FuNGI

A0A550CJN2

Protein Details

Accession

A0A550CJN2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
947-974	PSNVKSPKTKPAPKPKAAPKRRASRASA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
951-971	KSPKTKPAPKPKAAPKRRASR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001606 ARID_dom IPR036431 ARID_dom_sf IPR021906 BAF250/Osa IPR008626 Mediator_Med15_fun
Gene Ontology	GO:0035060 C:brahma complex GO:0016592 C:mediator complex GO:0016514 C:SWI/SNF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF01388 ARID PF05397 Med15_fungi
PROSITE	View protein in PROSITE PS51011 ARID
CDD	cd16100 ARID

Amino Acid Sequences

MFNNNGAFTPQNMLSNQHQNGQDTNNGMAQLNTAGFTPDQQRMWQQMQMQQQSSGNQFRPQSGAAQDFMPGSMNEMSNLMGNPGFQTRMTPQQQQQLARGFNNGQASPQQMLSMMGMGGSAPANNRNANPMLQAFPQSVPGASRQLDLMAAAQNQQNQNAPLQMQQMLRLQQQQRASISAQSPNVNALRSSMPNNQVGMFTSPPMNPMDPRRTSPVHPQQGSMSGPAGPNPGPSNPHVTLLQYTERLTELRNTIVNLETELRQKTMQRASGGGDGMSEETLQVLSGTLRSRKEHFSRLQALVMRMRSGRMLTEGDGNLAGGPSDGPFATQHGVGSSGPTQGAGPSSSPWMQAGGLGPFGNGAQQSGAQTSPANAAASLPQGSNAPPRSGPTPQLPSAMLSTPQQMNGRLPSGSFSMSPNMSAFQPQSQPQGGASFASGGQPGLSNSFPPPLEKTRFEHIYANFCNKHPDLKRDPRITSVDGRPIDLHKLHVEVNREGGMNKVKANNAWPIIAARLGFASTHATDTEPAKARPDIADHVASCYQECLGLFDTQLYQIMSESRRRDMMSAAASMQGQGIQSAAANSNITLAPGQQIPPLSRLTPQQIQMLLKYAQVPAETLRAQGIDHRLINMVELHRSALQRQQMEQQAFRGGMRPGGAAQNGMQQGPAPPGGMSPDNFAAGAMGRPQNAAQRPPQPGMPAGGVNAIPSPGEIPVDMFVKVMHAIPYSEQQLQQSKMLIDKARNEFQRNGISRMGRKDVPPELQSKLAHLVQQTNRIAALMDEQLPRFFLLIRREDITKGLLSAFTILNRQFQLLGSQSPHFIISVEDLSVTLVKMKECAEVAITQGRMILQRYQQQQRAAGMAANGAPAGPLPPLGLQQNSAQPPLPQQMPPAPLPPRPPVNLQPPPLGKHKKTASTPATSPAAGGATATPPPTTPAITPAQMAASPSNVKSPKTKPAPKPKAAPKRRASRASALTPPSTSQAASTPATEPQTPTTGKRRREDDPAQSPANGPSPPKRAKQEDTGAASFVKPEDEAAKLESKTDAEVAAYLDQMKQLVQQASESDGSSASLNANISEMFDEIMKQGLSVPGASGDGGMDMSAPLDLPDTTAALSSSADDLGSFFDWTAYGTNADVPDDSVAPTPDLLHSSTNTSPESAAGGDQDSASHSGAVEGGAKSEEESDQLLLGIWKDIEGGSESLYHQAAQEWRWDGAMPTSEQPWAISMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.39
3	0.39
4	0.41
5	0.42
6	0.41
7	0.43
8	0.42
9	0.4
10	0.32
11	0.33
12	0.28
13	0.26
14	0.24
15	0.21
16	0.18
17	0.16
18	0.14
19	0.12
20	0.1
21	0.11
22	0.11
23	0.14
24	0.18
25	0.21
26	0.23
27	0.25
28	0.3
29	0.35
30	0.39
31	0.4
32	0.4
33	0.41
34	0.49
35	0.54
36	0.51
37	0.47
38	0.46
39	0.46
40	0.48
41	0.49
42	0.42
43	0.4
44	0.4
45	0.39
46	0.4
47	0.37
48	0.35
49	0.33
50	0.33
51	0.28
52	0.27
53	0.26
54	0.22
55	0.22
56	0.19
57	0.13
58	0.14
59	0.15
60	0.15
61	0.14
62	0.15
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.13
67	0.1
68	0.1
69	0.12
70	0.13
71	0.14
72	0.12
73	0.17
74	0.19
75	0.29
76	0.34
77	0.4
78	0.43
79	0.5
80	0.57
81	0.56
82	0.58
83	0.56
84	0.55
85	0.48
86	0.48
87	0.4
88	0.38
89	0.4
90	0.34
91	0.28
92	0.27
93	0.29
94	0.26
95	0.25
96	0.21
97	0.16
98	0.17
99	0.15
100	0.13
101	0.1
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.06
108	0.07
109	0.11
110	0.14
111	0.17
112	0.18
113	0.22
114	0.24
115	0.24
116	0.26
117	0.25
118	0.25
119	0.24
120	0.26
121	0.23
122	0.22
123	0.24
124	0.21
125	0.19
126	0.17
127	0.19
128	0.21
129	0.2
130	0.2
131	0.17
132	0.17
133	0.16
134	0.15
135	0.14
136	0.13
137	0.13
138	0.15
139	0.16
140	0.21
141	0.22
142	0.23
143	0.25
144	0.23
145	0.24
146	0.24
147	0.23
148	0.21
149	0.23
150	0.26
151	0.23
152	0.25
153	0.28
154	0.29
155	0.32
156	0.37
157	0.37
