Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DFG0

Protein Details
Accession C5DFG0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56LFRAINKHRCREKSLEKQLETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013956  E3_ubiquit_lig_Bre1  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0010390  P:histone monoubiquitination  
KEGG lth:KLTH0D14784g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08647  BRE1  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16499  RING-HC_Bre1-like  
Amino Acid Sequences MSEEPTPKKAKLDWGLTDPSEPLTRKDVIAFQKEALFRAINKHRCREKSLEKQLETGELQSAELREQYASLYAMITALAGKVLTLSKEDLEAQKLCGAILEGGNKEVPGLAADFTALVEKHISHDAASPRQDSEEVTWNKQLHQLEATKAELSAHNRQLKKEISAIREHYQDLIRRYDREDSDTVRRVFKLQESPGESSAKEVAEISPANQSEVANAMTGDEKEEAVSKMEHELQIQDLNNQIESLKQTLKDLESWKASSETEIAKLRTELASNSSACEQTSRSIQNDRETLLHKLDLVTKENAELAQANDLYLSKFQQMVQDKEIFTNKLSLEFQTAQDALKKHNAMLEKDLVRIRATRDELTSRIAILESQKPKSELLADLQKVLDLQKERIEKMENKPVETTNDAVMKELQDLERAFKELTQLAHKKYSDHISQESIVSKLTVEKTKADQKYFTAMRSKDSILIENKNLSKNLHKSNELINQLKEIERTLQSKVESLNKQIHLSQSNEKRLMESSKAVSLKIMDLTSELGKTKKVVESLQGERAKHIEQDTRLESNIHSLQSQNSALKLQLSQAENKAKKLHKSLISNGGDNSIIAEELDNFRTIVYCSLCSKNWKNTAIKNCGHVFCEECCKERLAARMRKCPTCNKPFGSADLLVVHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.57
3 0.53
4 0.51
5 0.42
6 0.36
7 0.34
8 0.31
9 0.28
10 0.27
11 0.28
12 0.28
13 0.3
14 0.35
15 0.36
16 0.42
17 0.41
18 0.38
19 0.42
20 0.42
21 0.4
22 0.36
23 0.3
24 0.25
25 0.33
26 0.41
27 0.44
28 0.51
29 0.59
30 0.65
31 0.69
32 0.75
33 0.75
34 0.75
35 0.77
36 0.81
37 0.81
38 0.73
39 0.72
40 0.66
41 0.61
42 0.51
43 0.41
44 0.33
45 0.23
46 0.22
47 0.2
48 0.2
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.13
75 0.16
76 0.18
77 0.21
78 0.22
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.1
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.11
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.19
112 0.23
113 0.28
114 0.31
115 0.3
116 0.28
117 0.29
118 0.29
119 0.25
120 0.23
121 0.27
122 0.28
123 0.3
124 0.35
125 0.35
126 0.35
127 0.39
128 0.36
129 0.29
130 0.3
131 0.3
132 0.27
133 0.29
134 0.3
135 0.24
136 0.23
137 0.22
138 0.21
139 0.24
140 0.29
141 0.34
142 0.4
143 0.42
144 0.43
145 0.48
146 0.47
147 0.44
148 0.43
149 0.41
150 0.38
151 0.43
152 0.47
153 0.44
154 0.43
155 0.41
156 0.36
157 0.35
158 0.35
159 0.32
160 0.35
161 0.34
162 0.33
163 0.36
164 0.4
165 0.37
166 0.38
167 0.38
168 0.34
169 0.4
170 0.46
171 0.45
172 0.4
173 0.39
174 0.35
175 0.35
176 0.36
177 0.35
178 0.31
179 0.36
180 0.38
181 0.4
182 0.41
183 0.4
184 0.34
185 0.28
186 0.27
187 0.2
188 0.16
189 0.13
190 0.11
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.14
201 0.13
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.16
223 0.16
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.15
237 0.16
238 0.19
239 0.2
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.23
244 0.22
245 0.21
246 0.17
247 0.17
248 0.14
249 0.16
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.16
256 0.15
257 0.12
258 0.12
259 0.15
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.1
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.22
272 0.24
273 0.28
274 0.28
275 0.28
276 0.25
277 0.25
278 0.25
279 0.21
280 0.19
281 0.15
282 0.15
283 0.18
284 0.18
