Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHF2

Protein Details
Accession C5DHF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
634-659SQDLPLNTRKRPRKHKIDENTVTDKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
643-647KRPRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.166, cyto 8, cyto_mito 7.666, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG lth:KLTH0E03872g  -  
Amino Acid Sequences MTQTAQNLLVHRARFVDYNGANITALSFSHGSRLDKRTPSDLRLALGRSNGDIEIWNPRNGWCQELVIQGGEGRTIEGLVWSNISGEPLRLFSIGGSTVVTEWNLETGLPLKNYDCNAGVIWSMAMNESQNKLAVGCDNGCVVVIDISGGSGVMEHEAVLQRQDSRILSVAWRMDEHVIGGCADGRIRVWSALKGAEMRGRILQTMKVDKSKKESTLVWCVTYLPKIDQIVSGDSTGSVKFWDFQYSTLAQSFKVHDADVLCLTADETNTKVFSAGIDRKIYNFSLAPSSSNKKAARWVVSSNRLLHSNDVRTMASYQSKGADFLVSGGVEKSLVISSMGSFSEGSYRKIPFVVPFHKNVLVNQQQRLCVMWQQSTVKIWAMGDEADSSNNYKLVCKLSLKDEQNISTCALSPDGQVLIVGRATTTKMFHLLPSNDKLKVTKLDNDFLLKNGTSHVKFVDNSRIVIVSPRNDFLLLNLEDEDSDEKPVKIELPDLKETNTGIKLPHINSINHLDVRGSFAVISRICGAVDLVNLESTSAVPVARLMNLITAIHISTRRTIALTTADNKVLEFLLHEEDGVNVGTISPWCKKNKDYLPKEFEQQKDKCLGIFSGSPDDDSIWFWSSNYLARFDMSQDLPLNTRKRPRKHKIDENTVTDKSTFIDEGEEEDDEDEDLMDETSDLLKSDLGKEDSTNRVAKNNKPFFITDKYRSLLFADLLARDQIVVVERPSSTSSSAAAFDLPKIVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.31
4 0.26
5 0.31
6 0.31
7 0.29
8 0.27
9 0.25
10 0.23
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.12
15 0.11
16 0.16
17 0.21
18 0.24
19 0.31
20 0.38
21 0.43
22 0.48
23 0.52
24 0.56
25 0.58
26 0.58
27 0.59
28 0.54
29 0.48
30 0.47
31 0.45
32 0.39
33 0.36
34 0.32
35 0.25
36 0.25
37 0.22
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.26
46 0.34
47 0.34
48 0.36
49 0.27
50 0.27
51 0.28
52 0.3
53 0.3
54 0.22
55 0.21
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.12
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.1
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.19
100 0.21
101 0.23
102 0.21
103 0.19
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.13
108 0.12
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.16
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.19
157 0.21
158 0.19
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.15
179 0.16
180 0.17
181 0.16
182 0.17
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.2
191 0.22
192 0.28
193 0.29
194 0.34
195 0.37
196 0.38
197 0.45
198 0.47
199 0.45
200 0.41
201 0.43
202 0.41
203 0.48
204 0.47
205 0.4
206 0.35
207 0.34
208 0.31
209 0.29
210 0.24
211 0.15
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.18
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.16
238 0.18
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.17
246 0.15
247 0.13
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.14
262 0.18
263 0.2
264 0.23
265 0.23
266 0.24
267 0.27
268 0.26
269 0.21
270 0.17
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.22
277 0.23
278 0.3
279 0.29
280 0.26
281 0.33
282 0.36
283 0.36
284 0.35
285 0.39
286 0.38
287 0.45
288 0.47
289 0.43
290 0.39
291 0.37
292 0.35
293 0.32
294 0.3
295 0.25
296 0.24
297 0.23
298 0.22
299 0.2
300 0.21
301 0.2
302 0.18
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.11
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.18
336 0.18
337 0.19
338 0.16
339 0.22
340 0.26
341 0.26
342 0.28
