Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DLL1

Protein Details
Accession C5DLL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-402GTAIRRRKIKMGKKSKSKKAQSQDIENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-394RRRKIKMGKKSKSKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
KEGG lth:KLTH0G01562g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
Amino Acid Sequences MSFRFNKGAFEDNSFNEQIREALTSALNSKTQSSSQTAPANTTNSAATDEVKQETRGPKRLDILKSGISVSKVNFPSTPQLEILDLDVSAQSRSLLKGICKVSCKNAMLEINTEIEANLLLLYTNDGPSFTTPRLISNDSFTVPITMTFNQIELEAITNIFVKNNSVGISFNDVNLDFDFDCSIKLLQSSIEKRLKGSMETVFKEVLPSVIFSMSQRWFTHGESTCNSASDDKSAGRQVENHSHTPRTILEDCDLEDLSPANMLRLSTLVSSRQSLSLNPTAMNTLSTIPGCLERQNLHRFNSRIPALSNFYPDFYEVESPHLKAFGRSVSTNVISSGKLEHHNALPQRVLDERSYDLKTIASVQSRIFERSSGDGTAIRRRKIKMGKKSKSKKAQSQDIENSSPTVVMPSSPSLEPSAVSTPEALHSPQPTTAVQSPELLAENSESVSIPALILPTQADHYTLPVKTSAPKLNLLEEAHYLNRKREFQKLRTSLYSPIRSNRFNLNKEMERPILEHKGLNFVGLTHGLNWGSEDLPPPYRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.3
4 0.28
5 0.22
6 0.19
7 0.18
8 0.13
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.21
17 0.22
18 0.23
19 0.26
20 0.28
21 0.29
22 0.34
23 0.4
24 0.37
25 0.38
26 0.4
27 0.39
28 0.34
29 0.32
30 0.26
31 0.2
32 0.22
33 0.19
34 0.16
35 0.17
36 0.19
37 0.21
38 0.22
39 0.23
40 0.27
41 0.36
42 0.42
43 0.47
44 0.49
45 0.5
46 0.56
47 0.63
48 0.61
49 0.57
50 0.54
51 0.49
52 0.46
53 0.43
54 0.38
55 0.31
56 0.3
57 0.25
58 0.29
59 0.27
60 0.28
61 0.26
62 0.27
63 0.34
64 0.34
65 0.35
66 0.27
67 0.26
68 0.25
69 0.25
70 0.23
71 0.15
72 0.12
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.12
82 0.14
83 0.15
84 0.23
85 0.27
86 0.3
87 0.34
88 0.36
89 0.39
90 0.45
91 0.45
92 0.39
93 0.41
94 0.4
95 0.37
96 0.37
97 0.32
98 0.25
99 0.24
100 0.22
101 0.15
102 0.12
103 0.1
104 0.08
105 0.06
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.15
117 0.14
118 0.17
119 0.17
120 0.2
121 0.25
122 0.27
123 0.26
124 0.27
125 0.28
126 0.25
127 0.25
128 0.22
129 0.18
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.12
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.15
176 0.18
177 0.26
178 0.3
179 0.3
180 0.31
181 0.35
182 0.34
183 0.28
184 0.29
185 0.26
186 0.27
187 0.29
188 0.3
189 0.26
190 0.24
191 0.24
192 0.2
193 0.15
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.13
201 0.13
202 0.17
203 0.16
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.29
208 0.26
209 0.28
210 0.26
211 0.29
212 0.27
213 0.25
214 0.25
215 0.18
216 0.16
217 0.14
218 0.15
219 0.11
220 0.13
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.17
225 0.19
226 0.27
227 0.3
228 0.33
229 0.32
230 0.32
231 0.32
232 0.31
233 0.27
234 0.25
235 0.22
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.17
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.1
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.18
283 0.27
284 0.3
285 0.31
286 0.37
287 0.37
288 0.37
289 0.41
290 0.36
291 0.29
292 0.27
293 0.27
294 0.25
295 0.25
296 0.27
297 0.2
298 0.2
299 0.18
300 0.18
301 0.15
302 0.12
303 0.14
304 0.11
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.17
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.21
331 0.22
332 0.23
333 0.21
334 0.19
335 0.19
336 0.19
337 0.2
338 0.16
339 0.16
340 0.17
341 0.2
342 0.21
343 0.2
344 0.19
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.21
353 0.22
354 0.24
355 0.21
356 0.18
357 0.18
358 0.19
359 0.2
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.19
364 0.28
365 0.31
366 0.31
367 0.34
368 0.36
369 0.44
370 0.51
371 0.58
372 0.6
373 0.66
374 0.73
375 0.79
376 0.88
377 0.89
378 0.89
379 0.89
380 0.87
381 0.85
382 0.86
383 0.81
384 0.8
385 0.77
386 0.72
387 0.65
388 0.56
389 0.47
390 0.37
391 0.31
392 0.21
393 0.15
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.17
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.13
410 0.14
411 0.16
412 0.14
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.19
418 0.18
419 0.22
420 0.25
421 0.25
422 0.24
423 0.24
424 0.23
425 0.22
426 0.23
427 0.18
428 0.14
429 0.12
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.1
448 0.13
449 0.18
450 0.18
451 0.18
452 0.18
453 0.19
454 0.22
455 0.29
456 0.33
457 0.31
458 0.37
459 0.37
460 0.39
461 0.42
462 0.39
463 0.34
464 0.3
465 0.3
466 0.28
467 0.33
468 0.32
469 0.33
470 0.38
471 0.44
472 0.45
473 0.52
474 0.58
475 0.59
476 0.69
477 0.7
478 0.7
479 0.67
480 0.67
481 0.65
482 0.65
483 0.65
484 0.59
485 0.6
486 0.6
487 0.57
488 0.58
489 0.6
490 0.6
491 0.55
492 0.59
493 0.59
494 0.59
495 0.61
496 0.64
497 0.56
498 0.49
499 0.48
500 0.47
501 0.46
502 0.41
503 0.39
504 0.34
505 0.39
506 0.37
507 0.35
508 0.28
509 0.2
510 0.22
511 0.21
512 0.21
513 0.13
514 0.17
515 0.16
516 0.16
517 0.17
518 0.15
519 0.14
520 0.14
521 0.17
522 0.18