FuNGI

C5DDQ5

Protein Details

Accession

C5DDQ5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-60	HQLVRARDAGKRRKGRRDYQVCAATE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
42-50	DAGKRRKGR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	lth:KLTH0C02904g -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MIVDSADPVLYHLTLQRQSNFVHSCVGHFVDYKHHQLVRARDAGKRRKGRRDYQVCAATETHIELYDVEDGSLKRLVSIPFFATITAMQSLPIDSSYSFVVLLTDAGNLSVLQFVYNSGCFRLHTLLNEPFARSGIRRLSPQKHLSVDLHGRCIFLSATERNKLCFLTDFKDNALSISSPLVLNKPNSITLSTAVCDVAFDNPVFASLEIDMSDGSKSLIFYVLDLGLNHVVQRSEHELPRDANFVISVPNLEKYGISTKGPEGSQDGDDLVNPFVLIGLQDRLLLKDSHGLYSLEVQLPTRENEASPTIIITATLHKLKKEFFILLQTNTGDLFKVKIIPNETTRSSPKLTVTFFDTIPCSSGLHIFRNGLMLALGEFVALSLYEFEGLGNDEDFSSILTSDDPQRKLKLRPVEELQNLSLLDQFRGSNPVLSQKVVGTTPLTILSQQKNTLETLTTGVNFSELISSPLPPNPDNVWTIKLPSELGHRLVFLSLPKATMVLKIEDGSLEELENASESFKTENDRTIFVGLMGESSIIQVCENSLSQIALAKKPPVLNSKLEWLPPAGIKIVEATCSSTQLALGLSNNEIVWFELDTSNGGEVLNEYQDRVEMPDKITALSLPQTFKSDFLAVGCQDSSVKIIGLKSTSRDSFLEVLSMQVVLSPPSDLKLVYSKGLLFLHLGLDAGVYIRSNIDKTDGQLFDIRTKYLGSKPVKVSVLSEIELKASLEEAGEGESDEDESESEDEGTNQPKGVEGSSCAVLHSDKTWLSYNTANLMLVRPLIINGKQSLSSVAMFRTNDIKTNGCCAVSTSGSLLIGRFDKFTTEDKWFQQKRIEKTDEESDKSGEGVSLSGHQPFQGRRIVADKFDRKTYFVIENNHKNSSCRISVYRSGKLLNFGTDEAFISITDCVCLDAQSVRFGGDESHLVMSTSNGKLKTFVVNIEKTTKGRRYNLTFLHDTAVEEKVYSMIAFKDKLLISLFGNLVLYGLGRSQLLKKTITPMPPSVTKVTSIAQWEDSRVAVGDIHESVTLFLYDKRADRFISIADDITKRHVTALEFLDRSTVVGGDRFGNIWVLRLPSIHERLVSDEFPFFLSKFHNNVNNSIAKNIMECPFKWDLVNHFYANDIPVSLNVVKNMHSSDKVSILYLGLQGSVGCLLPLATKKEAEFLEKLQGGLSEADEAFYMDFEAQKASEESEHTDDWSMDYNQGTKLKHKSPRPIVEGAFSLVGRDHTVYRSYYAPVRKVIDGDLCEQFYQLYPSEQEFLTKKLGFKDVAFVKSRLAEFRANHV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.29
3	0.31
4	0.32
5	0.33
6	0.41
7	0.41
8	0.35
9	0.36
10	0.32
11	0.31
12	0.32
13	0.33
14	0.26
15	0.25
16	0.25
17	0.28
18	0.33
19	0.37
20	0.39
21	0.39
22	0.42
23	0.47
24	0.55
25	0.53
26	0.57
27	0.53
28	0.53
29	0.61
30	0.66
31	0.7
32	0.72
33	0.73
34	0.76
35	0.83
36	0.87
37	0.88
38	0.88
39	0.84
40	0.84
41	0.82
42	0.72
43	0.66
44	0.57
45	0.48
46	0.39
47	0.34
48	0.25
49	0.18
50	0.17
51	0.13
52	0.15
53	0.16
54	0.15
55	0.13
56	0.15
57	0.15
58	0.17
59	0.2
60	0.17
61	0.15
62	0.19
63	0.21
64	0.21
65	0.24
66	0.23
67	0.23
68	0.23
69	0.22
70	0.19
71	0.18
72	0.17
73	0.16
74	0.13
75	0.11
76	0.12
77	0.12
78	0.12
79	0.12
80	0.1
81	0.09
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.09
87	0.09
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.08
102	0.11
103	0.13
104	0.14
105	0.14
106	0.15
107	0.15
108	0.18
109	0.21
110	0.21
111	0.22
112	0.28
113	0.31
114	0.35
115	0.37
116	0.35
117	0.31
118	0.3
119	0.29
120	0.23
121	0.26
122	0.28
123	0.3
124	0.36
125	0.45
126	0.51
127	0.58
128	0.63
129	0.63
130	0.58
131	0.6
132	0.54
133	0.53
134	0.55
135	0.49
136	0.49
137	0.43
138	0.4
139	0.35
140	0.34
141	0.26
142	0.18
143	0.22
144	0.22
145	0.27
146	0.34
147	0.35
148	0.35
149	0.37
150	0.35
151	0.31
152	0.3
153	0.29
154	0.26
155	0.32
156	0.31
157	0.31
158	0.34
159	0.32
160	0.27
161	0.25
162	0.21
163	0.15
164	0.15
165	0.15
166	0.12
167	0.13
168	0.15
169	0.17
170	0.18
171	0.21
172	0.22
173	0.24
174	0.25
175	0.25
176	0.24
177	0.22
178	0.22
179	0.19
180	0.18
181	0.15
182	0.13
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.11