158	0.38
159	0.41
160	0.42
161	0.39
162	0.39
163	0.37
164	0.34
165	0.35
166	0.35
167	0.34
168	0.32
169	0.3
170	0.31
171	0.32
172	0.27
173	0.23
174	0.2
175	0.21
176	0.22
177	0.26
178	0.29
179	0.31
180	0.33
181	0.34
182	0.32
183	0.29
184	0.29
185	0.27
186	0.21
187	0.18
188	0.19
189	0.17
190	0.18
191	0.2
192	0.2
193	0.2
194	0.27
195	0.35
196	0.35
197	0.39
198	0.44
199	0.45
200	0.47
201	0.54
202	0.57
203	0.58
204	0.56
205	0.54
206	0.49
207	0.51
208	0.48
209	0.38
210	0.28
211	0.2
212	0.19
213	0.19
214	0.2
215	0.15
216	0.16
217	0.17
218	0.19
219	0.19
220	0.21
221	0.28
222	0.26
223	0.28
224	0.26
225	0.26
226	0.26
227	0.26
228	0.28
229	0.22
230	0.21
231	0.19
232	0.2
233	0.18
234	0.18
235	0.19
236	0.18
237	0.19
238	0.2
239	0.2
240	0.2
241	0.22
242	0.2
243	0.17
244	0.18
245	0.17
246	0.2
247	0.21
248	0.21
249	0.21
250	0.23
251	0.29
252	0.33
253	0.35
254	0.32
255	0.33
256	0.34
257	0.35
258	0.33
259	0.25
260	0.19
261	0.15
262	0.14
263	0.12
264	0.09
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.07
273	0.1
274	0.15
275	0.18
276	0.21
277	0.25
278	0.32
279	0.38
280	0.44
281	0.46
282	0.51
283	0.55
284	0.54
285	0.55
286	0.5
287	0.47
288	0.43
289	0.39
290	0.33
291	0.26
292	0.25
293	0.22
294	0.19
295	0.17
296	0.15
297	0.15
298	0.14
299	0.19
300	0.18
301	0.17
302	0.17
303	0.16
304	0.13
305	0.11
306	0.1
307	0.04
308	0.05
309	0.04
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.08
315	0.09
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.11
320	0.1
321	0.12
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.12
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.13
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.05
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.09
366	0.08
367	0.09
368	0.1
369	0.16
370	0.17
371	0.17
372	0.17
373	0.19
374	0.22
375	0.24
376	0.27
377	0.27
378	0.31
379	0.3
380	0.32
381	0.3
382	0.28
383	0.27
384	0.25
385	0.19
386	0.14
387	0.17
388	0.15
389	0.18
390	0.19
391	0.18
392	0.19
393	0.2
394	0.21
395	0.17
396	0.17
397	0.15
398	0.15
399	0.14
400	0.13
401	0.12
402	0.14
403	0.14
404	0.14
405	0.13
406	0.13
407	0.12
408	0.13
409	0.13
410	0.12
411	0.15
412	0.16
413	0.2
414	0.19
415	0.2
416	0.18
417	0.18
418	0.16
419	0.13
420	0.12
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.12
434	0.12
435	0.13
436	0.17
437	0.21
438	0.26
439	0.29
440	0.32
441	0.36
442	0.38
443	0.39
444	0.4
445	0.36
446	0.39
447	0.38
448	0.41
449	0.36
450	0.34
451	0.37
452	0.31
453	0.38
454	0.33
455	0.39
456	0.42
457	0.51
458	0.6
459	0.61
460	0.62
461	0.58
462	0.58
463	0.53
464	0.5
465	0.43
466	0.41
467	0.35
468	0.35
469	0.31
470	0.29
471	0.29
472	0.23
473	0.22
474	0.15
475	0.16
476	0.18
477	0.2
478	0.23
479	0.19
480	0.21
481	0.2
482	0.19
483	0.18
484	0.17
485	0.19
486	0.16
487	0.17
488	0.18
489	0.18
490	0.18
491	0.21
492	0.23
493	0.2
494	0.19
495	0.17
496	0.15
497	0.14
498	0.14
499	0.12
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.09
510	0.1
511	0.11
512	0.16
513	0.16
514	0.16
515	0.18
516	0.18
517	0.19
518	0.18
519	0.19
520	0.16
521	0.16
522	0.18
523	0.16
524	0.18
525	0.18
526	0.17
527	0.15
528	0.13
529	0.1
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.1
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.08
544	0.1
545	0.15
546	0.17
