FuNGI

C5DDU1

Protein Details

Accession

C5DDU1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
717-742	VANKNSKYFKKVKKASYNIRLRKQQK	Hydrophilic
929-957	YNDIRSQDSKKPLHPRRRKSKAIPGSDVM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
938-949	KKPLHPRRRKSK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039171 Cwc2/Slt11 IPR018885 mRNA-bd_dom IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR018835 RNA-binding_domain_put IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	lth:KLTH0C03784g -
Pfam	View protein in Pfam PF10567 Nab6_mRNP_bdg PF10378 RRM
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSSYTPSAHRSMGKHPKGLYAEQRSHVALPEGSREYSGYYHGNRVPPAPQTPFDTSYGVSLLPSHLLMSSPFLATPGMGSASPHRAGGSRSSHAQSSYHTPNFGSTQLRMPPPTEKRNFKHGSSYRHNSSVQQRAYEVVFHILPRSADGGGDEYMTRSLLFSNLNPDTHLHDFLTKFEKFDRVESVYLVDSQQQSVLVSFLTKETCLDFYNGVLQKLSEFKKELKSKELTLNFASLRDVKTGPTLQEIKIEVLRAGATRSLILEFQDKVDLALLSKSLGFIVNEGPRYVVEAIEIVNAGRSSKHFGPHYAIIHFISIAMALETVEYLKSQSNKLAGLIKFRYVNTTSASGKSEFQTLSSSQLNERALSNTSDSDISGGESVASLGSKLQQTSLGEQTLVVDPTQYGRPLVEERSEHLPHVTISKALNSKSSLNDLTSNTTSPQPQEVLVNDHEDSSSRGSMVSLKQANSHGPAYPPIPGYPFYMNMSKPLGQTLQQQYTTTAQVATAMGGGLGNRTVYIGNISPRSKTEDICNVVRGGILQSVKYIEAKHICFVTFIEAASAVQFFANSTIEPIVLHGNVLKVGWGHHSGNLPQSISLAVTIGASRNVYVSLPEHAFKDKFIKDPEYQEFKEKFQLPSKEQLYEDFSVFGDIELVNFLEDGHCCWINFMNISNAIKLVEDANNPNNDSFHEKFGNRYKGLFIGYGKDRCGNVNKNLVANKNSKYFKKVKKASYNIRLRKQQKGASDAPTEVKDEAKELDKPIKADAFGISVGDTQNLVRDSDEEQKLEEDELLRLSDLNNTGGGLGISLASSTGEETNTPVSDESSKEESVSSESSDVDILVSAPGSADTSQLESKTAPRSPKQPRVLANVPEKPSAFSAIIPRVSSASLDAVPPLAPSTLSRQYTATSKHNSRRGSRFGTTEKSSPRYNDIRSQDSKKPLHPRRRKSKAIPGSDVMAQYLAQLQHSTFMYAANILGVDDGETVFYDENGPTTDPLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.55
3	0.59
4	0.58
5	0.62
6	0.61
7	0.6
8	0.6
9	0.57
10	0.59
11	0.53
12	0.48
13	0.43
14	0.36
15	0.29
16	0.24
17	0.29
18	0.28
19	0.27
20	0.27
21	0.25
22	0.24
23	0.23
24	0.24
25	0.24
26	0.23
27	0.3
28	0.34
29	0.38
30	0.38
31	0.39
32	0.39
33	0.39
34	0.43
35	0.41
36	0.38
37	0.4
38	0.45
39	0.46
40	0.44
41	0.4
42	0.34
43	0.3
44	0.29
45	0.22
46	0.16
47	0.13
48	0.12
49	0.11
50	0.11
51	0.1
52	0.09
53	0.1
54	0.1
55	0.14
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.11
67	0.14
68	0.2
69	0.21
70	0.21
71	0.2
72	0.2
73	0.23
74	0.29
75	0.31
76	0.29
77	0.33
78	0.36
79	0.37
80	0.37
81	0.36
82	0.32
83	0.33
84	0.39
85	0.36
86	0.34
87	0.33
88	0.34
89	0.35
90	0.35
91	0.31
92	0.24
93	0.28
94	0.33
95	0.36
96	0.35
97	0.35
98	0.41
99	0.46
100	0.55
101	0.58
102	0.61
103	0.62
104	0.71
105	0.74
106	0.66
107	0.69
108	0.66
109	0.66
110	0.66
111	0.7
112	0.65
113	0.65
114	0.64
115	0.59
116	0.61
117	0.61
118	0.54
119	0.48
120	0.43
121	0.4
122	0.39
123	0.34
124	0.26
125	0.2
126	0.18
127	0.16
128	0.17
129	0.17
130	0.16
131	0.16
132	0.17
133	0.13
134	0.12
135	0.13
136	0.14
137	0.12
138	0.13
139	0.11
140	0.1
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.08
145	0.08
146	0.09
147	0.11
148	0.11
149	0.19
150	0.21
151	0.21
152	0.22
153	0.23
154	0.26
155	0.27
156	0.28
157	0.22
158	0.24
159	0.24
160	0.27
161	0.32
162	0.26
163	0.24
164	0.25
165	0.3
166	0.27
167	0.3
168	0.32
169	0.3
170	0.3
171	0.29
172	0.29
173	0.24
174	0.23
175	0.21
176	0.19
177	0.16
178	0.15
179	0.15
180	0.13
181	0.13
182	0.12
183	0.12
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.11
192	0.12
193	0.13
194	0.15
195	0.13
196	0.13
197	0.21
198	0.23
199	0.21
200	0.2
201	0.18
202	0.18
203	0.25
204	0.26
205	0.22
206	0.23
