Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMH0

Protein Details
Accession C5DMH0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-30ETRSKSASGKHQPSKSKEPSNDPQSNSHydrophilic
267-288DASDAQKRKKNHKRVAQPTRSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-279RKKNHK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
KEGG lth:KLTH0G08844g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
Amino Acid Sequences MMEETRSKSASGKHQPSKSKEPSNDPQSNSEADLSRQKFLKVAPSLFTPEKLPLFDSLDLYTALIRSSKALEQGERLHNLSWRIMNKALLKDHELNKSKKRDGVRNLYQVLNPANSGQFQRQQQPRQIPTPPRTHQRTASEMQPMQVMSAMQGTASEAKTSPEQPRFPHIHHQKLPVRATSDLQIKRGLHRAQDPRPGHQPQQPHLQQLHVQHAQSKHAPNKQGARFTLGNDSSVSSPESSQMILASPDATVFAGKREGSAQANSMDASDAQKRKKNHKRVAQPTRSAGSLFTPRPDDGPTASALPTKAISHDHIPKSLFGRKPTAHHKPAAPSSENKVFFSSDDDESDWNSLSDDSELYDDEEDDQYYQKQWDKLMFSRSEQSKGGFHAGRNTTPPPADKHDPKRSLLSGLFLNELANKAPTPPIMTPLTAQHPTLGESSVVAVGDVTPASLRASTSSFFPEGTQEKAPEPSAPSAIPPRYPRSRGSFSSIISDSTLQRYAHQSNAPPTAQTILPTALSTHMFLPNNVHQQRMARSVLSRSALSERRESIDIPSKNRNNSFLKTRMEISEEEEFARAKTGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.76
3 0.8
4 0.83
5 0.82
6 0.81
7 0.78
8 0.78
9 0.8
10 0.81
11 0.81
12 0.73
13 0.69
14 0.62
15 0.57
16 0.5
17 0.44
18 0.35
19 0.31
20 0.37
21 0.34
22 0.36
23 0.35
24 0.34
25 0.33
26 0.33
27 0.39
28 0.36
29 0.37
30 0.35
31 0.36
32 0.43
33 0.42
34 0.41
35 0.33
36 0.32
37 0.31
38 0.29
39 0.27
40 0.24
41 0.27
42 0.27
43 0.27
44 0.23
45 0.22
46 0.21
47 0.19
48 0.17
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.13
55 0.15
56 0.2
57 0.23
58 0.24
59 0.28
60 0.35
61 0.4
62 0.4
63 0.4
64 0.35
65 0.35
66 0.36
67 0.35
68 0.33
69 0.29
70 0.3
71 0.31
72 0.34
73 0.37
74 0.4
75 0.41
76 0.38
77 0.42
78 0.45
79 0.49
80 0.53
81 0.55
82 0.56
83 0.6
84 0.66
85 0.64
86 0.63
87 0.65
88 0.65
89 0.67
90 0.71
91 0.71
92 0.71
93 0.7
94 0.66
95 0.59
96 0.53
97 0.46
98 0.37
99 0.28
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.24
106 0.27
107 0.36
108 0.43
109 0.49
110 0.55
111 0.62
112 0.63
113 0.63
114 0.67
115 0.67
116 0.66
117 0.69
118 0.67
119 0.67
120 0.69
121 0.68
122 0.67
123 0.63
124 0.63
125 0.56
126 0.54
127 0.53
128 0.46
129 0.42
130 0.36
131 0.3
132 0.24
133 0.22
134 0.17
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.11
146 0.14
147 0.19
148 0.25
149 0.29
150 0.32
151 0.34
152 0.41
153 0.44
154 0.45
155 0.51
156 0.53
157 0.56
158 0.57
159 0.64
160 0.62
161 0.65
162 0.65
163 0.57
164 0.51
165 0.43
166 0.4
167 0.36
168 0.39
169 0.33
170 0.32
171 0.34
172 0.32
173 0.33
174 0.4
175 0.36
176 0.31
177 0.38
178 0.45
179 0.46
180 0.55
181 0.54
182 0.5
183 0.56
184 0.56
185 0.52
186 0.48
187 0.48
188 0.42
189 0.51
190 0.48
191 0.45
192 0.42
193 0.39
194 0.39
195 0.36
196 0.4
197 0.33
198 0.31
199 0.3
200 0.31
201 0.32
202 0.33
203 0.36