547	0.17
548	0.19
549	0.19
550	0.2
551	0.18
552	0.2
553	0.16
554	0.15
555	0.14
556	0.13
557	0.13
558	0.12
559	0.11
560	0.08
561	0.06
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.05
576	0.06
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.09
582	0.11
583	0.12
584	0.11
585	0.12
586	0.14
587	0.18
588	0.2
589	0.21
590	0.21
591	0.23
592	0.23
593	0.21
594	0.23
595	0.18
596	0.16
597	0.15
598	0.13
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.08
603	0.11
604	0.1
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.11
610	0.13
611	0.13
612	0.13
613	0.13
614	0.13
615	0.13
616	0.14
617	0.13
618	0.11
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.11
623	0.11
624	0.12
625	0.14
626	0.17
627	0.18
628	0.19
629	0.24
630	0.26
631	0.28
632	0.27
633	0.25
634	0.22
635	0.21
636	0.2
637	0.17
638	0.12
639	0.11
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.11
644	0.11
645	0.09
646	0.09
647	0.12
648	0.12
649	0.12
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.07
656	0.06
657	0.06
658	0.08
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.1
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.07
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.14
675	0.16
676	0.18
677	0.2
678	0.26
679	0.29
680	0.3
681	0.31
682	0.27
683	0.25
684	0.25
685	0.21
686	0.15
687	0.11
688	0.12
689	0.1
690	0.09
691	0.08
692	0.07
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.04
697	0.05
698	0.04
699	0.05
700	0.06
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.08
712	0.11
713	0.13
714	0.14
715	0.14
716	0.16
717	0.2
718	0.21
719	0.22
720	0.21
721	0.18
722	0.18
723	0.21
724	0.21
725	0.19
726	0.25
727	0.29
728	0.33
729	0.36
730	0.38
731	0.36
732	0.39
733	0.45
734	0.4
735	0.39
736	0.36
737	0.37
738	0.37
739	0.39
740	0.38
741	0.31
742	0.3
743	0.31
744	0.32
745	0.33
746	0.31
747	0.3
748	0.28
749	0.31
750	0.3
751	0.27
752	0.26
753	0.23
754	0.22
755	0.2
756	0.26
757	0.24
758	0.32
759	0.31
760	0.27
761	0.26
762	0.24
763	0.23
764	0.15
765	0.15
766	0.09
767	0.11
768	0.12
769	0.13
770	0.13
771	0.13
772	0.13
773	0.11
774	0.11
775	0.13
776	0.17
777	0.2
778	0.22
779	0.24
780	0.25
781	0.25
782	0.25
783	0.22
784	0.16
785	0.14
786	0.12
787	0.1
788	0.09
789	0.11
790	0.1
791	0.08
792	0.11
793	0.11
794	0.14
795	0.14
796	0.14
797	0.13
798	0.13
799	0.15
800	0.13
801	0.15
802	0.15
803	0.15
804	0.15
805	0.15
806	0.15
807	0.12
808	0.11
809	0.09
810	0.09
811	0.09
812	0.08
813	0.08
814	0.07
815	0.08
816	0.08
817	0.07
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.1
822	0.1
823	0.12
824	0.12
825	0.12
826	0.11
827	0.11
828	0.12
829	0.15
830	0.14
831	0.12
832	0.12
833	0.13
834	0.13
835	0.14
836	0.16
837	0.17
838	0.24
839	0.31
840	0.38
841	0.42
842	0.43
843	0.44
844	0.41
845	0.39
846	0.33
847	0.26
848	0.19
849	0.16
850	0.13
851	0.1
852	0.08
853	0.06
854	0.06
855	0.05
856	0.05
857	0.04
858	0.04
859	0.05
860	0.05
861	0.07
862	0.09
863	0.1
864	0.11
865	0.13
866	0.2
867	0.21
868	0.21
869	0.2
870	0.19
871	0.22
872	0.25
873	0.25
874	0.19
875	0.21
876	0.24
877	0.27
878	0.28
879	0.31
880	0.3
881	0.32
882	0.36
883	0.38
884	0.38
885	0.37
886	0.41
887	0.42
888	0.48
889	0.52
890	0.5
891	0.52
892	0.5
893	0.51
894	0.55
895	0.57
896	0.48
897	0.5
898	0.53
899	0.53
900	0.54
901	0.6
902	0.56
