Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DGS4

Protein Details
Accession C5DGS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-42LFAVLKNSRARPRPRESRLRRRVHKQMNISPTPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-33SRARPRPRESRLRRRVHK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021611  Spc42  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005816  C:spindle pole body  
KEGG lth:KLTH0D07854g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11544  Spc42p  
Amino Acid Sequences MSPHTEGPLFAVLKNSRARPRPRESRLRRRVHKQMNISPTPKRYNSRGYEFPRSNDEAFHPFNREPPMVPSERILPEEYRVNSQMINKLIKQNKDLTQQLDRKQDEIDRLNVLVGSLRGKLIKYTELNKKLEQAAAGARQSSPDDVLQVNRTRPREPPAGGTRLDDRLSDLYSKLETLTELVVGSAAADRGARDHVHVPSAGATRTPSSGASVSHRPLQPGAASEDDILTQESAELKGLEDQIDLLKRKLLIKRENELRKLSLNKELLDLMEKLDVSRPAGPVPSSSTPPHCDQCHKAAYQTAAANGGHGVPAGAGSGAGAGASMPSPRNPPYMSMAQVLETPTPAHRSSHKPNDTLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.44
4 0.52
5 0.62
6 0.63
7 0.73
8 0.77
9 0.81
10 0.85
11 0.87
12 0.9
13 0.91
14 0.92
15 0.91
16 0.9
17 0.91
18 0.9
19 0.89
20 0.87
21 0.86
22 0.85
23 0.84
24 0.78
25 0.75
26 0.72
27 0.7
28 0.67
29 0.63
30 0.6
31 0.61
32 0.64
33 0.65
34 0.67
35 0.66
36 0.7
37 0.68
38 0.64
39 0.61
40 0.59
41 0.51
42 0.44
43 0.41
44 0.37
45 0.38
46 0.37
47 0.36
48 0.31
49 0.35
50 0.38
51 0.35
52 0.3
53 0.31
54 0.35
55 0.33
56 0.33
57 0.3
58 0.31
59 0.32
60 0.32
61 0.3
62 0.24
63 0.24
64 0.3
65 0.3
66 0.28
67 0.28
68 0.26
69 0.26
70 0.28
71 0.31
72 0.29
73 0.31
74 0.29
75 0.36
76 0.41
77 0.42
78 0.42
79 0.44
80 0.45
81 0.49
82 0.5
83 0.46
84 0.5
85 0.53
86 0.56
87 0.58
88 0.53
89 0.47
90 0.46
91 0.44
92 0.41
93 0.38
94 0.34
95 0.26
96 0.25
97 0.25
98 0.22
99 0.19
100 0.13
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.17
110 0.18
111 0.25
112 0.34
113 0.4
114 0.43
115 0.43
116 0.44
117 0.4
118 0.38
119 0.31
120 0.23
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.15
135 0.17
136 0.21
137 0.25
138 0.27
139 0.27
140 0.29
141 0.33
142 0.35
143 0.33
144 0.36
145 0.37
146 0.38
147 0.37
148 0.36
149 0.32
150 0.29
151 0.28
152 0.21
153 0.17
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.06
179 0.06
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.13
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.14
199 0.17
200 0.18
201 0.23
202 0.24
203 0.23
204 0.23
205 0.23
206 0.19
207 0.17
208 0.18
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.15
231 0.16
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.23
236 0.27
237 0.33
238 0.37
239 0.42
240 0.5
241 0.58
242 0.65
243 0.64
244 0.63
245 0.56
246 0.54
247 0.53
248 0.47
249 0.46
250 0.41
251 0.37
252 0.35
253 0.33
254 0.27
255 0.25
256 0.22
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.26
274 0.3
275 0.32
276 0.36
277 0.41
278 0.38
279 0.41
280 0.42
281 0.47
282 0.49
283 0.46
284 0.44
285 0.42
286 0.41
287 0.39
288 0.35
289 0.29
290 0.25
291 0.24
292 0.22
293 0.18
294 0.16
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.06
312 0.08
313 0.1
314 0.15
315 0.17
316 0.23
317 0.24
318 0.26
319 0.31
320 0.35
321 0.36
322 0.35
323 0.34
324 0.3
325 0.3
326 0.29
327 0.23
328 0.19
329 0.17
330 0.17
331 0.21
332 0.21
333 0.23
334 0.27
335 0.36
336 0.45
337 0.55
338 0.59