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.08
195	0.09
196	0.08
197	0.09
198	0.08
199	0.07
200	0.08
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.1
207	0.09
208	0.1
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.11
219	0.1
220	0.14
221	0.18
222	0.22
223	0.25
224	0.28
225	0.31
226	0.33
227	0.35
228	0.34
229	0.27
230	0.22
231	0.2
232	0.17
233	0.15
234	0.13
235	0.12
236	0.1
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.13
242	0.18
243	0.19
244	0.18
245	0.19
246	0.2
247	0.25
248	0.25
249	0.23
250	0.2
251	0.21
252	0.2
253	0.19
254	0.18
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.12
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.09
269	0.1
270	0.11
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.17
275	0.18
276	0.18
277	0.19
278	0.18
279	0.17
280	0.2
281	0.23
282	0.18
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.19
287	0.2
288	0.18
289	0.16
290	0.14
291	0.17
292	0.18
293	0.17
294	0.15
295	0.14
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.09
300	0.11
301	0.13
302	0.19
303	0.19
304	0.2
305	0.23
306	0.24
307	0.27
308	0.27
309	0.25
310	0.22
311	0.29
312	0.31
313	0.3
314	0.31
315	0.27
316	0.24
317	0.23
318	0.21
319	0.13
320	0.1
321	0.1
322	0.08
323	0.14
324	0.15
325	0.18
326	0.22
327	0.25
328	0.29
329	0.33
330	0.34
331	0.34
332	0.35
333	0.35
334	0.35
335	0.33
336	0.32
337	0.33
338	0.32
339	0.29
340	0.31
341	0.29
342	0.26
343	0.25
344	0.23
345	0.18
346	0.18
347	0.17
348	0.12
349	0.11
350	0.16
351	0.17
352	0.19
353	0.2
354	0.19
355	0.19
356	0.2
357	0.2
358	0.14
359	0.11
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.07
389	0.14
390	0.2
391	0.23
392	0.25
393	0.3
394	0.35
395	0.39
396	0.45
397	0.47
398	0.45
399	0.48
400	0.5
401	0.54
402	0.52
403	0.51
404	0.44
405	0.36
406	0.32
407	0.26
408	0.24
409	0.16
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.1
414	0.14
415	0.14
416	0.13
417	0.13
418	0.2
419	0.2
420	0.2
421	0.2
422	0.17
423	0.18
424	0.17
425	0.17
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.15
433	0.17
434	0.19
435	0.21
436	0.21
437	0.21
438	0.21
439	0.21
440	0.16
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.08
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.11
456	0.13
457	0.15
458	0.14
459	0.17
460	0.16
461	0.18
462	0.19
463	0.19
464	0.21
465	0.18
466	0.2
467	0.18
468	0.17
469	0.14
470	0.13
471	0.17
472	0.17
473	0.19
474	0.18
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.16
479	0.11
480	0.11
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.11
487	0.12
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.11
492	0.1
493	0.11
494	0.1
495	0.08
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.1
508	0.11
509	0.16
510	0.17
511	0.19
512	0.19
513	0.19
514	0.18
515	0.14
516	0.14
517	0.08
518	0.07
519	0.06
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.09
535	0.11
536	0.12
537	0.13
538	0.14
539	0.16
540	0.17
541	0.21
542	0.23
543	0.25
544	0.25
545	0.25
546	0.3
547	0.3
548	0.28
549	0.25
550	0.2
551	0.18
552	0.16
553	0.15
554	0.1
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.11
562	0.1
563	0.12
564	0.12
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.04