903	0.53
904	0.53
905	0.49
906	0.46
907	0.38
908	0.34
909	0.25
910	0.2
911	0.14
912	0.13
913	0.08
914	0.08
915	0.09
916	0.09
917	0.09
918	0.08
919	0.11
920	0.12
921	0.13
922	0.12
923	0.15
924	0.18
925	0.19
926	0.19
927	0.17
928	0.17
929	0.16
930	0.17
931	0.13
932	0.13
933	0.14
934	0.14
935	0.21
936	0.22
937	0.23
938	0.29
939	0.33
940	0.4
941	0.49
942	0.58
943	0.61
944	0.71
945	0.79
946	0.79
947	0.84
948	0.85
949	0.86
950	0.85
951	0.86
952	0.83
953	0.84
954	0.86
955	0.83
956	0.78
957	0.76
958	0.74
959	0.7
960	0.67
961	0.6
962	0.53
963	0.47
964	0.42
965	0.35
966	0.29
967	0.23
968	0.17
969	0.16
970	0.18
971	0.18
972	0.18
973	0.17
974	0.19
975	0.22
976	0.22
977	0.21
978	0.2
979	0.25
980	0.25
981	0.28
982	0.36
983	0.41
984	0.48
985	0.53
986	0.55
987	0.54
988	0.62
989	0.66
990	0.66
991	0.66
992	0.64
993	0.59
994	0.55
995	0.52
996	0.45
997	0.4
998	0.32
999	0.27
1000	0.28
1001	0.36
1002	0.41
1003	0.46
1004	0.52
1005	0.55
1006	0.59
1007	0.64
1008	0.65
1009	0.64
1010	0.64
1011	0.58
1012	0.52
1013	0.44
1014	0.39
1015	0.31
1016	0.23
1017	0.16
1018	0.09
1019	0.1
1020	0.11
1021	0.12
1022	0.13
1023	0.15
1024	0.2
1025	0.19
1026	0.2
1027	0.21
1028	0.19
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.15
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.12
1035	0.11
1036	0.11
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.1
1041	0.1
1042	0.1
1043	0.16
1044	0.17
1045	0.17
1046	0.18
1047	0.18
1048	0.22
1049	0.23
1050	0.2
1051	0.15
1052	0.13
1053	0.13
1054	0.13
1055	0.12
1056	0.09
1057	0.1
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.1
1061	0.09
1062	0.09
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.1
1070	0.09
1071	0.08
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.12
1075	0.11
1076	0.11
1077	0.09
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.07
1082	0.06
1083	0.06
1084	0.05
1085	0.05
1086	0.04
1087	0.04
1088	0.04
1089	0.04
1090	0.04
1091	0.05
1092	0.05
1093	0.06
1094	0.07
1095	0.08
1096	0.08
1097	0.09
1098	0.09
1099	0.08
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.09
1103	0.08
1104	0.08
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.09
1108	0.1
1109	0.09
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.1
1116	0.09
1117	0.1
1118	0.13
1119	0.13
1120	0.14
1121	0.13
1122	0.12
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.14
1126	0.13
1127	0.14
1128	0.13
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.13
1132	0.15
1133	0.15
1134	0.15
1135	0.16
1136	0.2
1137	0.22
1138	0.25
1139	0.24
1140	0.23
1141	0.22
1142	0.2
1143	0.2
1144	0.15
1145	0.14
1146	0.12
1147	0.12
1148	0.11
1149	0.11
1150	0.11
1151	0.11
1152	0.13
1153	0.13
1154	0.12
1155	0.1
1156	0.1
1157	0.11
1158	0.11
1159	0.12
1160	0.1
1161	0.11
1162	0.11
1163	0.11
1164	0.11
1165	0.13
1166	0.13
1167	0.11
1168	0.12
1169	0.12
1170	0.11
1171	0.11
1172	0.12
1173	0.11
1174	0.11
1175	0.11
1176	0.1
1177	0.09
1178	0.09
1179	0.09
1180	0.1
1181	0.12
1182	0.12
1183	0.11
1184	0.13
1185	0.14
1186	0.16
1187	0.17
1188	0.15
1189	0.13
1190	0.17
1191	0.2
1192	0.19
1193	0.25
1194	0.25
1195	0.26
1196	0.26
1197	0.26
1198	0.23
1199	0.24
1200	0.27
1201	0.24
1202	0.23
1203	0.24
1204	0.25
1205	0.24
1206	0.23

A0A550CJN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer