Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CJL3

Protein Details
Accession A0A550CJL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-201YALSRKVRKHFRAEKKVEQKKRTABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-199RKVRKHFRAEKKVEQKKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MQGFNKYYPPDYDGEKHKSLNAYRGKHALGDRARKLDQGILITRFELPFNIWCGTCNNHIGMGVRYNAEKKKIGNYYSTPIFEFRCKCHLCDGWFKIQTDPKNTRYVVTEGARQKDEEWDPEENGGYAIHDTEGNAAPADPLAALEKTTDAQNHMTKVQQPRLEELEEASERFNADPYALSRKVRKHFRAEKKVEQKKRTADDEIKNRYGLPEELNLASARDDEGTISEAKAAWAKGKRELEQRQSEAAKRRKLGHSQTSISLPASTSLPASSSAKKKGGALDSLRSTILQNTARNSLRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.45
4 0.45
5 0.5
6 0.47
7 0.5
8 0.5
9 0.48
10 0.49
11 0.52
12 0.49
13 0.47
14 0.46
15 0.46
16 0.46
17 0.51
18 0.51
19 0.52
20 0.53
21 0.49
22 0.48
23 0.43
24 0.37
25 0.33
26 0.33
27 0.29
28 0.29
29 0.28
30 0.29
31 0.25
32 0.22
33 0.17
34 0.15
35 0.15
36 0.18
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.2
41 0.22
42 0.24
43 0.23
44 0.2
45 0.19
46 0.2
47 0.21
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.16
52 0.17
53 0.22
54 0.24
55 0.27
56 0.28
57 0.27
58 0.34
59 0.39
60 0.4
61 0.4
62 0.41
63 0.42
64 0.43
65 0.43
66 0.35
67 0.31
68 0.31
69 0.31
70 0.3
71 0.28
72 0.33
73 0.33
74 0.33
75 0.38
76 0.4
77 0.38
78 0.45
79 0.46
80 0.46
81 0.49
82 0.48
83 0.47
84 0.47
85 0.48
86 0.46
87 0.47
88 0.42
89 0.44
90 0.44
91 0.4
92 0.38
93 0.36
94 0.34
95 0.29
96 0.33
97 0.31
98 0.34
99 0.33
100 0.3
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.24
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.16
111 0.14
112 0.11
113 0.08
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.04
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.19
144 0.24
145 0.28
146 0.28
147 0.27
148 0.29
149 0.31
150 0.3
151 0.25
152 0.2
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.14
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.09
165 0.16
166 0.17
167 0.19
168 0.24
169 0.31
170 0.39
171 0.47
172 0.51
173 0.54
174 0.63
175 0.72
176 0.78
177 0.79
178 0.81
179 0.82
180 0.87
181 0.86
182 0.8
183 0.77
184 0.73
185 0.71
186 0.66
187 0.62
188 0.6
189 0.59
190 0.64
191 0.64
192 0.58
193 0.53
194 0.48
195 0.41
196 0.35
197 0.28
198 0.21
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.14
205 0.13
206 0.11
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.11
220 0.15
221 0.21
222 0.23
223 0.31
224 0.36
225 0.41
226 0.48
227 0.56
228 0.59
229 0.62
230 0.63
231 0.61
232 0.6
233 0.61
234 0.62
235 0.62
236 0.59
237 0.55
238 0.59
239 0.6
240 0.65
241 0.68
242 0.68
243 0.67
244 0.63
245 0.62
246 0.58
247 0.52
248 0.44
249 0.35
250 0.25
251 0.19
252 0.17
253 0.14
254 0.12
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.16
259 0.22
260 0.28
261 0.34
262 0.37
263 0.38
264 0.4
265 0.44
266 0.45
267 0.46
268 0.44
269 0.46
270 0.46
271 0.46
272 0.43
273 0.37
274 0.33
275 0.28
276 0.31
277 0.29
278 0.29
279 0.31
280 0.39
281 0.44