FuNGI

C5DMC1

Protein Details

Accession

C5DMC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
539-558	LQVKRVDKIKRKRLLNVFCT	Hydrophilic
648-670	GDAGTKRKGDKPSYNRPEKKFRR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
653-670	KRKGDKPSYNRPEKKFRR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	lth:KLTH0G07612g -
Pfam	View protein in Pfam PF00806 PUF

Amino Acid Sequences

MGKPRGRKLLKKHHTEGEEASHVEPQPYDTNDTIPEKISSGSNGEPNTFFGVLDTQELEYFKQAESTLAVDTFENAEEKEQFISSVIEETKNKELKLATSQICSKLMERIILAGSNQQLKAIFRSFNGFFYGLACQKYSSHVLETLFVRGAAMVEKELLTPSFDEPGATEDGDDVYSPMEDLFLYMLNEITPSVRGMISHKYASHVFRLLILILSSKTLPSTTMSNSALRSKRSKIARKMIDLKDNEDFDKTYKTPDSFKVKLREILSSLYKELTGGVDLGSSNFKNISVTSMMKVRELCIDPVASPVLQLIIQVEGIFDRDRSFWHLIFSSSEEKNAKEEAFVEYLLSDPVGSHFLENVISFTRAKYTERLYKMYMRDRILKLSKRDLTGAFVVQALLKHLRQNDVKSILNDIVPELSLIVNSNMEFCISILDASIQHGDYLKEEIVLQLIKKFYPEGLEDRNILESCLSLNSSTLGNTRDDWPTAEERRRSLFLEKLIDYDDRFLNITIESLLALPEERLLQMCYHGVFSHVVEHVLQVKRVDKIKRKRLLNVFCTDIVNLSCNAYGSHLVDKLWDFTAQLPMYKERIATSMAGDSEKVKNSVYGRQAWKNWSMDKFLRKQFDWKRLIREQQQELFPDATPLQPGGDAGTKRKGDKPSYNRPEKKFRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.71
3	0.65
4	0.6
5	0.55
6	0.47
7	0.41
8	0.36
9	0.33
10	0.3
11	0.26
12	0.23
13	0.24
14	0.25
15	0.29
16	0.26
17	0.27
18	0.32
19	0.35
20	0.33
21	0.29
22	0.27
23	0.23
24	0.24
25	0.23
26	0.2
27	0.2
28	0.22
29	0.25
30	0.25
31	0.27
32	0.26
33	0.27
34	0.28
35	0.24
36	0.21
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.17
41	0.16
42	0.12
43	0.14
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.14
49	0.15
50	0.15
51	0.14
52	0.15
53	0.15
54	0.14
55	0.13
56	0.14
57	0.12
58	0.13
59	0.13
60	0.12
61	0.12
62	0.1
63	0.12
64	0.13
65	0.14
66	0.14
67	0.13
68	0.12
69	0.12
70	0.13
71	0.11
72	0.15
73	0.15
74	0.19
75	0.2
76	0.24
77	0.31
78	0.34
79	0.33
80	0.32
81	0.32
82	0.31
83	0.37
84	0.41
85	0.35
86	0.37
87	0.41
88	0.4
89	0.41
90	0.39
91	0.32
92	0.3
93	0.29
94	0.26
95	0.22
96	0.21
97	0.2
98	0.19
99	0.19
100	0.16
101	0.18
102	0.21
103	0.2
104	0.19
105	0.2
106	0.2
107	0.25
108	0.25
109	0.23
110	0.19
111	0.25
112	0.25
113	0.25
114	0.27
115	0.23
116	0.19
117	0.2
118	0.23
119	0.2
120	0.21
121	0.2
122	0.17
123	0.17
124	0.21
125	0.24
126	0.21
127	0.2
128	0.22
129	0.22
130	0.25
131	0.25
132	0.24
133	0.2
134	0.17
135	0.15
136	0.12
137	0.12
138	0.09
139	0.09
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.12
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.13
154	0.14
155	0.12
156	0.11
157	0.09
158	0.1
159	0.1
160	0.09
161	0.07
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.1
184	0.15
185	0.18
186	0.2
187	0.2
188	0.21
189	0.25
190	0.26
191	0.27
192	0.24
193	0.2
194	0.2
195	0.2
196	0.17
197	0.14
198	0.12
199	0.1
200	0.08
201	0.09
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.11
209	0.12
210	0.17
211	0.19
212	0.2
213	0.22
214	0.29
215	0.3
216	0.31
217	0.34
218	0.32
219	0.38
220	0.45
221	0.53
222	0.55
223	0.62
224	0.64
225	0.67
226	0.73
227	0.71
228	0.7
229	0.62
230	0.56
231	0.5
232	0.45
233	0.38
234	0.3
235	0.25
236	0.19
237	0.23
238	0.19
239	0.19
240	0.2
241	0.21
242	0.23
243	0.3
244	0.37
245	0.36
246	0.42
247	0.45
248	0.45
249	0.49
250	0.47
251	0.42
252	0.35
253	0.35
254	0.31
255	0.26
256	0.24
257	0.19
258	0.17
