FuNGI

A0A550CCQ1

Protein Details

Accession

A0A550CCQ1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-26	ATSTMDTRSRKRVRRESQPAAVSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007319 SSU_processome_Utp21 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF04192 Utp21 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MAATSTMDTRSRKRVRRESQPAAVSPQLFAPFRALGIITNHVPFALQARSHKGAVDGPRVHLLTSVGRSWALWEGGKMGLLFVGEPAPAPITALAMDGDAVWAAAGTHLIKYARGKEVLRATNPYATPLASATVFGNHILALDDPGRRLLVFATADGTLAADISFPPGFTASRVLHPATYLNKVLVASLEGGLQLWNIRDRVHIHDFDPASLSPSPSPSAITALVQAPAIDVVGIGFADGRVVVHDVRADERLMVFSVENLIRTLAFRTDGEPILVAGDASGALSIWDLNAPPRLLHMIHGAHDAAITSVDWVPGQPLLVSAGEDNAVKQWLFDAPHAAPRLLKSRAGHRAPPTLVRFYGTDGKQVLSAGTDRALRLTSLVREARGCEMAQGSLSKKNTTLSKLGPITSLACEPARSKDWDDVVTAHAGDRFARTWTTQNKRLGKYALEGEGVVRTTALTACGTFALAAGAGGVVRMWNAQSGVMRRTFGVGDFGAGPTQPSTAASGGKAIKGTTANGKTHTTGIRKQAHRTITGIATDALNTVLVASTLDGTLNFFDFHTAELLHTLTITSTTSSNTSSAQPSTSYASSTSTSYASSASTATPPAITALHLHRDSGLLALSCDDLAVRIVDLETRAVVRVLKGFGGRVVDVTFSPDARWLVAASLDAAVRTFDVPSGRLVDVFRCVSEGSTTTSPSTPTSVAFSPAGDFLATTHVDSVGVFLWVNRAQFSDVSLQGVVEGADTAVALPGMQGDAEEEALASLSALTVQDPIASLPPTATPPQLAGDLVTLTLLPRARWMTLLNLDVIQLRNKPKEPPKAPEKAPFFLPTVPGVAPTFDLTATSTNGASAEAASSTEKHTRRLDSLESSFARTLAEEDPKGNYPSLFTIIKTLSPAALDAELRTIILPAQQARLLHALTQRLRARRDFEAVQAVMGVVLKVWGESLVGGMGTFGATRRPLDASMDDEDTSEDLHAALAELRAVQAKESERVLGLVAASLGTLGFIRETL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.77
3	0.84
4	0.89
5	0.87
6	0.87
7	0.85
8	0.76
9	0.72
10	0.67
11	0.56
12	0.46
13	0.4
14	0.36
15	0.3
16	0.28
17	0.26
18	0.22
19	0.21
20	0.22
21	0.18
22	0.15
23	0.18
24	0.22
25	0.2
26	0.21
27	0.2
28	0.19
29	0.18
30	0.16
31	0.17
32	0.17
33	0.19
34	0.22
35	0.3
36	0.34
37	0.35
38	0.35
39	0.33
40	0.35
41	0.38
42	0.44
43	0.39
44	0.38
45	0.43
46	0.42
47	0.4
48	0.35
49	0.3
50	0.26
51	0.27
52	0.26
53	0.21
54	0.21
55	0.21
56	0.21
57	0.23
58	0.2
59	0.17
60	0.16
61	0.17
62	0.17
63	0.19
64	0.16
65	0.12
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.07
83	0.07
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.05
88	0.04
89	0.03
90	0.03
91	0.03
92	0.05
93	0.06
94	0.06
95	0.09
96	0.1
97	0.13
98	0.18
99	0.24
100	0.27
101	0.32
102	0.32
103	0.36
104	0.45
105	0.49
106	0.48
107	0.48
108	0.46
109	0.48
110	0.47
111	0.43
112	0.35
113	0.28
114	0.25
115	0.2
116	0.19
117	0.13
118	0.14
119	0.11
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.11
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.11
130	0.12
131	0.13
132	0.14
133	0.14
134	0.13
135	0.13
136	0.11
137	0.14
138	0.14
139	0.13
140	0.14
141	0.14
142	0.14
143	0.13
144	0.13
145	0.07
146	0.06
147	0.06
148	0.04
149	0.04
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.08
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.17
158	0.15
159	0.19
160	0.22
161	0.23
162	0.22
163	0.22
164	0.26
165	0.24
166	0.26
167	0.24
168	0.21
169	0.21
170	0.21
171	0.2
172	0.16
173	0.13
174	0.1
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.14
187	0.17
188	0.25
189	0.3
190	0.31
191	0.29
192	0.36
193	0.36
194	0.33
195	0.33
196	0.25
197	0.23
198	0.21
199	0.22
200	0.16
201	0.17
202	0.18
203	0.16
204	0.17
205	0.14
206	0.16
207	0.15
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.14
212	0.13
213	0.12
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.05
