Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C9M2

Protein Details
Accession A0A550C9M2    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-258LMKRRLEELKARKAKRKAGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-113KRKKASSPSAPAKRHK
241-258KRRLEELKARKAKRKAGS
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040050  ZNF830-like  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MADVRALLKAKRQQAAPRIAHPLALYTQNNQLQCRACNVPVKEFMWEGHVGSKKHRTAVARMREEQARAEEEARSNEANQEEEDDADEDAYEQADGAKRKKASSPSAPAKRHKPDTASGFPGNFFSDPTRQLPTPSADDEEGEDGEGMQVDGLPADQQPPAADDPLAAEYAAFMASVAQTSADAAETQHDTYERATGAPPDDPEETEDQKRVRIDKEIIMDRLVEEERAQEEADMRVILMKRRLEELKARKAKRKAGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.67
3 0.63
4 0.61
5 0.61
6 0.56
7 0.53
8 0.44
9 0.38
10 0.3
11 0.33
12 0.29
13 0.23
14 0.32
15 0.34
16 0.37
17 0.35
18 0.37
19 0.34
20 0.34
21 0.37
22 0.33
23 0.32
24 0.38
25 0.39
26 0.4
27 0.42
28 0.41
29 0.38
30 0.35
31 0.31
32 0.27
33 0.26
34 0.21
35 0.22
36 0.27
37 0.25
38 0.3
39 0.38
40 0.36
41 0.38
42 0.42
43 0.38
44 0.42
45 0.51
46 0.56
47 0.54
48 0.54
49 0.55
50 0.54
51 0.52
52 0.45
53 0.38
54 0.31
55 0.26
56 0.24
57 0.22
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.2
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.04
79 0.03
80 0.05
81 0.09
82 0.11
83 0.13
84 0.18
85 0.19
86 0.21
87 0.26
88 0.31
89 0.34
90 0.4
91 0.47
92 0.52
93 0.61
94 0.65
95 0.66
96 0.68
97 0.68
98 0.66
99 0.59
100 0.52
101 0.48
102 0.5
103 0.49
104 0.46
105 0.39
106 0.34
107 0.31
108 0.29
109 0.24
110 0.17
111 0.13
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.16
118 0.17
119 0.19
120 0.19
121 0.2
122 0.19
123 0.18
124 0.15
125 0.16
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.08
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.17
188 0.18
189 0.17
190 0.2
191 0.23
192 0.25
193 0.25
194 0.29
195 0.26
196 0.29
197 0.32
198 0.33
199 0.31
200 0.33
201 0.34
202 0.35
203 0.42
204 0.44
205 0.41
206 0.38
207 0.36
208 0.3
209 0.3
210 0.25
211 0.18
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.12
222 0.11
223 0.14
224 0.16
225 0.2
226 0.25
227 0.27
228 0.28
229 0.34
230 0.37
231 0.38
232 0.46
233 0.51
234 0.56
235 0.63
236 0.68
237 0.71
238 0.77