259	0.15
260	0.13
261	0.1
262	0.07
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.09
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.16
280	0.16
281	0.17
282	0.17
283	0.16
284	0.17
285	0.18
286	0.17
287	0.15
288	0.15
289	0.13
290	0.14
291	0.14
292	0.09
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.12
311	0.15
312	0.14
313	0.16
314	0.16
315	0.16
316	0.16
317	0.19
318	0.18
319	0.16
320	0.18
321	0.18
322	0.17
323	0.18
324	0.19
325	0.16
326	0.11
327	0.12
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.09
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.07
336	0.04
337	0.03
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.1
352	0.11
353	0.12
354	0.14
355	0.19
356	0.26
357	0.29
358	0.32
359	0.32
360	0.36
361	0.41
362	0.45
363	0.45
364	0.4
365	0.44
366	0.43
367	0.47
368	0.48
369	0.48
370	0.45
371	0.48
372	0.49
373	0.42
374	0.44
375	0.37
376	0.33
377	0.29
378	0.25
379	0.17
380	0.14
381	0.13
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.13
388	0.14
389	0.19
390	0.22
391	0.24
392	0.28
393	0.3
394	0.31
395	0.29
396	0.3
397	0.26
398	0.23
399	0.21
400	0.15
401	0.11
402	0.09
403	0.08
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.09
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.11
443	0.13
444	0.15
445	0.17
446	0.21
447	0.23
448	0.23
449	0.24
450	0.26
451	0.23
452	0.21
453	0.16
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.11
465	0.11
466	0.13
467	0.16
468	0.17
469	0.17
470	0.18
471	0.19
472	0.24
473	0.3
474	0.36
475	0.36
476	0.37
477	0.4
478	0.41
479	0.4
480	0.38
481	0.36
482	0.34
483	0.37
484	0.34
485	0.31
486	0.31
487	0.3
488	0.26
489	0.25
490	0.2
491	0.15
492	0.16
493	0.15
494	0.13
495	0.12
496	0.12
497	0.09
498	0.08
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.05
503	0.06
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.09
510	0.09
511	0.1
512	0.11
513	0.11
514	0.12
515	0.11
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.15
520	0.14
521	0.14
522	0.13
523	0.14
524	0.2
525	0.2
526	0.22
527	0.2
528	0.22
529	0.27
530	0.33
531	0.41
532	0.44
533	0.53
534	0.62
535	0.69
536	0.71
537	0.76
538	0.8
539	0.81
540	0.78
541	0.72
542	0.66
543	0.59
544	0.54
545	0.45
546	0.36
547	0.27
548	0.21
549	0.17
550	0.14
551	0.13
552	0.12
553	0.12
554	0.12
555	0.13
556	0.14
557	0.17
558	0.17
559	0.16
560	0.18
561	0.19
562	0.2
563	0.18
564	0.17
565	0.14
566	0.15
567	0.23
568	0.21
569	0.23
570	0.24
571	0.26
572	0.28
573	0.29
574	0.28
575	0.21
576	0.22
577	0.21
578	0.19
579	0.18
580	0.19
581	0.19
582	0.19
583	0.18
584	0.19
585	0.22
586	0.24
587	0.23
588	0.2
589	0.23
590	0.25
591	0.33
592	0.35
593	0.39
594	0.44
595	0.5
596	0.55
597	0.56
598	0.6
599	0.58
600	0.59
601	0.53
602	0.54
603	0.53
604	0.57
605	0.61
606	0.62
607	0.64
608	0.59
609	0.66
610	0.68
611	0.71
612	0.71
613	0.69
614	0.7
615	0.72
616	0.79
617	0.78
618	0.78
619	0.76
620	0.74
621	0.72
622	0.66
623	0.6
624	0.53
625	0.43
626	0.38
627	0.3
628	0.24
629	0.21
630	0.19
631	0.15
632	0.14
633	0.14
634	0.13
635	0.19
636	0.2
637	0.23
638	0.31
639	0.35
640	0.38
641	0.45
642	0.5
643	0.53
644	0.61
645	0.66
646	0.69
647	0.77
648	0.84
649	0.87
650	0.86

C5DMC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer