Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550C2T2

Protein Details
Accession A0A550C2T2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-109VDPEAKPRKKAPAKKSAKKVTTAEATKEKTVKAKKPKPKPQEKLKPKKAVKAKKPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-107AKPRKKAPAKKSAKKVTTAEATKEKTVKAKKPKPKPQEKLKPKKAVKAKKP
200-208LNARRRKRG
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MFFPSLASVARMRLGALPSTLQTAVRLLPPSYAPGARAFTTTTRIAFLTKTAVDPEAKPRKKAPAKKSAKKVTTAEATKEKTVKAKKPKPKPQEKLKPKKAVKAKKPEPFVVTKDMMPPSRTSARAISLYFQEKYLREGKPSSRTEAQDMMRAGAAEFNQLPESEKLTYSAAAAKLGEERRAAYDEWAKRPDAAKILRTLNARRRKRGQLRLYIPVALRKKTPPNAYTLFVKDFCSGGSQLGRSSVFSAAGAQWKTLPADEKQKYTDRAVLEKERLMKEHLVDNAHAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.2
7 0.2
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.18
13 0.19
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.21
18 0.23
19 0.22
20 0.2
21 0.21
22 0.24
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.2
27 0.24
28 0.24
29 0.21
30 0.2
31 0.2
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.3
43 0.36
44 0.38
45 0.4
46 0.43
47 0.51
48 0.6
49 0.68
50 0.67
51 0.67
52 0.75
53 0.81
54 0.88
55 0.87
56 0.81
57 0.78
58 0.71
59 0.66
60 0.64
61 0.57
62 0.52
63 0.49
64 0.48
65 0.45
66 0.44
67 0.39
68 0.38
69 0.44
70 0.47
71 0.51
72 0.58
73 0.64
74 0.74
75 0.83
76 0.86
77 0.89
78 0.89
79 0.89
80 0.91
81 0.92
82 0.93
83 0.92
84 0.92
85 0.84
86 0.84
87 0.83
88 0.82
89 0.8
90 0.8
91 0.79
92 0.75
93 0.77
94 0.72
95 0.66
96 0.59
97 0.53
98 0.47
99 0.39
100 0.33
101 0.32
102 0.31
103 0.29
104 0.25
105 0.23
106 0.23
107 0.25
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.23
112 0.24
113 0.23
114 0.2
115 0.19
116 0.21
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.2
122 0.24
123 0.21
124 0.2
125 0.24
126 0.27
127 0.33
128 0.35
129 0.36
130 0.35
131 0.35
132 0.36
133 0.38
134 0.34
135 0.3
136 0.28
137 0.24
138 0.19
139 0.18
140 0.15
141 0.11
142 0.1
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.09
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.13
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.13
166 0.14
167 0.15
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.22
172 0.25
173 0.3
174 0.31
175 0.3
176 0.3
177 0.31
178 0.3
179 0.3
180 0.28
181 0.26
182 0.29
183 0.31
184 0.34
185 0.37
186 0.41
187 0.43
188 0.5
189 0.54
190 0.57
191 0.62
192 0.68
193 0.75
194 0.78
195 0.78
196 0.78
197 0.77
198 0.77
199 0.71
200 0.64
201 0.55
202 0.52
203 0.47
204 0.39
205 0.36
206 0.35
207 0.41
208 0.45
209 0.52
210 0.45
211 0.48
212 0.5
213 0.51
214 0.49
215 0.45
216 0.41
217 0.34
218 0.36
219 0.29
220 0.26
221 0.23
222 0.21
223 0.18
224 0.16
225 0.18
226 0.17
227 0.16
228 0.19
229 0.19
230 0.17
231 0.18
232 0.16
233 0.14
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.17
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.19
246 0.3
247 0.33
248 0.37
249 0.41
250 0.47
251 0.49
252 0.49
253 0.5
254 0.43
255 0.45
256 0.48
257 0.5
258 0.48
259 0.48
260 0.52
261 0.5
262 0.48
263 0.46
264 0.43
265 0.38
266 0.4
267 0.4
268 0.35