Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DE06

Protein Details
Accession C5DE06    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-338LTKKQGKVTKRAPSSKDKKRNRRVKDIELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-334KKQGKVTKRAPSSKDKKRNRRVK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lth:KLTH0C05280g  -  
Amino Acid Sequences MEPAICKSCLGEQERLTRAVNGAECKICTLPFTVYHFKAHHRINRTVICYNCSKQRNVCQCCLLDLQWQIPVELRDRVLSLIQGSEVATHEAQNEMMKRFIALKDGDSFKMGGASITSSASATADALKQIRDTVEAVEKSGKAADAAGPGRDVPLPKNLADLDITHLLKKLPLKGSLSDGTSFFLYNIDPSIPEWAIVDAVTELVGTASWKGPVSASTIINHTARCGGIRFKTLELAQKFIDQVPTFKTEAGSIKGKLLVQNSRIHVVSWSQFNRAALGTKNAECLKLAASLDKLVQKDLNSPAASNTMLTKKQGKVTKRAPSSKDKKRNRRVKDIEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.47
4 0.41
5 0.37
6 0.35
7 0.34
8 0.29
9 0.3
10 0.3
11 0.28
12 0.29
13 0.29
14 0.24
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.21
19 0.28
20 0.34
21 0.34
22 0.4
23 0.41
24 0.44
25 0.49
26 0.52
27 0.52
28 0.52
29 0.56
30 0.58
31 0.63
32 0.63
33 0.62
34 0.55
35 0.52
36 0.51
37 0.48
38 0.49
39 0.47
40 0.46
41 0.46
42 0.55
43 0.61
44 0.62
45 0.63
46 0.6
47 0.56
48 0.55
49 0.5
50 0.41
51 0.36
52 0.32
53 0.28
54 0.26
55 0.26
56 0.22
57 0.21
58 0.22
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.13
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.2
92 0.23
93 0.23
94 0.21
95 0.21
96 0.16
97 0.17
98 0.15
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.16
128 0.13
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.13
142 0.15
143 0.14
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.15
151 0.15
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.15
156 0.16
157 0.18
158 0.16
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.25
163 0.25
164 0.25
165 0.2
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.11
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.16
206 0.18
207 0.19
208 0.19
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.16
216 0.2
217 0.21
218 0.2
219 0.24
220 0.24
221 0.31
222 0.28
223 0.28
224 0.25
225 0.25
226 0.25
227 0.23
228 0.26
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.23
233 0.22
234 0.21
235 0.21
236 0.18
237 0.21
238 0.23
239 0.24
240 0.21
241 0.22
242 0.24
243 0.24
244 0.25
245 0.27
246 0.28
247 0.28
248 0.34
249 0.35
250 0.35
251 0.35
252 0.32
253 0.28
254 0.26
255 0.25
256 0.27
257 0.27
258 0.26
259 0.28
260 0.28
261 0.28
262 0.26
263 0.25
264 0.19
265 0.23
266 0.25
267 0.23
268 0.29
269 0.28
270 0.28
271 0.25
272 0.24
273 0.2
274 0.2
275 0.19
276 0.16
277 0.17
278 0.18
279 0.21
280 0.24
281 0.23
282 0.21
283 0.23
284 0.22
285 0.26
286 0.29
287 0.33
288 0.29
289 0.29
290 0.28
291 0.28
292 0.28
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.24
297 0.27
298 0.33
299 0.34
300 0.42
301 0.49
302 0.5
303 0.54
304 0.61
305 0.68
306 0.71
307 0.76
308 0.74
309 0.78
310 0.83
311 0.84
312 0.85
313 0.86
314 0.87
315 0.89
316 0.94
317 0.92
318 0.92