Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJS3

Protein Details
Accession C5DJS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
482-514GDNGASKKSKAKQKPKQKQLTSKQLRNLQKHEHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
474-500RKRTAADGGDNGASKKSKAKQKPKQKQ
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.666, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG lth:KLTH0F18700g  -  
Amino Acid Sequences MGKKKVKNSQDLSSLASNKSPVLELKFNEPLFALACHPEQALLFSGLSTGHILCHRYEPDALQKRMKKNEHAAAKAKEGEPAENKKFWTVVEAREDGSSNTEGFELVWKTKRHKGSVRSICLDADGTHVYSIGADCVLKKANSQTGKVVKKTQVSQDTGVKFTKIVKSATHPFLLLGDESGNVIVLNSETLELKNTIRGIHNGDAINDIFHFTGKSIHKFVSLGQTTLAYWDARESNEGDMQIPADDLDAKRKVRLSEDQEDEILCGTFLDPQDGETLICGMGEGILTIWKPKKNDLVDQISRIKVKKDESLDCMISTLQDDSCVWVGCSDGHLYRVNVKTSKVVEIRKHSGLDEVLFLDLDSEYRLVSGGMDKVKIWESSASDDDDREQQAEIDSDSSASEMGPDDSSSNSELESGSDVELEEDPEGSGSDEDSDESTFEEGELVGLSKEELLKELDKDLCGSDQEEGSKPSRKRTAADGGDNGASKKSKAKQKPKQKQLTSKQLRNLQKHEHGIKRFEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.45
3 0.41
4 0.35
5 0.28
6 0.28
7 0.25
8 0.22
9 0.25
10 0.29
11 0.29
12 0.35
13 0.42
14 0.4
15 0.39
16 0.35
17 0.29
18 0.25
19 0.25
20 0.2
21 0.15
22 0.16
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.09
37 0.1
38 0.13
39 0.15
40 0.16
41 0.22
42 0.22
43 0.24
44 0.25
45 0.26
46 0.34
47 0.43
48 0.46
49 0.49
50 0.55
51 0.61
52 0.69
53 0.72
54 0.7
55 0.7
56 0.74
57 0.74
58 0.74
59 0.73
60 0.67
61 0.66
62 0.62
63 0.53
64 0.49
65 0.41
66 0.4
67 0.39
68 0.44
69 0.44
70 0.42
71 0.42
72 0.39
73 0.39
74 0.33
75 0.33
76 0.28
77 0.28
78 0.31
79 0.32
80 0.31
81 0.32
82 0.32
83 0.25
84 0.25
85 0.21
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.15
92 0.13
93 0.16
94 0.23
95 0.25
96 0.31
97 0.39
98 0.45
99 0.49
100 0.55
101 0.59
102 0.64
103 0.71
104 0.73
105 0.69
106 0.64
107 0.56
108 0.48
109 0.41
110 0.3
111 0.23
112 0.17
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.16
128 0.24
129 0.27
130 0.29
131 0.34
132 0.41
133 0.47
134 0.48
135 0.5
136 0.48
137 0.49
138 0.52
139 0.52
140 0.5
141 0.48
142 0.49
143 0.49
144 0.47
145 0.44
146 0.41
147 0.33
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.24
152 0.23
153 0.22
154 0.28
155 0.35
156 0.37
157 0.34
158 0.29
159 0.26
160 0.25
161 0.24
162 0.18
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.15
186 0.19
187 0.19
188 0.23
189 0.21
190 0.21
191 0.21
192 0.19
193 0.18
194 0.13
195 0.12
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.05
200 0.12
201 0.15
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.2
206 0.2
207 0.21
208 0.24
209 0.22
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.07
217 0.06
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.11
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.19
240 0.2
241 0.22
242 0.29
243 0.31
244 0.35
245 0.37
246 0.37
247 0.35
248 0.34
249 0.3
250 0.23
251 0.16
252 0.08
253 0.05
254 0.04
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.02
273 0.03
274 0.03
275 0.07
276 0.1
277 0.13
278 0.14
279 0.17
280 0.25
281 0.27
282 0.32
283 0.37
284 0.42
285 0.42
286 0.45
287 0.46
288 0.41
289 0.41
290 0.36
291 0.31
292 0.26
293 0.27
294 0.28
295 0.3
296 0.32
297 0.34
298 0.38
299 0.36
300 0.32
301 0.3
302 0.24
303 0.18
304 0.15
305 0.12
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.19
323 0.22
324 0.25
325 0.24
326 0.25
327 0.27
328 0.27
329 0.33
330 0.32
331 0.35
332 0.37
333 0.43
334 0.47
335 0.46
336 0.45
337 0.38
338 0.36
339 0.31
340 0.25
341 0.19
342 0.14
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.07
357 0.1
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.14
362 0.16
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.2
375 0.17
376 0.15
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.12
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.12
441 0.14
442 0.15
443 0.2
444 0.21
445 0.2
446 0.21
447 0.21
448 0.2
449 0.19
450 0.19
451 0.16
452 0.16
453 0.19
454 0.2
455 0.22
456 0.25
457 0.32
458 0.33
459 0.4
460 0.47
461 0.47
462 0.47
463 0.51
464 0.58
465 0.57
466 0.62
467 0.56
468 0.5
469 0.5
470 0.49
471 0.41
472 0.35
473 0.28
474 0.23
475 0.28
476 0.33
477 0.4
478 0.5
479 0.61
480 0.68
481 0.78
482 0.88
483 0.91
484 0.94
485 0.94
486 0.94
487 0.93
488 0.94
489 0.93
490 0.9
491 0.88
492 0.87
493 0.86
494 0.84
495 0.81
496 0.79
497 0.78
498 0.79
499 0.8
500 0.79
501 0.76
502 0.73