Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DIJ3

Protein Details
Accession C5DIJ3    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-385TEANKGATKKKSKANKKYPPHIEQQRRIKRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-383KGATKKKSKANKKYPPHIEQQRRIK
424-441RKEKSGPKASKHSEEAKA
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG lth:KLTH0E12980g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MSSDMNELDEESFIPSSLLDSDDEADELPQDWSHIAKLSKGQVVVPKRGEKDYEPDGTNAQELLLHKAKTVMFDSLSDASRGSVVKNLIKAYYVPDLHKACVPHPKGSFMHTMGKVDRDGACWLSFFEFVYLAERGTIAPYYKRKESEDHALDPFLGIQDLYMLFKSQKESDEFAVYAHLKRLGFIVMQSLQNSAEVGSVGQFEDSAVQKLRLKFCQTFESLSKSISNPFTLPFYHPLQYHLTRYCTSAQIYESLNKLIPYAAAPKTLGELQKDLRMENVSAGIWKFSFDVWKPQSNFRKKTPGLPDFQVVVFNKNSHKENFPTYHEMRGLLKMLNCKMDFLNAPANEQAKSAETEANKGATKKKSKANKKYPPHIEQQRRIKRGYRSFVLATMDDGLVSFIRITETDFGSENVWFKPNNVPLRKEKSGPKASKHSEEAKASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.11
6 0.09
7 0.1
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.16
22 0.16
23 0.18
24 0.24
25 0.28
26 0.31
27 0.31
28 0.33
29 0.36
30 0.42
31 0.47
32 0.48
33 0.49
34 0.49
35 0.52
36 0.52
37 0.47
38 0.47
39 0.46
40 0.45
41 0.4
42 0.38
43 0.36
44 0.34
45 0.31
46 0.24
47 0.18
48 0.14
49 0.14
50 0.2
51 0.23
52 0.22
53 0.22
54 0.26
55 0.26
56 0.27
57 0.28
58 0.23
59 0.19
60 0.2
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.12
70 0.14
71 0.17
72 0.2
73 0.23
74 0.24
75 0.22
76 0.23
77 0.23
78 0.22
79 0.25
80 0.24
81 0.23
82 0.29
83 0.3
84 0.31
85 0.33
86 0.31
87 0.27
88 0.34
89 0.36
90 0.36
91 0.35
92 0.4
93 0.38
94 0.41
95 0.43
96 0.36
97 0.41
98 0.35
99 0.37
100 0.33
101 0.34
102 0.3
103 0.27
104 0.25
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.08
126 0.14
127 0.2
128 0.25
129 0.29
130 0.32
131 0.33
132 0.37
133 0.4
134 0.44
135 0.43
136 0.42
137 0.39
138 0.37
139 0.34
140 0.29
141 0.25
142 0.14
143 0.09
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.17
157 0.19
158 0.2
159 0.22
160 0.21
161 0.18
162 0.2
163 0.18
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.13
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.1
196 0.14
197 0.17
198 0.21
199 0.22
200 0.26
201 0.28
202 0.3
203 0.32
204 0.3
205 0.3
206 0.28
207 0.31
208 0.27
209 0.24
210 0.23
211 0.19
212 0.21
213 0.19
214 0.19
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.19
223 0.19
224 0.21
225 0.25
226 0.26
227 0.28
228 0.27
229 0.27
230 0.25
231 0.27
232 0.26
233 0.22
234 0.21
235 0.19
236 0.17
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.17
255 0.18
256 0.14
257 0.16
258 0.16
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.12
276 0.12
277 0.21
278 0.25
279 0.32
280 0.34
281 0.43
282 0.52
283 0.58
284 0.62
285 0.58
286 0.65
287 0.59
288 0.65
289 0.67
290 0.63
291 0.58
292 0.55
293 0.52
294 0.43
295 0.42
296 0.38
297 0.29
298 0.26
299 0.22
300 0.22
301 0.23
302 0.25
303 0.29
304 0.26
305 0.3
306 0.29
307 0.36
308 0.38
309 0.4
310 0.44
311 0.42
312 0.44
313 0.41
314 0.39
315 0.34
316 0.32
317 0.28
318 0.23
319 0.24
320 0.25
321 0.26
322 0.31
323 0.29
324 0.28
325 0.26
326 0.27
327 0.26
328 0.23
329 0.29
330 0.23
331 0.25
332 0.26
333 0.27
334 0.24
335 0.23
336 0.21
337 0.14
338 0.16
339 0.16
340 0.18
341 0.17
342 0.2
343 0.21
344 0.23
345 0.24
346 0.25
347 0.3
348 0.35
349 0.43
350 0.46
351 0.54
352 0.61
353 0.7
354 0.79
355 0.83
356 0.84
357 0.86
358 0.9
359 0.91
360 0.87
361 0.86
362 0.86
363 0.85
364 0.84
365 0.85
366 0.85
367 0.8
368 0.78
369 0.75
370 0.75
371 0.74
372 0.73
373 0.66
374 0.62
375 0.59
376 0.58
377 0.54
378 0.44
379 0.35
380 0.29
381 0.24
382 0.17
383 0.16
384 0.13
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.15
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.19
399 0.19
400 0.17
401 0.18
402 0.17
403 0.18
404 0.26
405 0.33
406 0.42
407 0.46
408 0.51
409 0.58
410 0.67
411 0.7
412 0.68
413 0.68
414 0.69
415 0.73
416 0.74
417 0.73
418 0.75
419 0.77
420 0.78
421 0.76
422 0.74
423 0.71