FuNGI

A0A550BXY1

Protein Details

Accession

A0A550BXY1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MEEKRRRKASKLHHMARYND	Basic
80-100	GLGFSQSHKHRRPNAMQRMEQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-7	R

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 6, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0016853 F:isomerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MEEKRRRKASKLHHMARYNDLMTQSDKDFITRIQVSQLVSQDPFNEDFYAQVYAAIVRSRMGLHAQDERVLKFGNVGGVGLGFSQSHKHRRPNAMQRMEQQVERIISNARKREEEKSQHSLHALQGALGKTSGRSYKAAPRQLLQVDSNAASDAHAHISKDDAKESTDAAAEAAKLGREALGIAGESNGVIARKPLSPRDVLIRLEHLYDLVMQAERLNNSRPAEDEEGFTEWQADYDNIRAQLADGIELGVPLEACNPPPFISLLTPTKGKRLLPRLTRHLSTETSLAMVALLVAGFDKLDVVRNAPLLDLPEGTPGQEEVEAQTQGFLMSVMQSLLPIVASLELRLVTGMLSVLVTRTDVPAIARSRPGLALFTLLLSRVEVIREQATSGTIANPPDDDWTSFHTIYAHFVELLLPYLPSLFPSVRRGAGGAETDVMVRTDVIDQPVWQFLAALFILAQGEQTTALLASVRHKVLEEVSVVRKGWVTDEEEAATKINNVNLVLHSLGLDATQISVM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.79
3	0.76
4	0.72
5	0.61
6	0.53
7	0.46
8	0.39
9	0.35
10	0.34
11	0.28
12	0.26
13	0.25
14	0.23
15	0.23
16	0.21
17	0.26
18	0.25
19	0.24
20	0.24
21	0.27
22	0.28
23	0.31
24	0.33
25	0.28
26	0.27
27	0.27
28	0.25
29	0.25
30	0.25
31	0.22
32	0.21
33	0.18
34	0.17
35	0.18
36	0.18
37	0.15
38	0.13
39	0.12
40	0.11
41	0.12
42	0.13
43	0.11
44	0.09
45	0.11
46	0.11
47	0.12
48	0.15
49	0.16
50	0.19
51	0.26
52	0.26
53	0.3
54	0.32
55	0.31
56	0.3
57	0.28
58	0.24
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.14
63	0.13
64	0.11
65	0.1
66	0.11
67	0.09
68	0.08
69	0.05
70	0.06
71	0.12
72	0.18
73	0.27
74	0.34
75	0.44
76	0.52
77	0.62
78	0.72
79	0.77
80	0.82
81	0.81
82	0.8
83	0.76
84	0.77
85	0.69
86	0.59
87	0.5
88	0.44
89	0.36
90	0.31
91	0.27
92	0.23
93	0.27
94	0.33
95	0.38
96	0.36
97	0.4
98	0.43
99	0.48
100	0.53
101	0.56
102	0.57
103	0.58
104	0.59
105	0.55
106	0.54
107	0.49
108	0.4
109	0.35
110	0.27
111	0.2
112	0.21
113	0.19
114	0.18
115	0.16
116	0.15
117	0.11
118	0.15
119	0.16
120	0.15
121	0.16
122	0.2
123	0.29
124	0.38
125	0.44
126	0.43
127	0.41
128	0.45
129	0.46
130	0.46
131	0.37
132	0.3
133	0.25
134	0.24
135	0.22
136	0.16
137	0.14
138	0.1
139	0.1
140	0.09
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.1
145	0.13
146	0.17
147	0.18
148	0.19
149	0.16
150	0.16
151	0.17
152	0.18
153	0.16
154	0.12
155	0.11
156	0.09
157	0.09
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.05
179	0.07
180	0.1
181	0.12
182	0.16
183	0.18
184	0.19
185	0.21
186	0.26
187	0.29
188	0.27
189	0.26
190	0.26
191	0.23
192	0.23
193	0.21
194	0.15
195	0.11
196	0.1
197	0.09
198	0.07
199	0.06
200	0.05
201	0.06
202	0.08
203	0.09
204	0.1
205	0.12
206	0.15
207	0.16
208	0.17
209	0.17
210	0.2
211	0.23
212	0.22
213	0.21
214	0.19
215	0.2
216	0.19
217	0.18
218	0.14
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.06
224	0.08
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.04
239	0.03
240	0.03
241	0.05
242	0.04
243	0.05
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.12
252	0.14
253	0.15
254	0.18
255	0.17
256	0.2
257	0.22
258	0.23
259	0.26
260	0.32
261	0.38
262	0.43
263	0.49
264	0.54
265	0.56
266	0.55
267	0.51
268	0.45
269	0.39
270	0.32
271	0.27
272	0.19
273	0.15
274	0.13
275	0.11
276	0.07
277	0.06
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.02
285	0.02
286	0.03
287	0.03
288	0.06
289	0.06
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.06
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.13
351	0.16
352	0.17
353	0.18
354	0.18
355	0.2
356	0.2
357	0.2
358	0.15
359	0.13
360	0.13
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.07
369	0.08
370	0.07
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.12
385	0.14
386	0.15
387	0.15
388	0.14
389	0.19
390	0.24
391	0.24
392	0.24
393	0.22
394	0.21
395	0.23
396	0.24
397	0.19
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.12
402	0.13
403	0.1
404	0.08
405	0.07
406	0.08
407	0.07
408	0.08
409	0.11
410	0.11
411	0.14
412	0.19
413	0.22
414	0.23
415	0.23
416	0.23
417	0.21
418	0.23
419	0.21
420	0.17
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.09
427	0.07
428	0.07
429	0.09
430	0.11
431	0.13
432	0.14
433	0.14
434	0.16
435	0.18
436	0.17
437	0.15
438	0.13
439	0.1
440	0.13
441	0.12
442	0.11
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.05
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.07
456	0.07
457	0.11
458	0.17
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.2
463	0.21
464	0.23
465	0.22
466	0.21
467	0.25
468	0.28
469	0.28
470	0.27
471	0.27
472	0.24
473	0.24
474	0.23
475	0.24
476	0.23
477	0.25
478	0.26
479	0.26
480	0.26
481	0.23
482	0.2
483	0.17
484	0.16
485	0.16
486	0.16
487	0.16
488	0.17
489	0.18
490	0.21
491	0.19
492	0.17
493	0.15
494	0.13
495	0.12
496	0.1
497	0.09
498	0.06

A0A550BXY1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer