FuNGI

A0A550C5S7

Protein Details

Accession

A0A550C5S7

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
57-77	APSGPSKQRRGMKSEKRKAAE	Hydrophilic
127-151	MDAQPKPKGRGRKKATDSSARHRKS	Basic
1042-1062	QTSTRGKKRGIDEVKKQESRP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
62-84	SKQRRGMKSEKRKAAEGSLLKKR
132-150	KPKGRGRKKATDSSARHRK
1076-1085	AKRTAKKKKT

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR009057 Homeobox-like_sf IPR044754 Isw1/2_DEXHc IPR015194 ISWI_HAND-dom IPR036306 ISWI_HAND-dom_sf IPR027417 P-loop_NTPase IPR001005 SANT/Myb IPR015195 SLIDE IPR038718 SNF2-like_sf IPR000330 SNF2_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0140658 F:ATP-dependent chromatin remodeler activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0031491 F:nucleosome binding
Pfam	View protein in Pfam PF09110 HAND PF00271 Helicase_C PF09111 SLIDE PF00176 SNF2-rel_dom
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17997 DEXHc_SMARCA1_SMARCA5 cd18793 SF2_C_SNF

Amino Acid Sequences

MSSAGPATMEEDMLSDTVPSNIVSRQPSNGVSEEAADVTEDDELESEGVEDDDDMPAPSGPSKQRRGMKSEKRKAAEGSLLKKREEMDKNKIADAVKRYSYLLGQTDLFKHFVDIRRAQDPEYAAMMDAQPKPKGRGRKKATDSSARHRKSEKEEDEELLKEGERAVDGSDQPFVFEESPSFINGTMRAYQLQGLNWMVALHHNGLNGILADEMGLGKTLQTISFLSYLKHHHGIKGPHLVVVPKSTLRNWQREFEHWTPDVKAVVLAGSKEERAEIVANSLITQDFEVCITSYEVCLIEKSALKKFSFEYIVIDEAHRIKNVDSILSEVVRSFISRGRLLITGTPLQNNLQELFALLNFICPEIFQNYKDLDSFLHKDTGDGVDEEEKSKMVVEALHKILRPFLLRRVKADVEKSLLPKKEINIYVGLSEMQRKWYRSVLEKDIDAVNGLTGKKEGKTRLMNMVMQLRKVTCHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVENSGKMLILDRLLKSMKEKGSRVLIFSQMSRVLDILEDYCLFRGYKYCRIDGGTAHEDRISAIDDYNKPGSDKFIFLLTTRAGGLGINLTTADIVVLYDSDWNPQADLQAMDRAHRIGQTKQVYVFRFITEGSVEERMLERAAQKLRLDQLVIQQGRAQQSKAANKEELLEMITHGAEKIMNSSDELLINDDIDEIIHRGEQRTQELNSKYEGLNLEDLSNFKSDASVQQWEGEDFRSRKNLNFNMISLAKRERKSNYSVDNYFKDTLRAGPTKVEKAPKMPKAPKQVAVQDFQFFPQELSQLQDRELAVHKRLNDIKATTREPAGPEDTPEKLEEERQAAQEFIDTAEPLTEDEIAQKDVYVSQGFHDWTRRDYQQFVRGLETYGWGASFDLYAAEIPDKSPADVAKYYKVFSKRWTTLSDHQRIAARIAEGEQKRNKRQNLEQLLEEKIQSVNYPMQELELNYPTTKGKVYSEEEDRYLLCRLYHYGMQTEDVYERIKKDITEFPVFRFDWFFKSRSAIELNRRCNTLLGMIEKEAEQHAAEQKAQTSTRGKKRGIDEVKKQESRPPTPTGSAAGATSTAKRTAKKKKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.08
3	0.08
4	0.08
5	0.09
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.17
10	0.22
11	0.24
12	0.27
13	0.3
14	0.32
15	0.35
16	0.34
17	0.31
18	0.26
19	0.25
20	0.23
21	0.19
22	0.17
23	0.13
24	0.11
25	0.09
26	0.09
27	0.07
28	0.06
29	0.07
30	0.07
31	0.07
32	0.06
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.07
39	0.07
40	0.08
41	0.08
42	0.09
43	0.09
44	0.1
45	0.11
46	0.17
47	0.24
48	0.33
49	0.4
50	0.48
51	0.56
52	0.61
53	0.67
54	0.72
55	0.75
56	0.77
57	0.81
58	0.82
59	0.78
60	0.77
61	0.72
62	0.67
63	0.65
64	0.62
65	0.6
66	0.6
67	0.59
68	0.55
69	0.54
70	0.5
71	0.5
72	0.52
73	0.51
74	0.52
75	0.56
76	0.58
77	0.58
78	0.59
79	0.51
80	0.48
81	0.46
82	0.43
83	0.37
84	0.36
85	0.36
86	0.33
87	0.33
88	0.32
89	0.28
90	0.24
91	0.23
92	0.24
93	0.27
94	0.27
