Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DLC1

Protein Details
Accession C5DLC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-264GTSWWRRVLKRLVRGRARPRTAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-49RRR
255-259RGRAR
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 4, plas 4, nucl 3, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000479  CIMR_rpt  
IPR009011  Man6P_isomerase_rcpt-bd_dom_sf  
IPR044865  MRH_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005537  F:mannose binding  
GO:0038023  F:signaling receptor activity  
GO:0007041  P:lysosomal transport  
KEGG lth:KLTH0F11748g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00878  CIMR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51914  MRH  
Amino Acid Sequences METRSTRDAAPDADDELFCAVMNPVTGNYIDLSHLSTTPNKLGKGERRRKGTEDSEKTRWVVRSKETGLNFTLGVCSSPASEDDEVANTTGAFYVDPVSSRQVSIGEFATQPRFMGKKLTLAYEDGDVCPNGVDGKAALLNFVCDKEIATKAQVQFVGSLHDCSYYFEVRSIYACPTSHKSNDVNVLGIFFGIFLVFFAVEWGRRWFYRKMRSRMRYTGGAGSAASGAADRMMRPQWENVEGTSWWRRVLKRLVRGRARPRTAAIKLSSAPQYHSPSTDSLVRDMEAQNRLLDNLEAVGEDATTVVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.18
4 0.16
5 0.12
6 0.11
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.17
24 0.2
25 0.26
26 0.29
27 0.28
28 0.3
29 0.38
30 0.45
31 0.53
32 0.6
33 0.62
34 0.66
35 0.7
36 0.71
37 0.71
38 0.71
39 0.71
40 0.71
41 0.7
42 0.68
43 0.66
44 0.62
45 0.59
46 0.54
47 0.48
48 0.43
49 0.41
50 0.44
51 0.46
52 0.51
53 0.48
54 0.46
55 0.42
56 0.38
57 0.33
58 0.24
59 0.2
60 0.13
61 0.12
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.17
103 0.17
104 0.21
105 0.22
106 0.24
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.19
111 0.19
112 0.13
113 0.13
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.14
138 0.14
139 0.17
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.18
164 0.21
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.25
169 0.3
170 0.28
171 0.25
172 0.21
173 0.2
174 0.16
175 0.14
176 0.11
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.02
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.1
190 0.12
191 0.13
192 0.17
193 0.24
194 0.32
195 0.42
196 0.51
197 0.57
198 0.66
199 0.73
200 0.77
201 0.77
202 0.74
203 0.68
204 0.61
205 0.56
206 0.46
207 0.39
208 0.3
209 0.24
210 0.18
211 0.13
212 0.1
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.08
219 0.11
220 0.13
221 0.15
222 0.18
223 0.21
224 0.24
225 0.25
226 0.22
227 0.23
228 0.21
229 0.25
230 0.28
231 0.25
232 0.25
233 0.29
234 0.3
235 0.35
236 0.45
237 0.48
238 0.52
239 0.61
240 0.68
241 0.72
242 0.81
243 0.84
244 0.84
245 0.81
246 0.74
247 0.69
248 0.68
249 0.63
250 0.6
251 0.52
252 0.46
253 0.41
254 0.43
255 0.43
256 0.35
257 0.35
258 0.34
259 0.38
260 0.35
261 0.36
262 0.34
263 0.3
264 0.33
265 0.35
266 0.29
267 0.26
268 0.26
269 0.24
270 0.25
271 0.26
272 0.29
273 0.27
274 0.26
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.23
279 0.21
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.07