRNWRWHKKLQVWLTKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11cyto_nucl 11, cyto 7, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR036627  CobW-likC_sf  
IPR003495  CobW/HypB/UreG_dom  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02492  cobW  
PF04153  NOT2_3_5  
CDD cd03112  CobW-like  
Amino Acid Sequences MNFDDDAPPDLVEAGLQPNDDDKPVVKVPITIVTGYLGAGKTTLLNYILTAQHGKKIAVIMNEFGDSLDIEKSLTVNKDGEQVEEWLEVGNGCICCSVKDTGVNAIESLMEKKGKFDYILLETTGLADPGNLAPLFWVDDGLASTIYLDGIVTLVDAKNILRSLDDPTGKVEGHDHNETDTHGPLMTTAHVQISHADVIVINKSDLVTEEELRQVRERIESINGLAKIHVTNQSEIPQLEGVILDIHAYDSVEVLDQSGKGHSHLDPTISTISIPLPVLPKNKVGAIDAWLRQVLWEYILPGETTPRNGAPFEIHRVKGRLVLKDGSQKMVQGVRELFDIVDNPSSSTAEPGQGKVILIGASLRNMPAGFAAPQPSQRQGRAVSSQIPNGKTAGNATGWAFGGGNVPLSTGALQNPTRQLGGSASFAQTLGGSQPATPLDPSEFPSLSNNPQLGNAGQSNLWTTGGRNIGAQIPRSQGTPISSQPSQQQQDDLFNASSRLSSAQGGFRFGNPPAAAQPTQSQPTTADDFPPLNRNANGDIGQERGASLMSTFGFGASSAASAAPAQRSNPAAGNALLNALVNNSRGADALSPTIGSQSHDARSSVGDDDLRQRNGTLRDESMASQSSPLGQGPPTEARNPHGAIGNDSSNGKARESKENGLPDVPDPLAGLTPTERYGLKGLRHLVATQPHYQTLMNGIDPSALGLDLQSNDMMISTSIWSPFSDAPPRPAVPKFRLPDCYKVNNVQPIEHKITSFNEETLFWIFYSCPGDQKQQYAAIELNNRNWRWHKKLQVWLTKDDMVPPQVLSPNHERGWYIVWETSQWKKERRELVLWYHDLEPAATPTPLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.12
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.14
10 0.19
11 0.21
12 0.24
13 0.22
14 0.23
15 0.24
16 0.3
17 0.31
18 0.25
19 0.23
20 0.21
21 0.21
22 0.19
23 0.19
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.15
35 0.16
36 0.17
37 0.22
38 0.21
39 0.25
40 0.28
41 0.27
42 0.25
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.3
47 0.27
48 0.26
49 0.26
50 0.24
51 0.2
52 0.17
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.12
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.24
66 0.24
67 0.26
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.13
74 0.13
75 0.1
76 0.09
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.2
87 0.21
88 0.26
89 0.28
90 0.28
91 0.25
92 0.23
93 0.21
94 0.18
95 0.19
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.18
100 0.21
101 0.23
102 0.23
103 0.22
104 0.25
105 0.26
106 0.28
107 0.26
108 0.23
109 0.21
110 0.22
111 0.2
112 0.14
113 0.1
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.16
151 0.23
152 0.25
153 0.22
154 0.24
155 0.27
156 0.26
157 0.25
158 0.24
159 0.22
160 0.26
161 0.29
162 0.26
163 0.24
164 0.25
165 0.27
166 0.24
167 0.19
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.2
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.21
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.18
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.24
210 0.23
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.22
217 0.18
218 0.19
219 0.21
220 0.23
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.17
225 0.15
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.14
254 0.17
255 0.17
256 0.15
257 0.14
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.14
265 0.17
266 0.18
267 0.2
268 0.2
269 0.22
270 0.21
271 0.2
272 0.18
273 0.18
274 0.22
275 0.2
276 0.2
277 0.19
278 0.17
279 0.16
280 0.16
281 0.13
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.23
300 0.27
301 0.27
302 0.28
303 0.3
304 0.3
305 0.33
306 0.34
307 0.29
308 0.28
309 0.28
310 0.29
311 0.35
312 0.36
313 0.32
314 0.28
315 0.25
316 0.24
317 0.26
318 0.23
319 0.17
320 0.17
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.12
325 0.09
326 0.1
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.11
343 0.11
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.11
359 0.11
360 0.14
361 0.16
362 0.21
363 0.22
364 0.21
365 0.24
366 0.22
367 0.25
368 0.24
369 0.24
370 0.26
371 0.25
372 0.29
373 0.3
374 0.29
375 0.26
376 0.24
377 0.22
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.09
400 0.1
401 0.11
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.11
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.16
433 0.18
434 0.18
435 0.2
436 0.18
437 0.15
438 0.15
439 0.16
440 0.13
441 0.13
442 0.11
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.07
450 0.07
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.15
457 0.16
458 0.17
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.17
463 0.16
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.16
468 0.19
469 0.19
470 0.2
471 0.23
472 0.29
473 0.3
474 0.27
475 0.27
476 0.24
477 0.26
478 0.26
479 0.25
480 0.17
481 0.15
482 0.15
483 0.13
484 0.11
485 0.09
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.14
491 0.14
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.18
496 0.17
497 0.2
498 0.16
499 0.16
500 0.15
501 0.18
502 0.17
503 0.17
504 0.19
505 0.18
506 0.2
507 0.19
508 0.19
509 0.16
510 0.19
511 0.22
512 0.2
513 0.18
514 0.17
515 0.18
516 0.19
517 0.23
518 0.21
519 0.2
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.22
524 0.21
525 0.17
526 0.17
527 0.15
528 0.15
529 0.13
530 0.12
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.05
549 0.06
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.12
554 0.13
555 0.15
556 0.16
557 0.17
558 0.16
559 0.16
560 0.16
561 0.13
562 0.12
563 0.1
564 0.08
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.11
584 0.13
585 0.15
586 0.16
587 0.17
588 0.16
589 0.17
590 0.18
591 0.16
592 0.14
593 0.13
594 0.13
595 0.2
596 0.25
597 0.26
598 0.24
599 0.23
600 0.27
601 0.31
602 0.34
603 0.29
604 0.25
605 0.25
606 0.26
607 0.26
608 0.24
609 0.21
610 0.17
611 0.15
612 0.13
613 0.13
614 0.12
615 0.12
616 0.1
617 0.09
618 0.1
619 0.14
620 0.18
621 0.2
622 0.23
623 0.24
624 0.25
625 0.3
626 0.3
627 0.28
628 0.28
629 0.25
630 0.25
631 0.27
632 0.26
633 0.22
634 0.21
635 0.2
636 0.2
637 0.21
638 0.19
639 0.22
640 0.24
641 0.32
642 0.38
643 0.41
644 0.43
645 0.46
646 0.46
647 0.42
648 0.39
649 0.3
650 0.28
651 0.24
652 0.17
653 0.13
654 0.12
655 0.11
656 0.1
657 0.1
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.12
662 0.11
663 0.13
664 0.18
665 0.22
666 0.23
667 0.27
668 0.3
669 0.3
670 0.31
671 0.3
672 0.3
673 0.33
674 0.34
675 0.35
676 0.34
677 0.32
678 0.33
679 0.32
680 0.28
681 0.25
682 0.23
683 0.18
684 0.16
685 0.15
686 0.14
687 0.14
688 0.13
689 0.09
690 0.06
691 0.05
692 0.05
693 0.07
694 0.07
695 0.08
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.09
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.14
709 0.16
710 0.2
711 0.27
712 0.27
713 0.31
714 0.36
715 0.37
716 0.38
717 0.42
718 0.44
719 0.43
720 0.5
721 0.51
722 0.51
723 0.59
724 0.59
725 0.62
726 0.62
727 0.63
728 0.59
729 0.6
730 0.61
731 0.6
732 0.56
733 0.52
734 0.5
735 0.5
736 0.53
737 0.48
738 0.42
739 0.36
740 0.38
741 0.39
742 0.35
743 0.29
744 0.23
745 0.22
746 0.24
747 0.24
748 0.21
749 0.16
750 0.15
751 0.14
752 0.15
753 0.19
754 0.18
755 0.2
756 0.22
757 0.3
758 0.32
759 0.36
760 0.37
761 0.39
762 0.39
763 0.37
764 0.35
765 0.33
766 0.39
767 0.38
768 0.42
769 0.44
770 0.45
771 0.49
772 0.55
773 0.59
774 0.59
775 0.65
776 0.67
777 0.68
778 0.77
779 0.81
780 0.82
781 0.78
782 0.74
783 0.7
784 0.64
785 0.56
786 0.5
787 0.44
788 0.37
789 0.33
790 0.28
791 0.27
792 0.28
793 0.29
794 0.3
795 0.33
796 0.38
797 0.38
798 0.39
799 0.35
800 0.32
801 0.36
802 0.33
803 0.28
804 0.23
805 0.23
806 0.25
807 0.3
808 0.36
809 0.39
810 0.43
811 0.48
812 0.54
813 0.62
814 0.67
815 0.7
816 0.69
817 0.68
818 0.71
819 0.72
820 0.67
821 0.61
822 0.53
823 0.48
824 0.4
825 0.34
826 0.26
827 0.2
828 0.2