95	0.27
96	0.22
97	0.22
98	0.25
99	0.31
100	0.36
101	0.38
102	0.41
103	0.46
104	0.47
105	0.46
106	0.44
107	0.39
108	0.33
109	0.3
110	0.25
111	0.19
112	0.19
113	0.19
114	0.21
115	0.23
116	0.24
117	0.26
118	0.29
119	0.34
120	0.39
121	0.49
122	0.53
123	0.6
124	0.65
125	0.71
126	0.77
127	0.81
128	0.83
129	0.83
130	0.8
131	0.8
132	0.83
133	0.75
134	0.72
135	0.66
136	0.66
137	0.64
138	0.68
139	0.64
140	0.6
141	0.6
142	0.58
143	0.57
144	0.51
145	0.42
146	0.32
147	0.25
148	0.18
149	0.15
150	0.13
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.13
155	0.14
156	0.15
157	0.18
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.18
162	0.14
163	0.14
164	0.13
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.13
171	0.14
172	0.16
173	0.15
174	0.16
175	0.16
176	0.16
177	0.19
178	0.19
179	0.19
180	0.19
181	0.17
182	0.16
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.11
187	0.13
188	0.12
189	0.12
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.13
194	0.11
195	0.09
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.04
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.14
212	0.15
213	0.14
214	0.17
215	0.21
216	0.24
217	0.3
218	0.29
219	0.29
220	0.35
221	0.39
222	0.42
223	0.48
224	0.43
225	0.39
226	0.39
227	0.37
228	0.32
229	0.3
230	0.26
231	0.2
232	0.22
233	0.21
234	0.3
235	0.35
236	0.43
237	0.43
238	0.48
239	0.48
240	0.51
241	0.59
242	0.52
243	0.52
244	0.44
245	0.43
246	0.38
247	0.36
248	0.32
249	0.23
250	0.2
251	0.13
252	0.13
253	0.11
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.09
261	0.1
262	0.11
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.06
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.1
287	0.13
288	0.16
289	0.2
290	0.25
291	0.25
292	0.26
293	0.27
294	0.29
295	0.28
296	0.26
297	0.23
298	0.2
299	0.22
300	0.21
301	0.2
302	0.17
303	0.18
304	0.18
305	0.16
306	0.15
307	0.13
308	0.16
309	0.17
310	0.15
311	0.13
312	0.14
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.1
317	0.11
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.1
322	0.14
323	0.14
324	0.15
325	0.16
326	0.17
327	0.18
328	0.19
329	0.19
330	0.2
331	0.2
332	0.2
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.19
337	0.16
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.1
352	0.12
353	0.11
354	0.14
355	0.15
356	0.16
357	0.17
358	0.16
359	0.13
360	0.17
361	0.2
362	0.18
363	0.21
364	0.2
365	0.2
366	0.21
367	0.21
368	0.16
369	0.13
370	0.13
371	0.12
372	0.13
373	0.14
374	0.12
375	0.11
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.06
380	0.09
381	0.1
382	0.15
383	0.18
384	0.2
385	0.21
386	0.21
387	0.21
388	0.2
389	0.21
390	0.18
391	0.25
392	0.32
393	0.32
394	0.35
395	0.4
396	0.41
397	0.42
398	0.43
399	0.36
400	0.3
401	0.32
402	0.34
403	0.34
404	0.32
405	0.3
406	0.29
407	0.28
408	0.32
409	0.3
410	0.28
411	0.24
412	0.23
413	0.21
414	0.19
415	0.18
416	0.11
417	0.13
418	0.12
419	0.16
420	0.18
421	0.2
422	0.22
423	0.25
424	0.28
425	0.32
426	0.37
427	0.37
428	0.36
429	0.35
