Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DL08

Protein Details
Accession C5DL08    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-250DEGNGGSSEKKKKKKKKDKKKDKHSSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-103ARKRAER
228-248GGSSEKKKKKKKKDKKKDKHS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12.166, cyto_nucl 11.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG lth:KLTH0F09020g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSEPSIKLRTAKDTLVSSLFELSKSANQTASSIIDFYNAVGEDEDEKLEAFTTLTEALQKLTSATNQVQVVSSELTNPLEDDKEVIASIASPVKAPARKRAERDPNAPKKPLTVFFAYSAYVRQALREERQKAGLPPLSSTEITQEISKKWKEMSDVEKDKWKQAYNVELQNYHLEKLKYLEDKKNGVAPSQDAPSSAPVPIPDYLQTELNEFEPPKEKRPHEDEGNGGSSEKKKKKKKKDKKKDKHSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.33
4 0.26
5 0.27
6 0.25
7 0.2
8 0.18
9 0.17
10 0.19
11 0.22
12 0.22
13 0.2
14 0.2
15 0.21
16 0.22
17 0.22
18 0.18
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.06
38 0.05
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.14
59 0.13
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.13
81 0.17
82 0.18
83 0.27
84 0.34
85 0.39
86 0.44
87 0.53
88 0.59
89 0.61
90 0.69
91 0.7
92 0.71
93 0.71
94 0.69
95 0.58
96 0.51
97 0.48
98 0.43
99 0.35
100 0.28
101 0.24
102 0.23
103 0.24
104 0.21
105 0.18
106 0.15
107 0.12
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.11
112 0.13
113 0.18
114 0.25
115 0.27
116 0.26
117 0.29
118 0.29
119 0.28
120 0.31
121 0.29
122 0.22
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.21
140 0.25
141 0.3
142 0.34
143 0.39
144 0.39
145 0.46
146 0.45
147 0.47
148 0.46
149 0.41
150 0.34
151 0.32
152 0.38
153 0.36
154 0.4
155 0.38
156 0.34
157 0.34
158 0.37
159 0.34
160 0.28
161 0.27
162 0.21
163 0.2
164 0.22
165 0.26
166 0.27
167 0.32
168 0.38
169 0.39
170 0.42
171 0.43
172 0.46
173 0.41
174 0.35
175 0.31
176 0.27
177 0.25
178 0.23
179 0.22
180 0.17
181 0.17
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.14
191 0.16
192 0.18
193 0.2
194 0.2
195 0.19
196 0.19
197 0.19
198 0.21
199 0.18
200 0.19
201 0.25
202 0.28
203 0.34
204 0.42
205 0.45
206 0.49
207 0.55
208 0.61
209 0.6
210 0.61
211 0.58
212 0.54
213 0.54
214 0.46
215 0.4
216 0.36
217 0.35
218 0.4
219 0.45
220 0.5
221 0.57
222 0.68
223 0.79
224 0.87
225 0.92
226 0.93
227 0.95
228 0.97
229 0.97
230 0.98