207	0.27
208	0.36
209	0.44
210	0.45
211	0.46
212	0.47
213	0.48
214	0.54
215	0.54
216	0.48
217	0.42
218	0.43
219	0.36
220	0.32
221	0.3
222	0.23
223	0.21
224	0.2
225	0.19
226	0.16
227	0.2
228	0.22
229	0.21
230	0.25
231	0.26
232	0.24
233	0.28
234	0.28
235	0.26
236	0.25
237	0.25
238	0.18
239	0.16
240	0.16
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.09
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.12
251	0.12
252	0.12
253	0.14
254	0.13
255	0.12
256	0.13
257	0.12
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.12
269	0.15
270	0.16
271	0.16
272	0.16
273	0.15
274	0.18
275	0.17
276	0.12
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.14
289	0.16
290	0.22
291	0.22
292	0.24
293	0.29
294	0.34
295	0.35
296	0.29
297	0.29
298	0.23
299	0.22
300	0.2
301	0.15
302	0.09
303	0.07
304	0.06
305	0.04
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.08
315	0.1
316	0.11
317	0.14
318	0.15
319	0.16
320	0.17
321	0.24
322	0.21
323	0.27
324	0.27
325	0.27
326	0.28
327	0.27
328	0.3
329	0.24
330	0.25
331	0.21
332	0.24
333	0.23
334	0.22
335	0.24
336	0.21
337	0.21
338	0.2
339	0.21
340	0.17
341	0.16
342	0.17
343	0.15
344	0.18
345	0.18
346	0.18
347	0.16
348	0.2
349	0.2
350	0.18
351	0.18
352	0.16
353	0.16
354	0.16
355	0.17
356	0.12
357	0.13
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.03
371	0.03
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.1
377	0.12
378	0.15
379	0.17
380	0.15
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.09
387	0.07
388	0.07
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.07
394	0.1
395	0.12
396	0.13
397	0.15
398	0.14
399	0.17
400	0.24
401	0.24
402	0.22
403	0.21
404	0.2
405	0.17
406	0.18
407	0.15
408	0.1
409	0.1
410	0.14
411	0.16
412	0.16
413	0.18
414	0.18
415	0.2
416	0.19
417	0.22
418	0.19
419	0.17
420	0.2
421	0.19
422	0.21
423	0.2
424	0.19
425	0.17
426	0.18
427	0.17
428	0.15
429	0.16
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.15
435	0.15
436	0.16
437	0.15
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.13
442	0.11
443	0.1
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.11
448	0.11
449	0.16
450	0.17
451	0.17
452	0.19
453	0.2
454	0.21
455	0.21
456	0.21
457	0.15
458	0.13
459	0.14
460	0.13
461	0.14
462	0.14
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.14
467	0.14
468	0.15
469	0.15
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.19
474	0.17
475	0.16
476	0.16
477	0.15
478	0.13
479	0.2
480	0.23
481	0.24
482	0.24
483	0.24
484	0.24
485	0.25
486	0.24
487	0.18
488	0.13
489	0.09
490	0.09
491	0.08
492	0.07
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.05
506	0.06
507	0.09
508	0.13
509	0.14
510	0.14
511	0.15
512	0.22
513	0.22
514	0.21
515	0.23
516	0.26
517	0.29
518	0.3
519	0.3
520	0.23
521	0.22
522	0.21
523	0.17
524	0.11
525	0.1
526	0.09
527	0.08
528	0.08
529	0.09
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.14
535	0.15
536	0.16
537	0.16
538	0.16
539	0.15
540	0.15
541	0.15
542	0.11
543	0.1
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.06
571	0.08
572	0.11
573	0.11
574	0.13
575	0.15
576	0.16
577	0.19
578	0.2
579	0.18
580	0.14
581	0.14
582	0.11
583	0.1
584	0.09
585	0.06
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.1
599	0.11
600	0.12
601	0.13
602	0.16
603	0.16
604	0.16
605	0.22
606	0.21
607	0.24
608	0.27
609	0.31
610	0.3
611	0.37
612	0.43
613	0.43
614	0.42
615	0.46
616	0.44
617	0.41
618	0.45
619	0.42
620	0.39
621	0.39
622	0.45
623	0.39
624	0.46
625	0.47
626	0.43
627	0.39
628	0.38
629	0.35
630	0.3
631	0.28
632	0.2
633	0.17
634	0.15
635	0.15
636	0.12
637	0.08
638	0.06
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.04
644	0.05
645	0.04
646	0.05
647	0.06
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.1
652	0.12
653	0.12
654	0.13
655	0.13
656	0.12
657	0.15
658	0.16
659	0.16
660	0.14
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.11
665	0.1
666	0.12
667	0.15
668	0.19
669	0.21
670	0.21
671	0.21
672	0.19
673	0.19
674	0.24
675	0.22
676	0.23
677	0.25
678	0.25
679	0.31
680	0.4
681	0.46
682	0.39
683	0.39
684	0.35
685	0.33
686	0.34
687	0.31
688	0.22
689	0.21
690	0.25
691	0.27
692	0.26
693	0.27
694	0.26
695	0.27
696	0.34
697	0.34
698	0.34
699	0.4
700	0.4
701	0.41
702	0.45
703	0.45
704	0.43
705	0.42
706	0.4
707	0.4
708	0.43
709	0.41
710	0.45
711	0.51
712	0.55
713	0.61
714	0.66
715	0.68
716	0.74
717	0.81
718	0.84
719	0.85
720	0.86
721	0.84
722	0.84
723	0.84
724	0.78
725	0.78
726	0.75
727	0.7
728	0.64
729	0.63
730	0.59
731	0.55
732	0.53
733	0.45
734	0.4
735	0.36
736	0.32
737	0.26
738	0.22
739	0.17
740	0.16
741	0.16
742	0.16
743	0.18
744	0.19
745	0.26
746	0.27
747	0.27
748	0.29
749	0.29
750	0.26
751	0.24
752	0.22
753	0.16
754	0.14
755	0.14
756	0.11
757	0.1
758	0.1
759	0.09
760	0.09
761	0.07
762	0.11
763	0.11
764	0.11
765	0.1
766	0.12
767	0.15
768	0.23
769	0.26
770	0.23
771	0.23
772	0.23
773	0.24
774	0.23
775	0.21
776	0.13
777	0.11
778	0.12
779	0.12
780	0.11
781	0.1
782	0.1
783	0.13
784	0.13
785	0.13
786	0.12
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.06
792	0.05
793	0.04
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.04
799	0.05
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.09
804	0.11
805	0.12
806	0.12
807	0.11
808	0.13
809	0.14
810	0.16
811	0.19
812	0.21
813	0.21
814	0.2
815	0.2
816	0.19
817	0.21
818	0.21
819	0.17
820	0.14
821	0.14
822	0.14
823	0.14
824	0.13
825	0.09
826	0.08
827	0.07
828	0.06
829	0.06
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.06
834	0.06
835	0.07
836	0.07
837	0.11
838	0.13
839	0.13
840	0.14
841	0.14
842	0.18
843	0.24
844	0.29
845	0.32
846	0.35
847	0.45
848	0.54
849	0.63
850	0.67
851	0.68
852	0.68
853	0.71
854	0.74
855	0.72
856	0.71
857	0.68
858	0.63
859	0.6
860	0.55
861	0.48
862	0.42
863	0.37
864	0.29
865	0.23
866	0.27
867	0.29
868	0.31
869	0.29
870	0.28
871	0.25
872	0.25
873	0.23
874	0.18
875	0.15
876	0.13
877	0.13
878	0.13
879	0.12
880	0.12
881	0.12
882	0.11
883	0.09
884	0.08
885	0.1
886	0.17
887	0.25
888	0.26
889	0.27
890	0.27
891	0.29
892	0.35
893	0.4
894	0.4
895	0.41
896	0.49
897	0.56
898	0.63
899	0.67
900	0.69
901	0.72
902	0.73
903	0.71
904	0.66
905	0.65
906	0.64
907	0.65
908	0.61
909	0.6
910	0.58
911	0.55
912	0.55
913	0.51
914	0.53
915	0.53
916	0.53
917	0.55
918	0.54
919	0.59
920	0.61
921	0.65
922	0.65
923	0.67
924	0.68
925	0.67
926	0.72
927	0.73
928	0.77
929	0.81
930	0.84
931	0.86
932	0.9
933	0.92
934	0.9
935	0.91
936	0.9
937	0.88
938	0.84
939	0.76
940	0.69
941	0.62
942	0.53
943	0.43
944	0.33
945	0.24
946	0.17
947	0.19
948	0.16
949	0.14
950	0.14
951	0.13
952	0.17
953	0.18
954	0.19
955	0.14
956	0.14
957	0.14
958	0.14
959	0.14
960	0.1
961	0.09
962	0.08
963	0.08
964	0.07
965	0.06
966	0.06
967	0.06
968	0.06
969	0.07
970	0.08
971	0.08
972	0.08
973	0.1
974	0.09
975	0.11
976	0.13
977	0.14

C5DDU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer