Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DCP5

Protein Details
Accession C5DCP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70KKPTAPAKKPAAKKDKKDAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-68AKKPTAPAKKPAAKKDKKD
220-243ARLAKVKGGTATGGAGKKKAKATR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG lth:KLTH0B04752g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MSWDDEDFDLPSSAKNEPVLASWDDEFAETNDDDDAVLESWDAEPAAASAKKPTAPAKKPAAKKDKKDAAASKPLLEIDTLDESTRRELLRKAEVDSDLNNAADLFGGLGVAEEHPRARALRKQQEEEALTRPAALTKDTPLDTHPLFQAESKKEYQELRKALAAAITPLNERSALNYSSGLAIDLIRDVANPMSTESIRQTIATLNVLMKDKERQERLARLAKVKGGTATGGAGKKKAKATRANLGGAFKKDQEFDLETPAFDDFGEDDFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.18
6 0.2
7 0.19
8 0.21
9 0.19
10 0.19
11 0.17
12 0.17
13 0.16
14 0.13
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.13
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.3
41 0.35
42 0.4
43 0.47
44 0.55
45 0.61
46 0.67
47 0.74
48 0.77
49 0.75
50 0.77
51 0.8
52 0.79
53 0.75
54 0.76
55 0.72
56 0.68
57 0.69
58 0.63
59 0.54
60 0.46
61 0.41
62 0.34
63 0.27
64 0.19
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.17
73 0.14
74 0.13
75 0.16
76 0.21
77 0.28
78 0.28
79 0.29
80 0.3
81 0.31
82 0.3
83 0.28
84 0.25
85 0.18
86 0.17
87 0.14
88 0.11
89 0.09
90 0.07
91 0.06
92 0.04
93 0.03
94 0.03
95 0.02
96 0.02
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.1
106 0.15
107 0.24
108 0.33
109 0.38
110 0.41
111 0.42
112 0.46
113 0.46
114 0.42
115 0.36
116 0.28
117 0.23
118 0.19
119 0.17
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.2
137 0.18
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.24
142 0.27
143 0.31
144 0.32
145 0.31
146 0.3
147 0.3
148 0.3
149 0.27
150 0.25
151 0.19
152 0.14
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.1
182 0.1
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.15
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.2
199 0.25
200 0.32
201 0.35
202 0.38
203 0.43
204 0.5
205 0.56
206 0.59
207 0.57
208 0.53
209 0.53
210 0.51
211 0.46
212 0.4
213 0.33
214 0.26
215 0.22
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.2
220 0.2
221 0.23
222 0.24
223 0.28
224 0.35
225 0.4
226 0.43
227 0.49
228 0.55
229 0.61
230 0.64
231 0.63
232 0.59
233 0.59
234 0.56
235 0.5
236 0.46
237 0.38
238 0.35
239 0.32
240 0.3
241 0.3
242 0.3
243 0.28
244 0.33
245 0.31
246 0.28
247 0.28
248 0.27
249 0.22
250 0.16
251 0.16
252 0.09