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.08
598	0.09
599	0.09
600	0.1
601	0.13
602	0.13
603	0.13
604	0.13
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.15
615	0.13
616	0.11
617	0.11
618	0.12
619	0.1
620	0.1
621	0.09
622	0.08
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.07
631	0.08
632	0.09
633	0.1
634	0.13
635	0.13
636	0.14
637	0.14
638	0.16
639	0.16
640	0.15
641	0.14
642	0.11
643	0.11
644	0.09
645	0.08
646	0.06
647	0.05
648	0.05
649	0.04
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.06
654	0.06
655	0.05
656	0.06
657	0.1
658	0.1
659	0.11
660	0.11
661	0.11
662	0.13
663	0.13
664	0.12
665	0.09
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.07
670	0.05
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.03
675	0.03
676	0.03
677	0.04
678	0.04
679	0.05
680	0.05
681	0.08
682	0.08
683	0.1
684	0.17
685	0.16
686	0.17
687	0.2
688	0.21
689	0.22
690	0.22
691	0.21
692	0.15
693	0.15
694	0.16
695	0.16
696	0.24
697	0.23
698	0.28
699	0.3
700	0.34
701	0.35
702	0.33
703	0.31
704	0.26
705	0.25
706	0.2
707	0.19
708	0.14
709	0.13
710	0.13
711	0.12
712	0.08
713	0.06
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.04
727	0.04
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.05
732	0.06
733	0.08
734	0.1
735	0.09
736	0.09
737	0.09
738	0.09
739	0.1
740	0.1
741	0.08
742	0.08
743	0.1
744	0.11
745	0.11
746	0.1
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.09
751	0.1
752	0.08
753	0.11
754	0.13
755	0.14
756	0.16
757	0.17
758	0.17
759	0.17
760	0.17
761	0.15
762	0.13
763	0.13
764	0.11
765	0.09
766	0.08
767	0.06
768	0.06
769	0.09
770	0.09
771	0.1
772	0.11
773	0.12
774	0.12
775	0.12
776	0.13
777	0.12
778	0.12
779	0.11
780	0.11
781	0.13
782	0.13
783	0.14
784	0.17
785	0.16
786	0.19
787	0.2
788	0.22
789	0.19
790	0.23
791	0.23
792	0.19
793	0.18
794	0.16
795	0.17
796	0.15
797	0.14
798	0.11
799	0.1
800	0.1
801	0.11
802	0.09
803	0.08
804	0.09
805	0.09
806	0.09
807	0.09
808	0.1
809	0.12
810	0.15
811	0.17
812	0.21
813	0.25
814	0.28
815	0.38
816	0.39
817	0.4
818	0.45
819	0.48
820	0.5
821	0.55
822	0.55
823	0.46
824	0.48
825	0.55
826	0.51
827	0.47
828	0.42
829	0.33
830	0.29
831	0.28
832	0.24
833	0.14
834	0.1
835	0.07
836	0.06
837	0.08
838	0.08
839	0.09
840	0.09
841	0.1
842	0.13
843	0.14
844	0.17
845	0.19
846	0.19
847	0.19
848	0.23
849	0.24
850	0.25
851	0.34
852	0.37
853	0.35
854	0.41
855	0.41
856	0.38
857	0.38
858	0.37
859	0.35
860	0.33
861	0.38
862	0.4
863	0.48
864	0.5
865	0.52
866	0.49
867	0.44
868	0.42
869	0.4
870	0.34
871	0.28
872	0.27
873	0.29
874	0.37
875	0.42
876	0.42
877	0.39
878	0.39
879	0.37
880	0.38
881	0.33
882	0.26
883	0.22
884	0.19
885	0.17
886	0.16
887	0.15
888	0.11
889	0.1
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.06
899	0.07
900	0.09
901	0.1
902	0.12
903	0.12
904	0.12
905	0.12
906	0.12
907	0.11
908	0.1
909	0.1
910	0.1
911	0.1
912	0.1
913	0.1
914	0.1
915	0.1
916	0.14
917	0.15
918	0.17
919	0.16
920	0.17
921	0.18
922	0.19
923	0.23
924	0.2
925	0.23
926	0.26
927	0.27
928	0.29
929	0.32
930	0.34
931	0.31
932	0.37
933	0.39
934	0.39
935	0.43
936	0.49
937	0.51
938	0.57
939	0.61
940	0.6
941	0.55
942	0.49
943	0.45
944	0.38
945	0.31
946	0.25
947	0.21
948	0.15
949	0.12
950	0.11
951	0.1
952	0.09
953	0.08
954	0.07