285 0.19
286 0.17
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.11
292 0.1
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.14
306 0.19
307 0.21
308 0.23
309 0.26
310 0.25
311 0.26
312 0.28
313 0.22
314 0.18
315 0.19
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.13
326 0.16
327 0.16
328 0.14
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.18
333 0.21
334 0.19
335 0.21
336 0.25
337 0.21
338 0.23
339 0.24
340 0.22
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.19
345 0.21
346 0.2
347 0.21
348 0.22
349 0.23
350 0.24
351 0.22
352 0.16
353 0.14
354 0.12
355 0.11
356 0.12
357 0.18
358 0.19
359 0.21
360 0.22
361 0.23
362 0.23
363 0.23
364 0.22
365 0.16
366 0.16
367 0.22
368 0.21
369 0.21
370 0.21
371 0.2
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.11
376 0.12
377 0.17
378 0.19
379 0.2
380 0.22
381 0.26
382 0.28
383 0.32
384 0.41
385 0.36
386 0.35
387 0.37
388 0.36
389 0.34
390 0.3
391 0.25
392 0.19
393 0.22
394 0.2
395 0.19
396 0.18
397 0.16
398 0.15
399 0.15
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.14
407 0.13
408 0.15
409 0.14
410 0.16
411 0.22
412 0.25
413 0.27
414 0.33
415 0.32
416 0.32
417 0.33
418 0.37
419 0.32
420 0.32
421 0.31
422 0.28
423 0.29
424 0.29
425 0.27
426 0.21
427 0.17
428 0.14
429 0.12
430 0.13
431 0.16
432 0.18
433 0.18
434 0.2
435 0.25
436 0.34
437 0.39
438 0.37
439 0.36
440 0.33
441 0.4
442 0.4
443 0.38
444 0.36
445 0.32
446 0.33
447 0.35
448 0.34
449 0.3
450 0.3
451 0.32
452 0.29
453 0.32
454 0.31
455 0.33
456 0.35
457 0.33
458 0.33
459 0.29
460 0.32
461 0.36
462 0.43
463 0.42
464 0.41
465 0.41
466 0.47
467 0.52
468 0.51
469 0.47
470 0.39
471 0.36
472 0.35
473 0.34
474 0.28
475 0.21
476 0.19
477 0.2
478 0.21
479 0.21
480 0.24
481 0.23
482 0.25
483 0.26
484 0.31
485 0.29
486 0.32
487 0.37
488 0.36
489 0.37
490 0.37
491 0.39
492 0.34
493 0.36
494 0.4
495 0.41
496 0.47
497 0.48
498 0.46
499 0.43
500 0.42
501 0.43
502 0.37
503 0.32
504 0.27
505 0.31
506 0.31
507 0.29
508 0.27
509 0.24
510 0.22
511 0.21
512 0.18
513 0.11
514 0.11
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.12
520 0.13
521 0.14
522 0.17
523 0.19
524 0.2
525 0.21
526 0.26
527 0.32
528 0.36
529 0.44
530 0.45
531 0.42
532 0.4
533 0.41
534 0.36
535 0.32
536 0.32
537 0.29
538 0.28
539 0.34
540 0.37
541 0.37
542 0.36
543 0.34
544 0.3
545 0.3
546 0.31
547 0.25
548 0.21
549 0.2
550 0.21
551 0.25
552 0.28
553 0.22
554 0.2
555 0.2
556 0.2
557 0.21
558 0.19
559 0.18
560 0.21
561 0.22
562 0.25
563 0.31
564 0.41
565 0.41
566 0.44
567 0.5
568 0.49
569 0.54
570 0.57
571 0.59
572 0.56
573 0.61
574 0.65
575 0.67
576 0.65
577 0.6
578 0.53
579 0.46
580 0.38
581 0.3
582 0.25
583 0.14
584 0.11
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.12
589 0.13
590 0.13
591 0.12
592 0.12
593 0.13
594 0.13
595 0.16
596 0.16
597 0.17
598 0.21
599 0.26
600 0.3
601 0.38
602 0.45
603 0.5
604 0.55
605 0.6
606 0.63
607 0.67
608 0.74
609 0.74
610 0.7
611 0.67
612 0.65
613 0.6
614 0.55
615 0.48
616 0.41
617 0.35
618 0.43
619 0.38
620 0.35
621 0.34
622 0.34
623 0.35
624 0.36
625 0.42
626 0.42
627 0.49
628 0.55
629 0.63
630 0.67
631 0.74
632 0.75
633 0.76
634 0.76
635 0.77
636 0.78
637 0.73
638 0.74
639 0.68
640 0.68
641 0.63
642 0.54
643 0.45