343 0.3
344 0.33
345 0.32
346 0.29
347 0.31
348 0.32
349 0.33
350 0.34
351 0.34
352 0.31
353 0.31
354 0.32
355 0.24
356 0.19
357 0.18
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.18
363 0.18
364 0.14
365 0.13
366 0.11
367 0.09
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.1
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.19
386 0.27
387 0.29
388 0.3
389 0.3
390 0.29
391 0.29
392 0.29
393 0.25
394 0.17
395 0.16
396 0.13
397 0.12
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.17
418 0.18
419 0.21
420 0.25
421 0.27
422 0.26
423 0.26
424 0.26
425 0.23
426 0.26
427 0.24
428 0.27
429 0.27
430 0.29
431 0.29
432 0.32
433 0.29
434 0.25
435 0.24
436 0.17
437 0.14
438 0.14
439 0.17
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.16
444 0.17
445 0.19
446 0.27
447 0.23
448 0.23
449 0.23
450 0.22
451 0.19
452 0.23
453 0.23
454 0.17
455 0.18
456 0.18
457 0.18
458 0.18
459 0.17
460 0.14
461 0.19
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.14
468 0.15
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.11
475 0.12
476 0.1
477 0.15
478 0.19
479 0.23
480 0.27
481 0.28
482 0.28
483 0.28
484 0.28
485 0.26
486 0.22
487 0.18
488 0.14
489 0.17
490 0.2
491 0.2
492 0.25
493 0.25
494 0.24
495 0.26
496 0.31
497 0.31
498 0.27
499 0.26
500 0.21
501 0.17
502 0.21
503 0.18
504 0.13
505 0.1
506 0.1
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.07
529 0.07
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.07
538 0.07
539 0.09
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.15
548 0.17
549 0.2
550 0.21
551 0.22
552 0.23
553 0.23
554 0.22
555 0.21
556 0.17
557 0.13
558 0.1
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.1
567 0.08
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.07
572 0.1
573 0.14
574 0.2
575 0.24
576 0.28
577 0.31
578 0.4
579 0.5
580 0.58
581 0.62
582 0.67
583 0.7
584 0.69
585 0.74
586 0.72
587 0.67
588 0.65
589 0.58
590 0.53
591 0.49
592 0.47
593 0.4
594 0.35
595 0.3
596 0.23
597 0.24
598 0.22
599 0.24
600 0.24
601 0.23
602 0.22
603 0.22
604 0.2
605 0.18
606 0.18
607 0.14
608 0.14
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.19
613 0.19
614 0.19
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.18
619 0.23
620 0.19
621 0.22
622 0.21
623 0.22
624 0.24
625 0.31
626 0.33
627 0.34
628 0.43
629 0.49
630 0.57
631 0.67
632 0.75
633 0.79
634 0.85
635 0.9
636 0.9
637 0.92
638 0.9
639 0.87
640 0.83
641 0.73
642 0.64
643 0.54
644 0.43
645 0.33
646 0.27
647 0.2
648 0.13
649 0.14
650 0.13
651 0.15
652 0.17
653 0.16
654 0.14
655 0.14
656 0.14
657 0.11
658 0.11
659 0.08
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.05
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.09
671 0.1
672 0.14
673 0.19
674 0.21
675 0.21
676 0.23
677 0.29
678 0.33
679 0.37
680 0.38
681 0.33
682 0.39
683 0.44
684 0.5
685 0.55
686 0.58
687 0.56
688 0.55
689 0.55
690 0.53
691 0.57
692 0.57
693 0.53
694 0.5
695 0.5
696 0.47
697 0.46
698 0.42
699 0.36
700 0.28
701 0.25
702 0.22
703 0.21
704 0.22
705 0.21
706 0.19
707 0.15
708 0.15
709 0.12
710 0.12
711 0.13
712 0.13
713 0.15
714 0.15
715 0.18
716 0.2
717 0.21
718 0.19
719 0.19
720 0.19
721 0.18
722 0.2
723 0.18
724 0.18
725 0.17
726 0.16