430	0.34
431	0.31
432	0.28
433	0.21
434	0.15
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.07
439	0.08
440	0.09
441	0.1
442	0.14
443	0.16
444	0.21
445	0.25
446	0.28
447	0.34
448	0.36
449	0.34
450	0.33
451	0.39
452	0.32
453	0.29
454	0.27
455	0.2
456	0.18
457	0.19
458	0.21
459	0.16
460	0.17
461	0.17
462	0.19
463	0.22
464	0.21
465	0.2
466	0.17
467	0.15
468	0.15
469	0.15
470	0.12
471	0.09
472	0.09
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.12
477	0.12
478	0.13
479	0.13
480	0.14
481	0.12
482	0.11
483	0.1
484	0.08
485	0.06
486	0.05
487	0.06
488	0.05
489	0.07
490	0.09
491	0.09
492	0.11
493	0.12
494	0.13
495	0.14
496	0.19
497	0.22
498	0.25
499	0.26
500	0.26
501	0.33
502	0.33
503	0.33
504	0.29
505	0.27
506	0.23
507	0.23
508	0.22
509	0.16
510	0.15
511	0.13
512	0.11
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.06
517	0.05
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.11
525	0.14
526	0.22
527	0.24
528	0.25
529	0.25
530	0.27
531	0.28
532	0.24
533	0.27
534	0.23
535	0.21
536	0.21
537	0.2
538	0.18
539	0.17
540	0.16
541	0.11
542	0.07
543	0.07
544	0.11
545	0.11
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.14
550	0.14
551	0.17
552	0.14
553	0.14
554	0.12
555	0.12
556	0.12
557	0.12
558	0.14
559	0.11
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.02
575	0.02
576	0.02
577	0.02
578	0.03
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.07
583	0.07
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.11
591	0.11
592	0.12
593	0.12
594	0.13
595	0.12
596	0.14
597	0.16
598	0.13
599	0.22
600	0.24
601	0.25
602	0.28
603	0.32
604	0.31
605	0.32
606	0.32
607	0.24
608	0.21
609	0.2
610	0.17
611	0.12
612	0.12
613	0.1
614	0.1
615	0.09
616	0.09
617	0.1
618	0.09
619	0.09
620	0.09
621	0.08
622	0.12
623	0.15
624	0.17
625	0.17
626	0.19
627	0.21
628	0.21
629	0.21
630	0.17
631	0.2
632	0.26
633	0.26
634	0.23
635	0.23
636	0.25
637	0.28
638	0.28
639	0.23
640	0.18
641	0.24
642	0.31
643	0.33
644	0.34
645	0.3
646	0.29
647	0.31
648	0.27
649	0.22
650	0.16
651	0.12
652	0.08
653	0.09
654	0.08
655	0.06
656	0.06
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.06
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.09
665	0.1
666	0.1
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.07
673	0.06
674	0.05
675	0.06
676	0.04
677	0.04
678	0.06
679	0.06
680	0.07
681	0.11
682	0.13
683	0.17
684	0.2
685	0.22
686	0.28
687	0.3
688	0.3
689	0.28
690	0.28
691	0.24
692	0.24
693	0.23
694	0.18
695	0.17
696	0.16
697	0.16
698	0.14
699	0.15
700	0.13
701	0.12
702	0.1
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.11
707	0.14
708	0.16
709	0.16
710	0.18
711	0.19
712	0.19
713	0.19
714	0.17
715	0.2
716	0.19
717	0.21
718	0.26
719	0.27
720	0.29
721	0.38
722	0.4
723	0.4
724	0.4
725	0.38
726	0.36
727	0.38
728	0.35
729	0.28
730	0.32
731	0.32
732	0.32
733	0.36
734	0.35
735	0.37
736	0.42
737	0.47
738	0.47
739	0.48
740	0.51
741	0.52
742	0.49
743	0.49
744	0.46
745	0.39
746	0.32
747	0.25
748	0.25
749	0.26
