Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DKV0

Protein Details
Accession C5DKV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-36SGIPMGLKKQRKRETMNSIVQCFHydrophilic
137-164LDKKASERRDLDKRKKKKLRGDLDEERFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-156KASERRDLDKRKKKKLR
Subcellular Location(s) plas 7, mito 5, nucl 4, extr 3, E.R. 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045114  Csn12-like  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0006807  P:nitrogen compound metabolic process  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0044238  P:primary metabolic process  
KEGG lth:KLTH0F07722g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MILDILLLTFLTLSGIPMGLKKQRKRETMNSIVQCFEYRRSTQELLDFLRYDGPCPSSVFSLGRISNEKLVQLIQTTLALKQEFIENCGSATVSTKLFDLANEQLKLINRLSEGETVWITAPLHASAAQLLRVGTQLDKKASERRDLDKRKKKKLRGDLDEERFLEKCVRTIHTSFKLCLNDRNPNTHDNKKWGVYFFTNLELSIYKRLQNRDMVRNLVKVLESRAQELPTPENALQSHKAQLVTYYYYMAEFYGCQDSNFARGFEFARKAWLNSRREGGSQEDMIVMLLIPFAMLAHKWYPDAQVLAARHPRVARLYAPVIQCLRNGDLKSFETWLEQNEAAMLRRNLYVALVLVRELVLLKLLKLSFRFYGSRSIVPLKLVTTALLKSRTHKGVKNITDEQLDETECVLANLISKDYIKGYLSHSNRALVVSKTNAFPRLVHSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.08
4 0.1
5 0.16
6 0.23
7 0.33
8 0.4
9 0.5
10 0.59
11 0.67
12 0.74
13 0.79
14 0.81
15 0.82
16 0.84
17 0.8
18 0.73
19 0.66
20 0.58
21 0.51
22 0.43
23 0.38
24 0.34
25 0.29
26 0.31
27 0.37
28 0.38
29 0.38
30 0.4
31 0.4
32 0.38
33 0.41
34 0.37
35 0.31
36 0.36
37 0.32
38 0.29
39 0.27
40 0.25
41 0.22
42 0.24
43 0.25
44 0.19
45 0.22
46 0.22
47 0.21
48 0.25
49 0.25
50 0.26
51 0.29
52 0.29
53 0.32
54 0.32
55 0.29
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.18
60 0.16
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.2
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.17
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.24
92 0.26
93 0.29
94 0.25
95 0.22
96 0.16
97 0.18
98 0.2
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.14
123 0.16
124 0.18
125 0.2
126 0.22
127 0.29
128 0.31
129 0.37
130 0.37
131 0.41
132 0.5
133 0.59
134 0.67
135 0.7
136 0.77
137 0.81
138 0.86
139 0.88
140 0.87
141 0.87
142 0.87
143 0.85
144 0.84
145 0.83
146 0.79
147 0.75
148 0.65
149 0.56
150 0.46
151 0.38
152 0.33
153 0.23
154 0.21
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.26
159 0.32
160 0.36
161 0.38
162 0.35
163 0.37
164 0.39
165 0.37
166 0.42
167 0.39
168 0.4
169 0.4
170 0.46
171 0.43
172 0.45
173 0.49
174 0.5
175 0.48
176 0.44
177 0.46
178 0.41
179 0.41
180 0.36
181 0.33
182 0.27
183 0.26
184 0.22
185 0.21
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.13
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.2
195 0.22
196 0.25
197 0.32
198 0.36
199 0.39
200 0.4
201 0.41
202 0.39
203 0.37
204 0.35
205 0.28
206 0.23
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.15
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.14
218 0.17
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.19
226 0.17
227 0.18
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.05
240 0.07
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.16
253 0.19
254 0.15
255 0.2
256 0.2
257 0.22
258 0.28
259 0.35
260 0.34
261 0.34
262 0.38
263 0.33
264 0.34
265 0.34
266 0.31
267 0.26
268 0.23
269 0.21
270 0.17
271 0.16
272 0.14
273 0.12
274 0.08
275 0.04
276 0.04
277 0.03
278 0.02
279 0.02
280 0.02
281 0.03
282 0.03
283 0.05
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.12
292 0.16
293 0.16
294 0.21
295 0.25
296 0.24
297 0.25
298 0.25
299 0.26
300 0.24
301 0.26
302 0.22
303 0.22
304 0.25
305 0.28
306 0.28
307 0.3
308 0.3
309 0.28
310 0.27
311 0.25
312 0.24
313 0.24
314 0.24
315 0.21
316 0.23
317 0.24
318 0.25
319 0.23
320 0.21
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.16
327 0.16
328 0.17
329 0.15
330 0.2
331 0.18
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.09
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.12
351 0.13
352 0.16
353 0.17
354 0.21
355 0.2
356 0.24
357 0.26
358 0.23
359 0.32
360 0.32
361 0.33
362 0.34
363 0.37
364 0.34
365 0.33
366 0.33
367 0.25
368 0.24
369 0.22
370 0.19
371 0.17
372 0.17
373 0.2
374 0.24
375 0.25
376 0.27
377 0.35
378 0.41
379 0.45
380 0.48
381 0.53
382 0.58
383 0.63
384 0.67
385 0.64
386 0.59
387 0.56
388 0.51
389 0.46
390 0.38
391 0.32
392 0.24
393 0.2
394 0.17
395 0.14
396 0.14
397 0.11
398 0.08
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.13
404 0.15
405 0.16
406 0.19
407 0.17
408 0.18
409 0.22
410 0.3
411 0.33
412 0.39
413 0.4
414 0.39
415 0.39
416 0.39
417 0.37
418 0.29
419 0.31
420 0.29
421 0.31
422 0.32
423 0.36
424 0.37
425 0.35
426 0.34
427 0.34