Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CQH0

Protein Details
Accession A0A550CQH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-66NQEIQARPSAKKRGKKRRRKGPLATFGNRAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-57RPSAKKRGKKRRRKGP
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047134  RNF4-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016740  F:transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MPTTATPAISLLGTRRRMEEPEHSSAVNKRARFDANQEIQARPSAKKRGKKRRRKGPLATFGNRAEDGEEDEEDEGENDTEAGPVTVAKRETKKEEDTEATAALVRSPKRGKSADAKSRPPSPPQESSEVIIARLKTQIAEQQQLLDRQTTTIQSVTSSMTCQVCLDYLQKPFALAPCGHIACYSCLKSWFTAGAGPGPDHIHKRKTCPHCRAVIRERPVEVWVVKDAAAILMKADRAAQPQLAIVAADDAPPATVPDDADPWQHIFRPVWRPRDPVDHHVADDVDEQNLGMFDAEDSVYRCFDCMHEIWSGECTNCHREYPGHRLDEDDDDEADFFPFPRLFDFFPVGDEDDMTDDEDDGHDGPPPYDFESAHGSDVGEYEDEEEGHGDGHVEGIFDVPSVIDVSSGDEDDELPVPARRRRPLYVDSDSENEVEDHPPPAEVIEIQDDEDEGLDDEGEGAMPHWPVPERSPDPYAHIAEGDFIAEDQLHDDDDSQPLFLPGDYARRGHNHLRQRAYEESEEDEDGSQDEHEALHGDYYNGDSYSDDEDNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.35
4 0.38
5 0.42
6 0.46
7 0.46
8 0.48
9 0.49
10 0.46
11 0.46
12 0.48
13 0.51
14 0.47
15 0.41
16 0.37
17 0.4
18 0.44
19 0.44
20 0.46
21 0.48
22 0.48
23 0.54
24 0.54
25 0.5
26 0.47
27 0.49
28 0.45
29 0.38
30 0.4
31 0.43
32 0.48
33 0.56
34 0.66
35 0.72
36 0.8
37 0.87
38 0.9
39 0.91
40 0.94
41 0.95
42 0.95
43 0.95
44 0.94
45 0.93
46 0.86
47 0.81
48 0.71
49 0.65
50 0.54
51 0.43
52 0.34
53 0.25
54 0.24
55 0.2
56 0.18
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.1
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.07
72 0.08
73 0.12
74 0.14
75 0.2
76 0.26
77 0.32
78 0.39
79 0.44
80 0.49
81 0.49
82 0.53
83 0.51
84 0.49
85 0.45
86 0.38
87 0.32
88 0.27
89 0.23
90 0.19
91 0.2
92 0.17
93 0.23
94 0.27
95 0.3
96 0.35
97 0.37
98 0.4
99 0.45
100 0.55
101 0.59
102 0.62
103 0.67
104 0.65
105 0.72
106 0.69
107 0.66
108 0.64
109 0.6
110 0.6
111 0.56
112 0.57
113 0.5
114 0.48
115 0.46
116 0.38
117 0.31
118 0.27
119 0.23
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.12
124 0.13
125 0.18
126 0.2
127 0.23
128 0.22
129 0.25
130 0.28
131 0.3
132 0.3
133 0.25
134 0.21
135 0.19
136 0.21
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.19
162 0.15
163 0.15
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.17
170 0.22
171 0.21
172 0.16
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.18
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.19
188 0.22
189 0.28
190 0.29
191 0.36
192 0.44
193 0.53
194 0.61
195 0.64
196 0.66
197 0.66
198 0.69
199 0.71
200 0.71
201 0.69
202 0.65
203 0.59
204 0.54
205 0.47
206 0.43
207 0.36
208 0.27
209 0.2
210 0.15
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.17
255 0.26
256 0.32
257 0.38
258 0.4
259 0.42
260 0.42
261 0.52
262 0.49
263 0.44
264 0.45
265 0.38
266 0.35
267 0.33
268 0.31
269 0.22
270 0.2
271 0.15
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.1
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.19
307 0.25
308 0.32
309 0.36
310 0.33
311 0.32
312 0.34
313 0.34
314 0.34
315 0.31
316 0.23
317 0.16
318 0.14
319 0.15
320 0.13
321 0.11
322 0.08
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.14
331 0.16
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.13
337 0.12
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.18
359 0.19
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.13
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.05
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.08
401 0.08
402 0.11
403 0.15
404 0.21
405 0.28
406 0.32
407 0.38
408 0.41
409 0.47
410 0.51
411 0.55
412 0.56
413 0.53
414 0.5
415 0.46
416 0.44
417 0.37
418 0.31
419 0.23
420 0.18
421 0.16
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.08
430 0.09
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.11
438 0.09
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.09
452 0.1
453 0.12
454 0.15
455 0.24
456 0.27
457 0.31
458 0.34
459 0.34
460 0.38
461 0.42
462 0.41
463 0.33
464 0.3
465 0.25
466 0.22
467 0.21
468 0.15
469 0.1
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.17
490 0.19
491 0.2
492 0.24
493 0.27
494 0.34
495 0.41
496 0.48
497 0.51
498 0.58
499 0.64
500 0.64
501 0.66
502 0.66
503 0.63
504 0.58
505 0.5
506 0.46
507 0.41
508 0.38
509 0.33
510 0.28
511 0.22
512 0.19
513 0.17
514 0.12
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.14
526 0.15
527 0.14
528 0.14
529 0.12
530 0.13
531 0.19