Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550D0H6

Protein Details
Accession A0A550D0H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-57YTASQPPSGNTDKRRKRKRPDRNSPPREMLFTHydrophilic
407-459DDGPRPRQNERPPASRRRYSPPRDRRDYRPNEHIPSQQSRRPYQHLRRGRRDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-48KRRKRKRPDRN
416-432ERPPASRRRYSPPRDRR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MSEPGPSRRVPLWKRISSPPPIRADYTASQPPSGNTDKRRKRKRPDRNSPPREMLFTPWMDLCGEQYAKCDTVMDRLHYEILAYEQYMAPTPEEAEARTRTHTLITNALRDLPCVGELRLFGSSAIDLVTPTSDLDMVNSNPRLAHAGPAAAIDALWAIGRRLRQRGIVQDFNVNKWARVPIITFSTRPEFGPFDVDIGINNTDGLDGVLVMRHFLDTMPALRPLLLVLKRFLSQRDLGSAAKSGLGGYGLMCLLVAFLKNNPGGRPQSYFDTPHEELSLGVILMDFFSFYGTTFNYEELYISPEEGVFRPKADALDWIGEKAQYRLVIKCPVTPGHDVARSAGRTAQIVEAFKGGLSLLEHASPPNETVLGPLIGVPQKVVDRRRCLKTLMDSGGYGRNDAAPHYDDGPRPRQNERPPASRRRYSPPRDRRDYRPNEHIPSQQSRRPYQHLRRGRRDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.71
3 0.72
4 0.72
5 0.75
6 0.73
7 0.7
8 0.67
9 0.65
10 0.58
11 0.57
12 0.49
13 0.48
14 0.47
15 0.41
16 0.39
17 0.37
18 0.35
19 0.36
20 0.4
21 0.4
22 0.42
23 0.52
24 0.6
25 0.7
26 0.8
27 0.84
28 0.88
29 0.92
30 0.94
31 0.95
32 0.95
33 0.96
34 0.96
35 0.95
36 0.92
37 0.89
38 0.81
39 0.74
40 0.65
41 0.59
42 0.54
43 0.46
44 0.39
45 0.31
46 0.29
47 0.24
48 0.22
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.16
53 0.18
54 0.2
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.15
59 0.22
60 0.26
61 0.27
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.25
66 0.24
67 0.16
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.16
83 0.19
84 0.2
85 0.22
86 0.23
87 0.21
88 0.23
89 0.26
90 0.24
91 0.29
92 0.3
93 0.31
94 0.3
95 0.34
96 0.31
97 0.27
98 0.26
99 0.18
100 0.17
101 0.15
102 0.15
103 0.12
104 0.12
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.15
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.18
131 0.15
132 0.17
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.08
139 0.08
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.06
147 0.1
148 0.14
149 0.18
150 0.2
151 0.25
152 0.28
153 0.37
154 0.42
155 0.43
156 0.4
157 0.44
158 0.43
159 0.39
160 0.43
161 0.34
162 0.26
163 0.23
164 0.24
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.13
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.2
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.21
177 0.17
178 0.16
179 0.19
180 0.16
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.17
224 0.18
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.15
251 0.18
252 0.19
253 0.22
254 0.21
255 0.24
256 0.26
257 0.28
258 0.25
259 0.3
260 0.29
261 0.27
262 0.26
263 0.21
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.12
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.14
302 0.13
303 0.18
304 0.17
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.15
313 0.17
314 0.2
315 0.27
316 0.27
317 0.29
318 0.3
319 0.3
320 0.32
321 0.32
322 0.31
323 0.3
324 0.32
325 0.29
326 0.28
327 0.31
328 0.27
329 0.26
330 0.25
331 0.2
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.09
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.17
367 0.23
368 0.31
369 0.36
370 0.43
371 0.52
372 0.58
373 0.59
374 0.57
375 0.58
376 0.58
377 0.58
378 0.54
379 0.47
380 0.41
381 0.41
382 0.45
383 0.38
384 0.3
385 0.22
386 0.2
387 0.18
388 0.19
389 0.21
390 0.16
391 0.18
392 0.21
393 0.25
394 0.27
395 0.33
396 0.41
397 0.44
398 0.45
399 0.49
400 0.56
401 0.61
402 0.67
403 0.68
404 0.69
405 0.71
406 0.78
407 0.82
408 0.8
409 0.76
410 0.76
411 0.8
412 0.8
413 0.82
414 0.82
415 0.84
416 0.86
417 0.87
418 0.86
419 0.86
420 0.87
421 0.84
422 0.83
423 0.81
424 0.78
425 0.78
426 0.75
427 0.71
428 0.71
429 0.7
430 0.63
431 0.63
432 0.64
433 0.65
434 0.68
435 0.71
436 0.72
437 0.75
438 0.82
439 0.85