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.09
233	0.1
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.11
242	0.09
243	0.08
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.11
251	0.12
252	0.09
253	0.11
254	0.1
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.14
260	0.12
261	0.11
262	0.11
263	0.09
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.06
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.13
282	0.13
283	0.14
284	0.18
285	0.17
286	0.17
287	0.19
288	0.18
289	0.15
290	0.15
291	0.13
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.05
304	0.05
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.14
322	0.14
323	0.2
324	0.21
325	0.2
326	0.18
327	0.19
328	0.25
329	0.23
330	0.26
331	0.22
332	0.3
333	0.39
334	0.42
335	0.45
336	0.43
337	0.48
338	0.46
339	0.51
340	0.46
341	0.39
342	0.36
343	0.32
344	0.28
345	0.25
346	0.31
347	0.25
348	0.25
349	0.23
350	0.23
351	0.21
352	0.21
353	0.17
354	0.11
355	0.11
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.1
364	0.11
365	0.1
366	0.16
367	0.17
368	0.17
369	0.17
370	0.18
371	0.19
372	0.19
373	0.18
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.12
380	0.16
381	0.17
382	0.16
383	0.16
384	0.19
385	0.22
386	0.23
387	0.25
388	0.22
389	0.28
390	0.29
391	0.28
392	0.26
393	0.23
394	0.21
395	0.18
396	0.17
397	0.12
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.14
402	0.16
403	0.17
404	0.18
405	0.21
406	0.23
407	0.23
408	0.22
409	0.2
410	0.18
411	0.16
412	0.14
413	0.11
414	0.1
415	0.09
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.09
420	0.1
421	0.11
422	0.16
423	0.25
424	0.32
425	0.38
426	0.45
427	0.52
428	0.53
429	0.55
430	0.5
431	0.42
432	0.38
433	0.33
434	0.27
435	0.2
436	0.18
437	0.15
438	0.14
439	0.13
440	0.1
441	0.07
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.04
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.02
458	0.02
459	0.02
460	0.02
461	0.02
462	0.02
463	0.02
464	0.03
465	0.03
466	0.04
467	0.05
468	0.07
469	0.09
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.12
474	0.13
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.06
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.11
494	0.11
495	0.12
496	0.12
497	0.1
498	0.11
499	0.11
500	0.12
501	0.14
502	0.18
503	0.18
504	0.2
505	0.22
506	0.21
507	0.23
508	0.27
509	0.24
510	0.24
511	0.32
512	0.38
513	0.39
514	0.42
515	0.45
516	0.43
517	0.41
518	0.38
519	0.32
520	0.24
521	0.23
522	0.2
523	0.14
524	0.12
525	0.1
526	0.09
527	0.06
528	0.05
529	0.04
530	0.04
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.04
538	0.03
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.04
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.07
562	0.08
563	0.09
564	0.1
565	0.11
566	0.12
567	0.12
568	0.12
569	0.12
570	0.13
571	0.15
572	0.14
573	0.13
574	0.11
575	0.13
576	0.13
577	0.13
578	0.13
579	0.11
580	0.1
581	0.1
582	0.1
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.06
595	0.08
596	0.1
597	0.16
598	0.16
599	0.16
600	0.15
601	0.16
602	0.15
603	0.13
604	0.12
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.06
609	0.06
610	0.05
611	0.05
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.09
628	0.09
629	0.1
630	0.11
631	0.1
632	0.11
633	0.13
634	0.12
635	0.1
636	0.1
637	0.09
638	0.09
639	0.12
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.11
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.08
651	0.06
652	0.07
653	0.07
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.07
662	0.08
663	0.09
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.14
668	0.13
669	0.16
670	0.16
671	0.15
672	0.12
673	0.12
674	0.12
675	0.12
676	0.12
677	0.13
678	0.14
679	0.15
680	0.16
681	0.16
682	0.17
683	0.17
684	0.18
685	0.14
686	0.13
687	0.16
688	0.15
689	0.17
690	0.16
691	0.15
692	0.14
693	0.13
694	0.13
695	0.09
696	0.08
697	0.06
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.09
702	0.08
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.05
710	0.09
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.12
715	0.12
716	0.13
717	0.15
718	0.15
719	0.14
720	0.15
721	0.15
722	0.14
723	0.12
724	0.12
725	0.1
726	0.05
727	0.05
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.03
735	0.03
736	0.03
737	0.03
738	0.03
739	0.03
740	0.04
741	0.04
742	0.05
743	0.05
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.03
753	0.04
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.05
758	0.06
759	0.08
760	0.09
761	0.09
762	0.09
763	0.1
764	0.13
765	0.14
766	0.14
767	0.13
768	0.13
769	0.15
770	0.15
771	0.14
772	0.11
773	0.1
774	0.1
775	0.09
776	0.08
777	0.06
778	0.06
779	0.09
780	0.09
781	0.08
782	0.12
783	0.14
784	0.15
785	0.16
786	0.17
787	0.2
788	0.23
789	0.24
790	0.21
791	0.19
792	0.2
793	0.2
794	0.21
795	0.18
796	0.19
797	0.24
798	0.29
799	0.31
800	0.39
801	0.46
802	0.56
803	0.59
804	0.63
805	0.66
806	0.69
807	0.72
808	0.72
809	0.69
810	0.61
811	0.58
812	0.52
813	0.46
814	0.39
815	0.36
816	0.27
817	0.24
818	0.21
819	0.2
820	0.17
821	0.15
822	0.14
823	0.14
824	0.13
825	0.1
826	0.11
827	0.1
828	0.11
829	0.12
830	0.12
831	0.11
832	0.1
833	0.11
834	0.1
835	0.09
836	0.08
837	0.07
838	0.06
839	0.07
840	0.08
841	0.09
842	0.12
843	0.2
844	0.22
845	0.27
846	0.32
847	0.35
848	0.38
849	0.42
850	0.44
851	0.43
852	0.45
853	0.46
854	0.42
855	0.42
856	0.39
857	0.34
858	0.29
859	0.22
860	0.21
861	0.19
862	0.24
863	0.21
864	0.21
865	0.25
866	0.28
867	0.3
868	0.28
869	0.23
870	0.2
871	0.21
872	0.25
873	0.22
874	0.19
875	0.22
876	0.22
877	0.23
878	0.23
879	0.2
880	0.16
881	0.16
882	0.16
883	0.13
884	0.13
885	0.13
886	0.11
887	0.12
888	0.12
889	0.12
890	0.11
891	0.1
892	0.08
893	0.1
894	0.13
895	0.13
896	0.16
897	0.18
898	0.18
899	0.21
900	0.24
901	0.22
902	0.23
903	0.25
904	0.3
905	0.3
906	0.39
907	0.43
908	0.46
909	0.5
910	0.51
911	0.52
912	0.49
913	0.53
914	0.46
915	0.44
916	0.46
917	0.42
918	0.36
919	0.31
920	0.26
921	0.2
922	0.18
923	0.13
924	0.05
925	0.05
926	0.05
927	0.05
928	0.05
929	0.05
930	0.05
931	0.05
932	0.06
933	0.06
934	0.05
935	0.05
936	0.05
937	0.05
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.08
942	0.1
943	0.11
944	0.14
945	0.16
946	0.17
947	0.22
948	0.24
949	0.25
950	0.27
951	0.29
952	0.26
953	0.24
954	0.24
955	0.2
956	0.18
957	0.14
958	0.1
959	0.07
960	0.07
961	0.07
962	0.07
963	0.08
964	0.07
965	0.07
966	0.07
967	0.08
968	0.12
969	0.12
970	0.13
971	0.17
972	0.2
973	0.23
974	0.24
975	0.25
976	0.21
977	0.22
978	0.22
979	0.18
980	0.15
981	0.12
982	0.1
983	0.08
984	0.07
985	0.07
986	0.06
987	0.05
988	0.05
989	0.05

A0A550CCQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer