Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CT01

Protein Details
Accession A0A550CT01    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-97CYAAQHRKGSRKRHAMRPLSEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-93RKGSRKRHAMRP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038446  CEBP_ZZ_sf  
IPR018553  DUF2009  
IPR000315  Znf_B-box  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09418  DUF2009  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50119  ZF_BBOX  
CDD cd20208  Bbox1_DUF2009  
Amino Acid Sequences MDVDPPQANGGALSLENILGEDHETLEHPGLNGKPVGGWDEEATERPVAEGFCIECEDQPAQVHCDTCGDAYCEVCYAAQHRKGSRKRHAMRPLSEQPEKKAKNETGAVAEAATEADEGDSDDEEWVDAAPAPTGEPLGAAPAVGDSVGEWFVERAKYIPLRLTLGERKFLRLLEAALNVSEYTDKIDTIGFGLSKAKRIVQQIRELCAIMSGLLLAADYKQGQELFSDRDFDKNAEFYQRVFELGRRHKIMNPDKMRSTYGKLIYLLQDSQTAEVKDILNFSCVSPIKTVYTVLEEAEATDMLREDMITVATKEIYSEGRARRDIQKDIKAKERAIEQLASRYARDGLTQEQIRQCLYSIGDNHAFLRANRDPCEKMIGYLKQFFQPTQAKDSKSSLAIRSGKGGARLSHDHSKQYAYVLQSLTLWREILHGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.16
17 0.17
18 0.19
19 0.19
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.19
24 0.15
25 0.16
26 0.13
27 0.16
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.16
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.11
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.17
44 0.17
45 0.16
46 0.19
47 0.19
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.17
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.13
65 0.21
66 0.26
67 0.32
68 0.37
69 0.47
70 0.55
71 0.64
72 0.7
73 0.73
74 0.75
75 0.8
76 0.84
77 0.83
78 0.8
79 0.8
80 0.78
81 0.75
82 0.75
83 0.67
84 0.62
85 0.64
86 0.61
87 0.54
88 0.53
89 0.47
90 0.47
91 0.47
92 0.43
93 0.36
94 0.35
95 0.32
96 0.23
97 0.21
98 0.14
99 0.11
100 0.09
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.17
147 0.17
148 0.19
149 0.2
150 0.25
151 0.28
152 0.28
153 0.34
154 0.31
155 0.32
156 0.31
157 0.3
158 0.27
159 0.2
160 0.2
161 0.16
162 0.17
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.11
181 0.11
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.19
186 0.25
187 0.32
188 0.32
189 0.4
190 0.4
191 0.42
192 0.41
193 0.37
194 0.31
195 0.23
196 0.19
197 0.1
198 0.07
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.1
214 0.11
215 0.14
216 0.13
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.13
226 0.15
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.16
231 0.21
232 0.28
233 0.33
234 0.34
235 0.35
236 0.36
237 0.46
238 0.51
239 0.53
240 0.52
241 0.51
242 0.51
243 0.51
244 0.51
245 0.44
246 0.4
247 0.36
248 0.32
249 0.3
250 0.28
251 0.27
252 0.26
253 0.26
254 0.22
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.14
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.12
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.13
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.11
305 0.17
306 0.22
307 0.27
308 0.29
309 0.33
310 0.39
311 0.44
312 0.49
313 0.51
314 0.55
315 0.58
316 0.6
317 0.65
318 0.62
319 0.57
320 0.53
321 0.48
322 0.44
323 0.4
324 0.39
325 0.31
326 0.32
327 0.35
328 0.33
329 0.29
330 0.26
331 0.24
332 0.21
333 0.21
334 0.18
335 0.17
336 0.24
337 0.26
338 0.3
339 0.32
340 0.33
341 0.32
342 0.3
343 0.27
344 0.21
345 0.21
346 0.21
347 0.19
348 0.24
349 0.26
350 0.26
351 0.26
352 0.27
353 0.27
354 0.22
355 0.29
356 0.29
357 0.32
358 0.35
359 0.4
360 0.39
361 0.39
362 0.47
363 0.38
364 0.35
365 0.38
366 0.4
367 0.4
368 0.43
369 0.44
370 0.41
371 0.42
372 0.4
373 0.4
374 0.41
375 0.4
376 0.44
377 0.48
378 0.45
379 0.48
380 0.52
381 0.47
382 0.44
383 0.46
384 0.39
385 0.43
386 0.45
387 0.42
388 0.42
389 0.43
390 0.39
391 0.4
392 0.41
393 0.34
394 0.36
395 0.39
396 0.42
397 0.47
398 0.48
399 0.47
400 0.46
401 0.47
402 0.41
403 0.4
404 0.38
405 0.31
406 0.34
407 0.3
408 0.29
409 0.27
410 0.28
411 0.27
412 0.24
413 0.21
414 0.16