Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBA1

Protein Details
Accession C5DBA1    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-182IKRYRSPSIKTKQKARKHSCTCHLFPHydrophilic
618-640TEQLKKTPPSKVRSSNNAQRGKHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-352KRGR
638-642GKHRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
IPR026216  HDA3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG lth:KLTH0A00858g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MDLAKILDTAPEPAIVDAQTMGVSGDVSGDYWLPAPMCLYQKELSEQIVSLHYSDILKYYETEDYNTDVVLHSMQTMCLNSEYVATHPYLLIDHCVPKSLITKDIPNHLAETSGKFAVLKDLITLIQDYETETAIVCRSGRTMDLLEALLLGNRVNIKRYRSPSIKTKQKARKHSCTCHLFPSDGFDETSGLPVDPKIYFDLLLCLDPTVDTSMPHIQQILTQARPSSGPGKQAPIVRLTTINAIDHCELYHSKLLDPKSREYLVRVSAAVVVLRDVVGTLPPDLRPIYSQGLKYLVEWLEDPSIPWPLPDIYPIKTFTPMDVEKSLLTEVRFNQANENLAHVFNNGKKRGRKPNSAYSKEGEPISYYQSKRLKNDYSTNPLKQNMAQLTGIATINDGGSVNYHLSGGLLTHKLIQSIGEAYYNLDRQSAELQNFETKEQNQVHRLELVMKEHEDIKNQLEPAIKAQDYNREESTRLLAVVEEEHKKVASSMEELDTYTETLREKSPDFSKLIDCLLEIAKVQEEIEKQQKLKVSRNNEHTYMTEELRRANEALAGFQAEKAPIAEETQQLEQKIEEKLAEDRIQSQKSQERIQKLMAQINDEKAILETLDKQVASMTEQLKKTPPSKVRSSNNAQRGKHRKHSGNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.13
3 0.13
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.06
13 0.05
14 0.06
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.1
23 0.14
24 0.18
25 0.19
26 0.23
27 0.24
28 0.26
29 0.3
30 0.31
31 0.28
32 0.25
33 0.24
34 0.22
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.16
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.24
52 0.23
53 0.22
54 0.19
55 0.14
56 0.14
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.19
81 0.18
82 0.21
83 0.2
84 0.22
85 0.27
86 0.26
87 0.29
88 0.27
89 0.34
90 0.34
91 0.42
92 0.42
93 0.37
94 0.36
95 0.3
96 0.3
97 0.25
98 0.25
99 0.21
100 0.19
101 0.18
102 0.16
103 0.16
104 0.19
105 0.18
106 0.15
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.1
141 0.11
142 0.15
143 0.19
144 0.25
145 0.33
146 0.39
147 0.46
148 0.48
149 0.54
150 0.6
151 0.66
152 0.7
153 0.69
154 0.74
155 0.75
156 0.78
157 0.84
158 0.83
159 0.84
160 0.84
161 0.86
162 0.85
163 0.83
164 0.77
165 0.73
166 0.65
167 0.55
168 0.46
169 0.43
170 0.35
171 0.27
172 0.25
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.11
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.13
205 0.14
206 0.21
207 0.22
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.21
214 0.19
215 0.17
216 0.22
217 0.23
218 0.26
219 0.29
220 0.32
221 0.31
222 0.29
223 0.28
224 0.23
225 0.23
226 0.2
227 0.19
228 0.17
229 0.16
230 0.13
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.13
238 0.16
239 0.14
240 0.14
241 0.18
242 0.22
243 0.26
244 0.3
245 0.3
246 0.32
247 0.33
248 0.32
249 0.31
250 0.32
251 0.27
252 0.25
253 0.22
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.1
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.12
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.19
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.16
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.17
302 0.16
303 0.18
304 0.18
305 0.15
306 0.19
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.17
322 0.17
323 0.19
324 0.17
325 0.18
326 0.16
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.21
333 0.22
334 0.27
335 0.33
336 0.4
337 0.51
338 0.56
339 0.63
340 0.62
341 0.69
342 0.73
343 0.73
344 0.68
345 0.59
346 0.55
347 0.47
348 0.4
349 0.3
350 0.21
351 0.17
352 0.19
353 0.23
354 0.21
355 0.26
356 0.33
357 0.36
358 0.38
359 0.44
360 0.44
361 0.43
362 0.51
363 0.5
364 0.51
365 0.54
366 0.54
367 0.5
368 0.47
369 0.43
370 0.36
371 0.36
372 0.28
373 0.25
374 0.21
375 0.18
376 0.17
377 0.18
378 0.16
379 0.1
380 0.09
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.04
386 0.04
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.11
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.11
415 0.16
416 0.19
417 0.17
418 0.17
419 0.19
420 0.22
421 0.23
422 0.23
423 0.22
424 0.18
425 0.25
426 0.28
427 0.31
428 0.32
429 0.33
430 0.33
431 0.3
432 0.3
433 0.27
434 0.24
435 0.23
436 0.2
437 0.19
438 0.19
439 0.22
440 0.22
441 0.21
442 0.21
443 0.21
444 0.22
445 0.22
446 0.24
447 0.23
448 0.22
449 0.23
450 0.27
451 0.24
452 0.22
453 0.23
454 0.3
455 0.3
456 0.33
457 0.33
458 0.28
459 0.29
460 0.29
461 0.31
462 0.22
463 0.2
464 0.15
465 0.12
466 0.12
467 0.14
468 0.17
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.13
477 0.12
478 0.14
479 0.16
480 0.16
481 0.16
482 0.17
483 0.15
484 0.14
485 0.12
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.14
490 0.16
491 0.17
492 0.22
493 0.25
494 0.29
495 0.29
496 0.3
497 0.3
498 0.29
499 0.29
500 0.23
501 0.19
502 0.17
503 0.16
504 0.14
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.12
511 0.13
512 0.18
513 0.26
514 0.3
515 0.3
516 0.33
517 0.38
518 0.4
519 0.48
520 0.5
521 0.53
522 0.57
523 0.66
524 0.69
525 0.65
526 0.62
527 0.54
528 0.51
529 0.44
530 0.37
531 0.32
532 0.27
533 0.28
534 0.27
535 0.28
536 0.24
537 0.21
538 0.22
539 0.18
540 0.18
541 0.16
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.15
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.1
551 0.12
552 0.15
553 0.16
554 0.19
555 0.23
556 0.26
557 0.25
558 0.25
559 0.24
560 0.24
561 0.23
562 0.21
563 0.17
564 0.16
565 0.19
566 0.25
567 0.27
568 0.25
569 0.3
570 0.36
571 0.38
572 0.37
573 0.41
574 0.42
575 0.45
576 0.52
577 0.53
578 0.51
579 0.52
580 0.56
581 0.55
582 0.53
583 0.54
584 0.47
585 0.46
586 0.43
587 0.43
588 0.4
589 0.34
590 0.29
591 0.23
592 0.22
593 0.16
594 0.14
595 0.14
596 0.16
597 0.19
598 0.19
599 0.18
600 0.19
601 0.19
602 0.2
603 0.23
604 0.25
605 0.28
606 0.3
607 0.33
608 0.37
609 0.43
610 0.45
611 0.48
612 0.52
613 0.52
614 0.61
615 0.68
616 0.71
617 0.74
618 0.8
619 0.8
620 0.82
621 0.84
622 0.77
623 0.78
624 0.8
625 0.79
626 0.8
627 0.8