204 0.35
205 0.37
206 0.4
207 0.41
208 0.48
209 0.49
210 0.5
211 0.44
212 0.44
213 0.39
214 0.37
215 0.41
216 0.32
217 0.28
218 0.23
219 0.23
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.09
254 0.07
255 0.09
256 0.13
257 0.17
258 0.21
259 0.25
260 0.29
261 0.4
262 0.5
263 0.59
264 0.62
265 0.67
266 0.74
267 0.8
268 0.87
269 0.84
270 0.78
271 0.71
272 0.63
273 0.54
274 0.44
275 0.33
276 0.25
277 0.22
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.17
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.15
299 0.23
300 0.23
301 0.25
302 0.26
303 0.26
304 0.28
305 0.33
306 0.31
307 0.26
308 0.32
309 0.31
310 0.36
311 0.43
312 0.48
313 0.45
314 0.45
315 0.46
316 0.45
317 0.48
318 0.48
319 0.41
320 0.34
321 0.36
322 0.4
323 0.39
324 0.34
325 0.3
326 0.26
327 0.24
328 0.26
329 0.24
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.17
336 0.12
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.1
356 0.12
357 0.14
358 0.16
359 0.17
360 0.21
361 0.25
362 0.28
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.38
367 0.38
368 0.37
369 0.33
370 0.31
371 0.26
372 0.27
373 0.31
374 0.25
375 0.23
376 0.28
377 0.3
378 0.3
379 0.31
380 0.31
381 0.27
382 0.27
383 0.29
384 0.25
385 0.3
386 0.35
387 0.41
388 0.49
389 0.57
390 0.59
391 0.6
392 0.6
393 0.54
394 0.52
395 0.43
396 0.36
397 0.27
398 0.25
399 0.23
400 0.18
401 0.17
402 0.13
403 0.13
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.14
411 0.14
412 0.18
413 0.19
414 0.19
415 0.19
416 0.22
417 0.27
418 0.24
419 0.24
420 0.21
421 0.19
422 0.21
423 0.2
424 0.17
425 0.12
426 0.1
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.07
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.12
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.16
449 0.2
450 0.2
451 0.23
452 0.24
453 0.22
454 0.23
455 0.26
456 0.26
457 0.23
458 0.25
459 0.23
460 0.23
461 0.21
462 0.23
463 0.28
464 0.29
465 0.32
466 0.34
467 0.39
468 0.45
469 0.49
470 0.51
471 0.52
472 0.57
473 0.55
474 0.57
475 0.54
476 0.47
477 0.5
478 0.45
479 0.37
480 0.31
481 0.3
482 0.24
483 0.23
484 0.27
485 0.21
486 0.23
487 0.28
488 0.29
489 0.33
490 0.35
491 0.37
492 0.38
493 0.45
494 0.42
495 0.36
496 0.34
497 0.32
498 0.28
499 0.24
500 0.2
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.21
510 0.21
511 0.21
512 0.27
513 0.32
514 0.41
515 0.41
516 0.4
517 0.35
518 0.4
519 0.45
520 0.44
521 0.39
522 0.31
523 0.33
524 0.36
525 0.4
526 0.37
527 0.32
528 0.3
529 0.36
530 0.39
531 0.4
532 0.41
533 0.38
534 0.4
535 0.41
536 0.39
537 0.39
538 0.43
539 0.44
540 0.45
541 0.52
542 0.55
543 0.61
544 0.64
545 0.64
546 0.6
547 0.62
548 0.64
549 0.61
550 0.6
551 0.56
552 0.55
553 0.51
554 0.48
555 0.42
556 0.39
557 0.38
558 0.34
559 0.31
560 0.29
561 0.27
562 0.23