955	0.08
956	0.1
957	0.11
958	0.11
959	0.16
960	0.16
961	0.18
962	0.18
963	0.18
964	0.16
965	0.19
966	0.19
967	0.14
968	0.14
969	0.12
970	0.1
971	0.09
972	0.08
973	0.05
974	0.05
975	0.05
976	0.05
977	0.07
978	0.11
979	0.16
980	0.18
981	0.2
982	0.21
983	0.26
984	0.32
985	0.36
986	0.37
987	0.35
988	0.37
989	0.4
990	0.42
991	0.4
992	0.35
993	0.31
994	0.28
995	0.26
996	0.24
997	0.23
998	0.21
999	0.22
1000	0.22
1001	0.22
1002	0.21
1003	0.2
1004	0.17
1005	0.14
1006	0.13
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.1
1010	0.09
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.08
1018	0.09
1019	0.12
1020	0.14
1021	0.17
1022	0.2
1023	0.22
1024	0.22
1025	0.22
1026	0.22
1027	0.21
1028	0.23
1029	0.21
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.21
1033	0.2
1034	0.24
1035	0.23
1036	0.19
1037	0.19
1038	0.21
1039	0.19
1040	0.23
1041	0.27
1042	0.29
1043	0.28
1044	0.27
1045	0.28
1046	0.25
1047	0.24
1048	0.18
1049	0.14
1050	0.08
1051	0.09
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.14
1058	0.13
1059	0.13
1060	0.14
1061	0.14
1062	0.14
1063	0.14
1064	0.17
1065	0.21
1066	0.26
1067	0.25
1068	0.25
1069	0.24
1070	0.28
1071	0.32
1072	0.29
1073	0.24
1074	0.2
1075	0.19
1076	0.2
1077	0.2
1078	0.15
1079	0.13
1080	0.16
1081	0.19
1082	0.23
1083	0.28
1084	0.34
1085	0.34
1086	0.38
1087	0.41
1088	0.43
1089	0.39
1090	0.36
1091	0.32
1092	0.25
1093	0.24
1094	0.25
1095	0.25
1096	0.22
1097	0.21
1098	0.27
1099	0.29
1100	0.3
1101	0.29
1102	0.28
1103	0.29
1104	0.32
1105	0.37
1106	0.3
1107	0.27
1108	0.27
1109	0.27
1110	0.25
1111	0.19
1112	0.14
1113	0.1
1114	0.09
1115	0.14
1116	0.15
1117	0.15
1118	0.16
1119	0.17
1120	0.18
1121	0.19
1122	0.23
1123	0.22
1124	0.22
1125	0.23
1126	0.24
1127	0.27
1128	0.26
1129	0.25
1130	0.22
1131	0.19
1132	0.18
1133	0.17
1134	0.14
1135	0.1
1136	0.1
1137	0.09
1138	0.09
1139	0.09
1140	0.07
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.09
1145	0.13
1146	0.17
1147	0.19
1148	0.21
1149	0.21
1150	0.27
1151	0.28
1152	0.3
1153	0.28
1154	0.26
1155	0.32
1156	0.32
1157	0.31
1158	0.26
1159	0.25
1160	0.22
1161	0.2
1162	0.18
1163	0.13
1164	0.12
1165	0.12
1166	0.12
1167	0.12
1168	0.1
1169	0.09
1170	0.09
1171	0.06
1172	0.07
1173	0.08
1174	0.09
1175	0.09
1176	0.11
1177	0.12
1178	0.13
1179	0.14
1180	0.15
1181	0.2
1182	0.23
1183	0.23
1184	0.23
1185	0.24
1186	0.22
1187	0.21
1188	0.24
1189	0.2
1190	0.18
1191	0.19
1192	0.2
1193	0.24
1194	0.29
1195	0.29
1196	0.32
1197	0.39
1198	0.46
1199	0.53
1200	0.6
1201	0.65
1202	0.71
1203	0.79
1204	0.78
1205	0.76
1206	0.69
1207	0.64
1208	0.57
1209	0.48
1210	0.4
1211	0.3
1212	0.24
1213	0.18
1214	0.18
1215	0.15
1216	0.16
1217	0.15
1218	0.16
1219	0.19
1220	0.2
1221	0.21
1222	0.23
1223	0.24
1224	0.29
1225	0.35
1226	0.36
1227	0.39
1228	0.42
1229	0.41
1230	0.41
1231	0.42
1232	0.41
1233	0.36
1234	0.36
1235	0.35
1236	0.33
1237	0.31
1238	0.29
1239	0.26
1240	0.21
1241	0.21
1242	0.18
1243	0.17
1244	0.17
1245	0.2
1246	0.23
1247	0.22
1248	0.26
1249	0.25
1250	0.27
1251	0.31
1252	0.32
1253	0.32
1254	0.34
1255	0.4
1256	0.36
1257	0.35
1258	0.41
1259	0.4
1260	0.44
1261	0.46
1262	0.41
1263	0.39
1264	0.42
1265	0.44
1266	0.38
1267	0.36
1268	0.37

C5DDQ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer