Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CUW2

Protein Details
Accession A0A550CUW2    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-369EEDLLPRTKRHKPEWRERAENEBasic
374-405TEEVRDGGSRKRRRGRDRPSGGRERGRRRASPBasic
416-435AESRGGRTARRPNKSQQELDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-234RKRKR
381-426GSRKRRRGRDRPSGGRERGRRRASPAGRERDFLPAAESRGGRTARR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDDDETFPTLSYDDPATEDAVPADGLPADDVPAGRSLADRISSSKVYLLSDMGKVRERKREQDSEDSADVEDEEMYMEEDPIIRANAILLCGPPITQLPTARLFAYTTHYDCPPLGLEWVDDETCVLVYESVSKARAAYMRLTRSASNGTDEYVTAKTFPASLWPPEERVNATLGERGIALRAPIRMRWARHEDVKRRNAREESQFYRRYGEDAGKAPYNPDATPPELGRKRKRERDEPDTRRSLLERLDSELDSFLAEGDTEDVAGAVLGPDEVLAQTAIEETALEEPTTGTKMRSDLIAGDGRTLLDRMTTPTALEDRLSSPLPQRTRKQGSVGRMRAWDGPVEEEEDLLPRTKRHKPEWRERAENEVMEFTEEVRDGGSRKRRRGRDRPSGGRERGRRRASPAGRERDFLPAAESRGGRTARRPNKSQQELDDELDAFLNQREA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.25
32 0.24
33 0.23
34 0.23
35 0.22
36 0.19
37 0.22
38 0.24
39 0.24
40 0.29
41 0.34
42 0.39
43 0.47
44 0.51
45 0.55
46 0.61
47 0.68
48 0.67
49 0.71
50 0.71
51 0.67
52 0.62
53 0.55
54 0.46
55 0.36
56 0.3
57 0.2
58 0.14
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.15
84 0.16
85 0.19
86 0.22
87 0.23
88 0.23
89 0.22
90 0.19
91 0.17
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.21
99 0.22
100 0.18
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.04
115 0.05
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.16
124 0.15
125 0.2
126 0.25
127 0.28
128 0.3
129 0.32
130 0.3
131 0.3
132 0.32
133 0.26
134 0.23
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.13
149 0.15
150 0.18
151 0.19
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.22
156 0.2
157 0.2
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.17
173 0.21
174 0.23
175 0.29
176 0.35
177 0.35
178 0.43
179 0.52
180 0.54
181 0.6
182 0.68
183 0.68
184 0.64
185 0.67
186 0.62
187 0.58
188 0.57
189 0.54
190 0.51
191 0.52
192 0.52
193 0.47
194 0.46
195 0.41
196 0.34
197 0.29
198 0.26
199 0.21
200 0.19
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.23
214 0.27
215 0.34
216 0.4
217 0.47
218 0.55
219 0.62
220 0.69
221 0.7
222 0.72
223 0.76
224 0.79
225 0.76
226 0.75
227 0.7
228 0.64
229 0.55
230 0.48
231 0.4
232 0.32
233 0.29
234 0.22
235 0.21
236 0.22
237 0.21
238 0.2
239 0.18
240 0.15
241 0.1
242 0.09
243 0.06
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.13
287 0.16
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.09
295 0.07
296 0.07
297 0.1
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.12
307 0.15
308 0.16
309 0.15
310 0.19
311 0.26
312 0.32
313 0.38
314 0.41
315 0.49
316 0.56
317 0.57
318 0.61
319 0.59
320 0.62
321 0.66
322 0.65
323 0.59
324 0.53
325 0.52
326 0.46
327 0.42
328 0.35
329 0.25
330 0.23
331 0.2
332 0.21
333 0.18
334 0.15
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.21
342 0.29
343 0.37
344 0.46
345 0.55
346 0.62
347 0.73
348 0.8
349 0.83
350 0.83
351 0.77
352 0.76
353 0.7
354 0.62
355 0.52
356 0.44
357 0.35
358 0.28
359 0.26
360 0.18
361 0.15
362 0.13
363 0.11
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.2
368 0.29
369 0.35
370 0.45
371 0.55
372 0.65
373 0.75
374 0.84
375 0.86
376 0.87
377 0.9
378 0.9
379 0.9
380 0.9
381 0.88
382 0.86
383 0.85
384 0.84
385 0.84
386 0.81
387 0.75
388 0.73
389 0.76
390 0.74
391 0.76
392 0.76
393 0.76
394 0.7
395 0.68
396 0.61
397 0.58
398 0.51
399 0.41
400 0.35
401 0.28
402 0.29
403 0.32
404 0.31
405 0.25
406 0.31
407 0.33
408 0.31
409 0.37
410 0.45
411 0.5
412 0.58
413 0.62
414 0.65
415 0.74
416 0.8
417 0.78
418 0.74
419 0.72
420 0.68
421 0.65
422 0.58
423 0.47
424 0.38
425 0.32
426 0.26
427 0.18