Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DF60

Protein Details
Accession C5DF60    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-67YQQFHRRRSSHHHGRPKIKHTKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-67RRSSHHHGRPKIKHTKP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031456  Caf20  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005845  C:mRNA cap binding complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
KEGG lth:KLTH0D12474g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17052  CAF20  
Amino Acid Sequences MFRYTEEELLQLKPEVDVPVNFDIDSFRAIIDKVKEIQGLQEEEYQQFHRRRSSHHHGRPKIKHTKPKITTDSDGWSTFENTVARRKSNAAGNGSEEDLPVKEQPVIAQETLKVKPNKNITSTKPADARDIVTDKAVNNFNAFAALESDEEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.18
6 0.2
7 0.21
8 0.2
9 0.18
10 0.17
11 0.15
12 0.16
13 0.11
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.13
18 0.14
19 0.17
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.2
28 0.22
29 0.21
30 0.21
31 0.23
32 0.23
33 0.26
34 0.27
35 0.29
36 0.32
37 0.32
38 0.37
39 0.44
40 0.53
41 0.56
42 0.62
43 0.7
44 0.71
45 0.8
46 0.82
47 0.82
48 0.82
49 0.78
50 0.78
51 0.76
52 0.79
53 0.74
54 0.75
55 0.71
56 0.65
57 0.6
58 0.53
59 0.48
60 0.39
61 0.35
62 0.26
63 0.21
64 0.17
65 0.15
66 0.15
67 0.12
68 0.11
69 0.17
70 0.19
71 0.19
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.27
76 0.3
77 0.27
78 0.26
79 0.27
80 0.27
81 0.26
82 0.23
83 0.17
84 0.13
85 0.1
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.11
93 0.13
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.18
98 0.2
99 0.27
100 0.29
101 0.29
102 0.35
103 0.44
104 0.47
105 0.48
106 0.54
107 0.52
108 0.58
109 0.58
110 0.57
111 0.53
112 0.49
113 0.47
114 0.42
115 0.38
116 0.34
117 0.34
118 0.29
119 0.26
120 0.26
121 0.23
122 0.27
123 0.28
124 0.22
125 0.21
126 0.21
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.11