750	0.25
751	0.22
752	0.26
753	0.3
754	0.33
755	0.37
756	0.4
757	0.35
758	0.42
759	0.5
760	0.51
761	0.57
762	0.6
763	0.63
764	0.67
765	0.71
766	0.69
767	0.65
768	0.66
769	0.59
770	0.56
771	0.5
772	0.42
773	0.37
774	0.32
775	0.27
776	0.19
777	0.17
778	0.14
779	0.13
780	0.11
781	0.14
782	0.16
783	0.15
784	0.16
785	0.18
786	0.17
787	0.19
788	0.24
789	0.24
790	0.25
791	0.27
792	0.27
793	0.31
794	0.35
795	0.35
796	0.33
797	0.32
798	0.37
799	0.4
800	0.42
801	0.36
802	0.34
803	0.34
804	0.32
805	0.33
806	0.3
807	0.24
808	0.24
809	0.26
810	0.25
811	0.24
812	0.23
813	0.21
814	0.18
815	0.2
816	0.21
817	0.22
818	0.23
819	0.24
820	0.24
821	0.22
822	0.21
823	0.19
824	0.16
825	0.13
826	0.11
827	0.09
828	0.08
829	0.08
830	0.08
831	0.08
832	0.08
833	0.07
834	0.06
835	0.09
836	0.1
837	0.11
838	0.11
839	0.11
840	0.1
841	0.1
842	0.13
843	0.12
844	0.1
845	0.1
846	0.14
847	0.15
848	0.17
849	0.23
850	0.22
851	0.24
852	0.3
853	0.33
854	0.32
855	0.37
856	0.41
857	0.43
858	0.46
859	0.45
860	0.42
861	0.38
862	0.37
863	0.32
864	0.27
865	0.2
866	0.15
867	0.14
868	0.1
869	0.1
870	0.08
871	0.08
872	0.06
873	0.05
874	0.05
875	0.06
876	0.06
877	0.07
878	0.07
879	0.07
880	0.12
881	0.13
882	0.13
883	0.14
884	0.14
885	0.18
886	0.22
887	0.25
888	0.28
889	0.29
890	0.3
891	0.34
892	0.39
893	0.36
894	0.39
895	0.46
896	0.44
897	0.46
898	0.5
899	0.51
900	0.55
901	0.63
902	0.64
903	0.55
904	0.53
905	0.54
906	0.5
907	0.45
908	0.38
909	0.28
910	0.22
911	0.23
912	0.28
913	0.26
914	0.34
915	0.4
916	0.46
917	0.55
918	0.63
919	0.67
920	0.66
921	0.73
922	0.76
923	0.77
924	0.72
925	0.67
926	0.61
927	0.59
928	0.52
929	0.43
930	0.33
931	0.24
932	0.21
933	0.16
934	0.17
935	0.17
936	0.17
937	0.18
938	0.17
939	0.18
940	0.19
941	0.2
942	0.22
943	0.2
944	0.22
945	0.2
946	0.22
947	0.21
948	0.21
949	0.21
950	0.18
951	0.19
952	0.23
953	0.29
954	0.34
955	0.4
956	0.42
957	0.42
958	0.41
959	0.38
960	0.34
961	0.31
962	0.25
963	0.19
964	0.17
965	0.19
966	0.22
967	0.25
968	0.25
969	0.26
970	0.26
971	0.28
972	0.26
973	0.25
974	0.21
975	0.2
976	0.21
977	0.2
978	0.2
979	0.21
980	0.22
981	0.2
982	0.25
983	0.31
984	0.35
985	0.42
986	0.41
987	0.42
988	0.48
989	0.48
990	0.44
991	0.42
992	0.36
993	0.34
994	0.37
995	0.35
996	0.29
997	0.34
998	0.33
999	0.33
1000	0.38
1001	0.38
1002	0.45
1003	0.53
1004	0.59
1005	0.58
1006	0.59
1007	0.55
1008	0.5
1009	0.44
1010	0.38
1011	0.34
1012	0.3
1013	0.29
1014	0.28
1015	0.28
1016	0.26
1017	0.26
1018	0.21
1019	0.18
1020	0.14
1021	0.15
1022	0.2
1023	0.22
1024	0.24
1025	0.25
1026	0.27
1027	0.31
1028	0.32
1029	0.34
1030	0.37
1031	0.44
1032	0.53
1033	0.6
1034	0.59
1035	0.61
1036	0.66
1037	0.71
1038	0.72
1039	0.72
1040	0.72
1041	0.75
1042	0.82
1043	0.8
1044	0.76
1045	0.72
1046	0.71
1047	0.69
1048	0.64
1049	0.6
1050	0.55
1051	0.53
1052	0.54
1053	0.5
1054	0.43
1055	0.36
1056	0.31
1057	0.24
1058	0.21
1059	0.19
1060	0.2
1061	0.19
1062	0.23
1063	0.26
1064	0.32
1065	0.41

A0A550C5S7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer