Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C6B7

Protein Details
Accession A0A550C6B7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-214EASVPAKPKRSRHQQQAPTSNAREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-206AKKKRKVEASVPAKPKRSRHQQQ
212-223ARERTPPPSGRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013194  HDAC_interact_dom  
IPR003822  PAH  
IPR036600  PAH_sf  
IPR039774  Sin3-like  
IPR031693  Sin3_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02671  PAH  
PF08295  Sin3_corepress  
PF16879  Sin3a_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51477  PAH  
Amino Acid Sequences MKEFKSQLIDTPGVIKRVSQLFNGHPMLIQGFNTFLPVGYRIECSGDSGITVTTPTGTVMQATDMRWSMEPKPAPPHHPHHAEPQAINYITSIKQSSPDKYLLLMDVLSAASRDPGDLGQYMPDIKAIFKDDPTTAATLQKMLQSDQPFAPENFAALRTSTPVGGGKRKAEREGHASTSSTTQAKKKRKVEASVPAKPKRSRHQQQAPTSNARERTPPPSGRRAAPSAARPVAPPPDDETQFFERVKCTLESRELYNEFLRYINLFTQGHIDSVRLVKECRNLLREDSELLRQLKEIVGWDQRKEDESHMLVPTTHSWTHPQVVNLRPGRVDLSVMYGSYRKLPADEAKVQCSGRDDMCRTVLNDQWVSHATWTNDEDIMAAPLKKNPYEEALHRSEEERHEYDFHIDAIVRTIAMLEPINNKIMQLSVDDRATFKLKPNFGGSGKSVHHRVIKKIYGRAAGAEVIQMMQDQPALAIPVVLQRLKHKEEEWKRAQREWNKVWREVDARNYAKSLDYQGIAVRAADKRATSQKTLVQQIAAAREEQACARACFTDPLFARTRPRHQMEFAVDDAQVLQDALKLTLSFVDRTQAQVPFAERRRIESFLRAFVPLFFMLDPVAFNNAFVVVQETLDSEASEDAVDDDGESVASGGSRASRGRKTAAGDLRKKLLKSEQAKSTGTTRVTRSRGDASPVPGSRLASPAPADDEAFAESAAAQSRKGRKNIFFTNTTFYCLLRLLEIIYTRLALFKSLSMEGDPTQPPPNNFGFSSETMSIAERTTVDHYYDLLLDSCERLFDNEIEQPAFEEQMRFMFGVKNAYKIFTIDKVIGAFVKQVQAILADPKSQELLENLKRERSLASPTVQDQINTRRNAEKILGPDENLFRIDWLHDNKMMTMQLIGKDEPSVDDSEAVADRWHAYLDAYVCGEQTSGVSQAHVRRPFLRSVRGADPMVATDDGLEIRICVRTYRFFYVALTEDVLVRLPRHIDETTKARLGKREELRKAWLERSLAEAPPTAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.28
3 0.27
4 0.34
5 0.36
6 0.31
7 0.34
8 0.35
9 0.44
10 0.45
11 0.39
12 0.32
13 0.31
14 0.3
15 0.26
16 0.22
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.15
27 0.17
28 0.16
29 0.2
30 0.19
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.16
35 0.15
36 0.14
37 0.11
38 0.12
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.19
51 0.18
52 0.2
53 0.21
54 0.24
55 0.24
56 0.3
57 0.32
58 0.33
59 0.42
60 0.46
61 0.51
62 0.55
63 0.6
64 0.61
65 0.64
66 0.62
67 0.62
68 0.64
69 0.63
70 0.56
71 0.52
72 0.5
73 0.44
74 0.41
75 0.31
76 0.27
77 0.23
78 0.25
79 0.22
80 0.16
81 0.22
82 0.26
83 0.3
84 0.31
85 0.33
86 0.31
87 0.31
88 0.32
89 0.27
90 0.23
91 0.18
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.08
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.14
109 0.12
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.14
114 0.17
115 0.18
116 0.19
117 0.22
118 0.21
119 0.23
120 0.24
121 0.24
122 0.21
123 0.22
124 0.22
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.25
131 0.23
132 0.27
133 0.26
134 0.28
135 0.28
136 0.27
137 0.29
138 0.23
139 0.21
140 0.19
141 0.19
142 0.16
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.17
150 0.21
151 0.27
152 0.31
153 0.35
154 0.42
155 0.46
156 0.5
157 0.51
158 0.51
159 0.51
160 0.52
161 0.5
162 0.44
163 0.41
164 0.36
165 0.34
166 0.33
167 0.29
168 0.27
169 0.3
170 0.37
171 0.47
172 0.55
173 0.6
174 0.67
175 0.72
176 0.76
177 0.77
178 0.78
179 0.78
180 0.77
181 0.79
182 0.75
183 0.75
184 0.73
185 0.73
186 0.72
187 0.74
188 0.74
189 0.75
190 0.8
191 0.81
192 0.86
193 0.87
194 0.84
195 0.8
196 0.75
197 0.69
198 0.62
199 0.54
200 0.49
201 0.44
202 0.44
203 0.45
204 0.49
205 0.5
206 0.55
207 0.58
208 0.56
209 0.58
210 0.55
211 0.51
212 0.48
213 0.47
214 0.45
215 0.43
216 0.4
217 0.35
218 0.34
219 0.37
220 0.32
221 0.29
222 0.26
223 0.29
224 0.3
225 0.31
226 0.33
227 0.31
228 0.34
229 0.33
230 0.29
231 0.24
232 0.24
233 0.26
234 0.22
235 0.2
236 0.21
237 0.27
238 0.28
239 0.29
240 0.36
241 0.34
242 0.34
243 0.34
244 0.3
245 0.24
246 0.23
247 0.2
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.19
255 0.19
256 0.19
257 0.17
258 0.16
259 0.13
260 0.15
261 0.17
262 0.14
263 0.15
264 0.17
265 0.23
266 0.28
267 0.31
268 0.32
269 0.31
270 0.33
271 0.36
272 0.33
273 0.3
274 0.27
275 0.25
276 0.27
277 0.27
278 0.24
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.15
285 0.22
286 0.24
287 0.25
288 0.27
289 0.27
290 0.29
291 0.29
292 0.27
293 0.24
294 0.24
295 0.26
296 0.24
297 0.23
298 0.21
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.15
304 0.19
305 0.21
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.28
310 0.31
311 0.39
312 0.38
313 0.36
314 0.32
315 0.31
316 0.29
317 0.23
318 0.21
319 0.12
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.15
327 0.16
328 0.11
329 0.11
330 0.15
331 0.19
332 0.25
333 0.32
334 0.32
335 0.33
336 0.37
337 0.36
338 0.34
339 0.32
340 0.27
341 0.22
342 0.25
343 0.24
344 0.23
345 0.26
346 0.27
347 0.24
348 0.25
349 0.25
350 0.23
351 0.23
352 0.21
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.19
357 0.19
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.13
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.11
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.17
376 0.2
377 0.22
378 0.26
379 0.28
380 0.28
381 0.27
382 0.28
383 0.27
384 0.27
385 0.29
386 0.24
387 0.22
388 0.23
389 0.23
390 0.24
391 0.21
392 0.18
393 0.13
394 0.12
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.18
423 0.23
424 0.23
425 0.25
426 0.28
427 0.3
428 0.29
429 0.31
430 0.25
431 0.24
432 0.24
433 0.24
434 0.23
435 0.22
436 0.28
437 0.27
438 0.31
439 0.33
440 0.37
441 0.39
442 0.41
443 0.41
444 0.37
445 0.35
446 0.31
447 0.25
448 0.2
449 0.16
450 0.12
451 0.09
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.06
466 0.08
467 0.08
468 0.09
469 0.12
470 0.18
471 0.2
472 0.22
473 0.21
474 0.3
475 0.38
476 0.47
477 0.52
478 0.55
479 0.56
480 0.59
481 0.64
482 0.62
483 0.63
484 0.61
485 0.61
486 0.56
487 0.57
488 0.53
489 0.49
490 0.45
491 0.38
492 0.36
493 0.35
494 0.33
495 0.3
496 0.29
497 0.26
498 0.23
499 0.22
500 0.18
501 0.11
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.11
514 0.19
515 0.21
516 0.21
517 0.23
518 0.26
519 0.3
520 0.33
521 0.31
522 0.23
523 0.22
524 0.22
525 0.22
526 0.18
527 0.13
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.1
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.12
539 0.13
540 0.16
541 0.15
542 0.19
543 0.22
544 0.23
545 0.29
546 0.32
547 0.38
548 0.4
549 0.44
550 0.42
551 0.4
552 0.44
553 0.41
554 0.39
555 0.33
556 0.26
557 0.22
558 0.19
559 0.17
560 0.12
561 0.08
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.08
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.11
575 0.11
576 0.13
577 0.16
578 0.14
579 0.14
580 0.14
581 0.17
582 0.22
583 0.25
584 0.29
585 0.26
586 0.31
587 0.34
588 0.36
589 0.35
590 0.35
591 0.34
592 0.31
593 0.32
594 0.27
595 0.24
596 0.21
597 0.22
598 0.14
599 0.13
600 0.09
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.05
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.08
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.06
622 0.05
623 0.06
624 0.05
625 0.05
626 0.04
627 0.05
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.04
640 0.06
641 0.08
642 0.13
643 0.16
644 0.19
645 0.21
646 0.24
647 0.27
648 0.34
649 0.4
650 0.44
651 0.48
652 0.48
653 0.51
654 0.51
655 0.48
656 0.43
657 0.41
658 0.41
659 0.42
660 0.46
661 0.47
662 0.49
663 0.49
664 0.48
665 0.45
666 0.41
667 0.37
668 0.34
669 0.31
670 0.35
671 0.37
672 0.36
673 0.37
674 0.37
675 0.35
676 0.37
677 0.36
678 0.32
679 0.36
680 0.35
681 0.34
682 0.3
683 0.29
684 0.25
685 0.24
686 0.2
687 0.15
688 0.15
689 0.13
690 0.15
691 0.14
692 0.14
693 0.12
694 0.12
695 0.11
696 0.1
697 0.09
698 0.07
699 0.06
700 0.07
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.15
705 0.24
706 0.3
707 0.36
708 0.42
709 0.44
710 0.52
711 0.6
712 0.6
713 0.55
714 0.52
715 0.53
716 0.47
717 0.45
718 0.37
719 0.29
720 0.25
721 0.21
722 0.19
723 0.13
724 0.12
725 0.09
726 0.11
727 0.11
728 0.11
729 0.1
730 0.1
731 0.1
732 0.11
733 0.1
734 0.09
735 0.09
736 0.1
737 0.12
738 0.13
739 0.13
740 0.12
741 0.14
742 0.14
743 0.18
744 0.17
745 0.17
746 0.22
747 0.24
748 0.24
749 0.27
750 0.29
751 0.27
752 0.27
753 0.28
754 0.27
755 0.26
756 0.3
757 0.25
758 0.23
759 0.21
760 0.22
761 0.19
762 0.14
763 0.13
764 0.09
765 0.11
766 0.13
767 0.14
768 0.14
769 0.14
770 0.14
771 0.14
772 0.14
773 0.13
774 0.11
775 0.1
776 0.09
777 0.1
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.09
782 0.11
783 0.12
784 0.15
785 0.17
786 0.19
787 0.19
788 0.18
789 0.18
790 0.16
791 0.17
792 0.14
793 0.11
794 0.1
795 0.11
796 0.13
797 0.11
798 0.11
799 0.14
800 0.14
801 0.23
802 0.23
803 0.27
804 0.26
805 0.27
806 0.27
807 0.25
808 0.27
809 0.21
810 0.23
811 0.19
812 0.19
813 0.18
814 0.19
815 0.17
816 0.15
817 0.13
818 0.12
819 0.14
820 0.12
821 0.12
822 0.11
823 0.12
824 0.12
825 0.16
826 0.15
827 0.15
828 0.15
829 0.16
830 0.17
831 0.16
832 0.16
833 0.14
834 0.22
835 0.26
836 0.33
837 0.34
838 0.36
839 0.37
840 0.36
841 0.36
842 0.3
843 0.31
844 0.28
845 0.29
846 0.29
847 0.31
848 0.35
849 0.33
850 0.31
851 0.29
852 0.34
853 0.39
854 0.38
855 0.39
856 0.39
857 0.4
858 0.43
859 0.4
860 0.35
861 0.32
862 0.37
863 0.35
864 0.31
865 0.35
866 0.33
867 0.32
868 0.28
869 0.23
870 0.16
871 0.16
872 0.17
873 0.2
874 0.23
875 0.26
876 0.28
877 0.29
878 0.29
879 0.31
880 0.3
881 0.23
882 0.2
883 0.19
884 0.19
885 0.22
886 0.21
887 0.18
888 0.19
889 0.18
890 0.18
891 0.17
892 0.16
893 0.13
894 0.14
895 0.13
896 0.15
897 0.16
898 0.14
899 0.12
900 0.11
901 0.11
902 0.11
903 0.11
904 0.09
905 0.09
906 0.12
907 0.13
908 0.15
909 0.15
910 0.15
911 0.14
912 0.14
913 0.14
914 0.1
915 0.1
916 0.09
917 0.1
918 0.1
919 0.11
920 0.16
921 0.23
922 0.32
923 0.36
924 0.37
925 0.39
926 0.43
927 0.51
928 0.53
929 0.54
930 0.5
931 0.52
932 0.54
933 0.54
934 0.51
935 0.44
936 0.39
937 0.31
938 0.3
939 0.23
940 0.18
941 0.13
942 0.13
943 0.12
944 0.11
945 0.1
946 0.07
947 0.08
948 0.12
949 0.12
950 0.14
951 0.17
952 0.24
953 0.3
954 0.36
955 0.37
956 0.35
957 0.35
958 0.37
959 0.36
960 0.31
961 0.27
962 0.2
963 0.19
964 0.19
965 0.2
966 0.17
967 0.14
968 0.15
969 0.16
970 0.17
971 0.21
972 0.22
973 0.24
974 0.29
975 0.35
976 0.39
977 0.43
978 0.45
979 0.44
980 0.5
981 0.53
982 0.56
983 0.6
984 0.64
985 0.66
986 0.68
987 0.71
988 0.72
989 0.71
990 0.66
991 0.62
992 0.53
993 0.46
994 0.48
995 0.45
996 0.39
997 0.35